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# RNN 变长输入设计
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对变长序列的学习,现有主流框架比如 tensorflow, pytorch, caffe2, mxnet 等均使用了padding的方式,
即将一个mini-batch内不同长度的序列补0到固定长度参与计算。
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5
现有Paddle包括 `RecurrentLayerGroup` 在内的RNN均实现了无padding的变长序列支持,本文也将基于该模块的思路,设计重构后的变长序列支持。
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## 背景介绍
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由于tensor必须有明确的shape,因此基于tensor 的主流框架在存储变长序列时,
必须用zero-padding的方式将变长序列补全为固定shape的tensor。

由于padding是一种框架实现变长序列的妥协, 从用户角度,在使用RNN类模型时自然会比较介意padding的存在,
因此会有pytorch中对非padding方式变长序列支持长篇的讨论[3]。

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fix pr  
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14
由于padding对内存和计算会有额外的消耗,tensorflow和mxnet均使用了bucketing来进行优化[1][2]
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但不管是padding还是bucket,对于用户都是额外的使用负担。

因此,**paddle原生支持变长序列的方式,能直接满足用户对变长序列的最直接的需求,在当前主流平台中可以算是一大优势**

但对变长序列的支持,需要对目前框架做一些修改,下面讨论如何在最小修改下支持变长序列。
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## 多层序列数据格式 `LODTensor`
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目前 Paddle 会将一个mini-batch内的数据存储在一维的内存上,
额外使用 `Argument.sequenceStartPositions` 来存储每个句子的信息。

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25
Paddle里使用 `Argument.subSequenceStartPositions` 来存储2层的序列信息,更高维度的序列则无法直接支持;
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为了支持 `N-level` 序列的存储,本文将序列信息定义成如下数据结构:
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```c++
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std::shared_ptr<std::vector<std::vector<int>>> lod_start_pos_;
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```
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或者更明确的定义
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update  
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```c++
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36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50
typedef std::vector<int> level_t;
std::vector<level_t> lod_start_pos;
```

这里的每一个 `level_t` 存储一个粒度(level)的偏移信息,和paddle目前做法一致。

为了更透明地传递序列信息,我们引入了一种新的tensor 称为 `LODTensor`[4],
其关于tensor相关的接口都直接继承自 `Tensor`,但另外添加了序列相关接口。
如此,在操作一个 `LODTensor` 时,普通 `Op` 直接当成 `Tensor` 使用,
而操作序列的 `Op` 会额外操作 `LODTensor` 的变长序列操作的相关接口。

`LODTensor` 具体定义如下:

```c++
class LODTensor : public Tensor {
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public:
S
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52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74
  size_t Levels() const { return seq_start_positions_.size(); }
  size_t Elements(int level = 0) const {
    return seq_start_positions_[level].size();
  }
  // slice of level[elem_begin: elem_end]
  // NOTE low performance in slice seq_start_positions_.
  // TODO should call Tensor's Slice.
  LODTensor LODSlice(int level, int elem_begin, int elem_end) const;

  // slice with tensor's data shared with this.
  LODTensor LODSliceShared(int level, int elem_begin, int elem_end) const;

  // copy other's lod_start_pos_, to share LOD info.
  // NOTE the LOD info sould not be changed.
  void ShareConstLODFrom(const LODTensor &other) {
    lod_start_pos_ = other.lod_start_pos_;
  }
  // copy other's lod_start_pos_'s content, free to mutate.
  void ShareMutableLODFrom(const LODTensor &other) {
    lod_start_pos_ = std::make_shared <
                     std::vector<std::vector<int>>(other.lod_start_pos_.begin(),
                                                   other.lod_start_pos_.end());
  }
75 76

private:
S
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77
  std::shared_ptr<std::vector<std::vector<int>>> lod_start_pos_;
78
};
S
update  
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```

S
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81 82
其中, `lod_start_pos_` 使用了 `shared_ptr` 来减少存储和复制的代价,
可以认为 `LODTensor``Tensor` 的扩展,几乎完全兼容原始 `Tensor` 的使用。
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84 85 86 87
## 框架支持
### 框架现有的 `Tensor` 调用替换为 `LODTensor`
为了实现 `LODTensor` 的传递,框架里很多 `Tensor` 都需要变成 `LODTensor`
简单实现,直接 **把之前所有的`Tensor` 全部替换成 `LODTensor`,这里可以直接修改 `pybind.cc` 里面创建`Tensor`的接口**
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此外,用户有可能需要感知序列的存在(比如序列的可视化需要解析模型中输出的序列),因此一些序列操作的API也需要暴露到 python 层。

### `lod_start_pos` 随着Op调用链传递
框架需要支持下列特性,以实现`lod_start_pos`的传递:

1.`shared_ptr` 的方式实现传递
    - 不修改 `lod_start_pos` 内容的作为 consumer
    - 修改 `lod_start_pos` 的作为 producer
    - 约定 consumer 只需要复制传递过来的 `shared_ptr`
      - producer 需要创建自己的独立的内存,以存储自己独立的修改,并暴露 `shared_ptr` 给后续 consumer
    - 由于传递过程是以复制`shared_ptr`的方式实现,因此框架只需要传递一次 `lod_start_pos`

2. 对于不感知 `lod_start_pos` 的Op足够透明
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weixing 已提交
102
3. 需要修改 `lod_start_pos` 的producer Op可以在 `Run` 时更新自己的 `lod_start_pos` 数据
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具体的设计分为以下3小节
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105

