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d17ede81
编写于
4月 27, 2020
作者:
H
Huang Zhengjie
提交者:
GitHub
4月 27, 2020
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操作
浏览文件
下载
差异文件
Merge pull request #53 from Liwb5/develop
update README and config for ogb mol graph classification
上级
3c7d3b52
346f3c6d
变更
3
隐藏空白更改
内联
并排
Showing
3 changed file
with
12 addition
and
6 deletion
+12
-6
ogb_examples/graphproppred/mol/README.md
ogb_examples/graphproppred/mol/README.md
+6
-0
ogb_examples/graphproppred/mol/hiv_config.yaml
ogb_examples/graphproppred/mol/hiv_config.yaml
+3
-3
ogb_examples/graphproppred/mol/pcba_config.yaml
ogb_examples/graphproppred/mol/pcba_config.yaml
+3
-3
未找到文件。
ogb_examples/graphproppred/mol/README.md
浏览文件 @
d17ede81
...
...
@@ -24,3 +24,9 @@ python -u main.py --config hiv_config.yaml
export CUDA_VISIBLE_DEVICES=2
python -u main.py --config pcba_config.yaml
```
### Experiment results
| model | hiv (rocauc)| pcba (prcauc)|
|-------|-------------|--------------|
| GIN |0.7719 (0.0079) | 0.2232 (0.0018) |
ogb_examples/graphproppred/mol/hiv_config.yaml
浏览文件 @
d17ede81
task_name
:
hiv
.0423
task_name
:
hiv
use_cuda
:
True
seed
:
1
667
seed
:
1
5391
dataset_name
:
ogbg-molhiv
eval_metrics
:
null
task_type
:
null
...
...
@@ -31,7 +31,7 @@ num_workers: 12
output_dir
:
./outputs/
# trainging config
epoch
:
4
0
epoch
:
5
0
learning_rate
:
0.0001
lr_scheduler
:
linear_warmup_decay
weight_decay
:
0.01
...
...
ogb_examples/graphproppred/mol/pcba_config.yaml
浏览文件 @
d17ede81
task_name
:
pcba
.0423
task_name
:
pcba
use_cuda
:
True
seed
:
1667
seed
:
28994
dataset_name
:
ogbg-molpcba
eval_metrics
:
null
task_type
:
null
...
...
@@ -31,7 +31,7 @@ num_workers: 12
output_dir
:
./outputs/
# trainging config
epoch
:
4
0
epoch
:
5
0
learning_rate
:
0.005
lr_scheduler
:
linear_warmup_decay
weight_decay
:
0.01
...
...
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