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#### `load_start_pos` 的传递

- 对于不需要修改 `lod_start_pos` 的情况,调用 LODTensor的 `ShareConstLODFrom` 接口实现复制
- 需要修改的,调用`ShareMutableLODFrom` 接口自己分配内存以存储修改

#### 框架透明
传递这一步需要加入到网络跑之前的初始化操作中,并且只需要初始化一次,基于当前框架设计的初步方案如下

- 在 Op 的 `attrs` 中添加一项 `do_mutate_lod_info` 的属性,默认为 `false`
  - 有需要修改 `lod_start_pos` 的Op需要在定义 `OpProto` 时设置为 `true`
- `OperatorBase``InferShape` 中会读取 `do_mutate_lod_info` ,并且调用 `LODTensor` 相关的方法实现 `lod_start_pos` 的复制。
- `OperatorBase` 中添加一个 member `is_lod_inited{false}` 来保证传递只进行一次

一些逻辑如下
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120

S
update  
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121
```c++
S
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122 123
class OperatorBase {
public:
S
update  
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124
  // ...
S
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125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142
  void InferShape() {
    if (!is_load_inited) {
      bool do_mutate_lod_info = GetAttr<bool>("do_mutate_load_info");
      // find a input having LOD to copy
      auto lod_input = ValidLODInput();
      for (auto &output : outputs) {
        if (do_mutate_load_info) {
          output.ShareMutableLODFrom(lod_input);
        } else {
          output.ShareConstLODFrom(load_input);
        }
      }
      is_pod_inited = true;
    }

    // call op's InferShape
    // ...
  }
S
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143

S
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144 145 146 147
private:
  // ...
  bool is_lod_inited{false};
};
S
update  
Superjom 已提交
148
```
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Superjom 已提交
149

S
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150 151 152 153 154 155 156
如此,`lod_start_pos` 的信息的传递对非OLD的Op的实现是完全透明的。

#### `lod_start_pos` 的更新
上一小节介绍到,对于需要修改 `load_start_pos` 的Op,`OperatorBase` 会分配一块自己的内存以存储修改,
Op在 `Run` 的实现中,操作更新自己的 `load_start_pos`
而所有依赖其 outputs 的 op 会通过共享的指针自动获取到其更新。

S
update2  
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157
## 根据长度排序
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Superjom 已提交
158
按照长度排序后,从前往后的时间步的batch size会自然地递减,可以直接塞入 Net 做batch计算
S
update2  
Superjom 已提交
159

S
Superjom 已提交
160
比如原始的输入:
S
update2  
Superjom 已提交
161 162 163 164 165 166 167 168 169

```
origin:
xxxx
xx
xxx

-> sorted:
xxxx
S
fix pr  
Superjom 已提交
170 171
xxx
xx
S
update2  
Superjom 已提交
172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191
```

经过 `SegmentInputs` 之后,每个会有4个时间步,每个时间步的输入如下(纵向排列)

```
0    1    2    3
x    x    x    x
x    x    x
x    x
```

为了追踪排序前后序列的变化,这里用
```c++
struct SortedSeqItem {
   void *start{nullptr};
   void *end{nullptr};
};

std::vector<SortedSeqItem> sorted_seqs;
```
W
weixing 已提交
192
来追踪序列排序后的位置,并添加一个新的接口
S
Superjom 已提交
193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205

```c++
std::vector<SortedSeqItem> SortBySeqLen(const LODTensor& tensor);
```

由于输入序列的顺序变化,以下现有的接口需要针对性地修改:

- InitMemories, memory需要根据 `sorted_seqs` 重新排列
- SetmentInputs
- ConcatOutputs

此外,由于 `sorted_seqs` 需要被 `RecurrentGradientOp` 复用,因此会变成 `RecurrentOp` 一个新的output输出,
之后作为 `RecurrentGradientOp` 的一个输入传入。
S
update2  
Superjom 已提交
206

S
fix pr  
Superjom 已提交
207 208 209
## InitMemories
由于序列顺序的变化,`boot_memories` 的batch上的element的顺序也需要对应重新排列。

S
update2  
Superjom 已提交
210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222
## SegmentInputs
`SegmentInputs` 会依赖 `sorted_seqs` 的信息,将原始的序列按照排序后的序列顺序,从横向切割,转为每个step中的inputs。

即下面的转变:
```
origin:
xxxx
xx
xxx

   |
   |
  \ /
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fix pr  
Superjom 已提交
223
   !
S
update2  
Superjom 已提交
224 225 226 227 228 229 230 231 232
0    1    2    3
x    x    x    x
x    x    x
x    x
```
## ConcatOutputs
`ConcatOutputs` 需要

- 将每个时间步的输出重新还原为原始输入的序列顺序(以防止Infer阶段顺序打乱)
S
fix pr  
Superjom 已提交
233
- 将每个序列concat 为规则的mini-batch表示
S
update2  
Superjom 已提交
234

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Superjom 已提交
235
## 参考文献
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weixing 已提交
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[Tensorflow Bucketing](https://www.tensorflow.org/versions/r0.12/api_docs/python/contrib.training/bucketing)

[mxnet Bucketing](http://mxnet.io/how_to/bucketing.html)

[variable length input in RNN scenario](https://discuss.pytorch.org/t/about-the-variable-length-input-in-rnn-scenario/345/5)

[Level of details](https://en.wikipedia.org/wiki/Level_of_detail)