提交 69285d97 编写于 作者: jiangfeng08's avatar jiangfeng08

Merge branch 'develop' of https://github.com/baidu/Paddle into MY_COOL_STUFF_BRANCH

......@@ -11,7 +11,7 @@ find_package(Protobuf REQUIRED)
# Check protobuf library version.
execute_process(COMMAND ${PROTOBUF_PROTOC_EXECUTABLE} --version
OUTPUT_VARIABLE PROTOBUF_VERSION)
OUTPUT_VARIABLE PROTOBUF_VERSION)
string(REPLACE "libprotoc " "" PROTOBUF_VERSION ${PROTOBUF_VERSION})
set(PROTOBUF_3 OFF)
......@@ -169,5 +169,4 @@ add_subdirectory(paddle)
add_subdirectory(python)
if(WITH_DOC)
add_subdirectory(doc)
add_subdirectory(doc_cn)
endif()
......@@ -72,6 +72,7 @@ function( Sphinx_add_target target_name builder conf cache source destination )
${source}
${destination}
COMMENT "Generating sphinx documentation: ${builder}"
COMMAND ln -s ${destination}/index_*.html ${destination}/index.html
)
set_property(
......@@ -143,4 +144,4 @@ function( Sphinx_add_targets target_base_name conf source base_destination )
add_dependencies( ${target_base_name}_linkcheck ${_dependencies} )
endif()
endfunction()
\ No newline at end of file
endfunction()
......@@ -119,7 +119,7 @@ function(link_paddle_exe TARGET_NAME)
${RDMA_LD_FLAGS}
${RDMA_LIBS})
endif()
if(WITH_PYTHON)
target_link_libraries(${TARGET_NAME}
${PYTHON_LIBRARIES})
......@@ -136,10 +136,10 @@ function(link_paddle_exe TARGET_NAME)
endif()
if(WITH_GPU)
if(NOT WITH_DSO OR WITH_METRIC)
if(NOT WITH_DSO OR WITH_METRIC)
target_link_libraries(${TARGET_NAME}
${CUDNN_LIBRARY}
${CUDA_curand_LIBRARY})
${CUDA_curand_LIBRARY})
CUDA_ADD_CUBLAS_TO_TARGET(${TARGET_NAME})
endif()
......@@ -206,5 +206,5 @@ function(create_resources res_file output)
# Convert hex data for C compatibility
string(REGEX REPLACE "([0-9a-f][0-9a-f])" "0x\\1," filedata ${filedata})
# Append data to output file
file(APPEND ${output} "const unsigned char ${filename}[] = {${filedata}};\nconst unsigned ${filename}_size = sizeof(${filename});\n")
file(APPEND ${output} "const unsigned char ${filename}[] = {${filedata}0};\nconst unsigned ${filename}_size = sizeof(${filename});\n")
endfunction()
......@@ -7,25 +7,50 @@ if(NOT DEFINED SPHINX_THEME_DIR)
endif()
# configured documentation tools and intermediate build results
set(BINARY_BUILD_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/_build")
set(BINARY_BUILD_DIR_EN "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/en/_build")
# Sphinx cache with pickled ReST documents
set(SPHINX_CACHE_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/_doctrees")
set(SPHINX_CACHE_DIR_EN "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/en/_doctrees")
# HTML output directory
set(SPHINX_HTML_DIR "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/html")
# HTML output director
set(SPHINX_HTML_DIR_EN "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/en/html")
configure_file(
"${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/conf.py.in"
"${BINARY_BUILD_DIR}/conf.py"
"${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/conf.py.en.in"
"${BINARY_BUILD_DIR_EN}/conf.py"
@ONLY)
sphinx_add_target(paddle_docs
html
${BINARY_BUILD_DIR}
${SPHINX_CACHE_DIR}
${BINARY_BUILD_DIR_EN}
${SPHINX_CACHE_DIR_EN}
${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}
${SPHINX_HTML_DIR})
${SPHINX_HTML_DIR_EN})
add_dependencies(paddle_docs
gen_proto_py)
# configured documentation tools and intermediate build results
set(BINARY_BUILD_DIR_CN "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cn/_build")
# Sphinx cache with pickled ReST documents
set(SPHINX_CACHE_DIR_CN "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cn/_doctrees")
# HTML output directory
set(SPHINX_HTML_DIR_CN "${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/cn/html")
configure_file(
"${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/conf.py.cn.in"
"${BINARY_BUILD_DIR_CN}/conf.py"
@ONLY)
sphinx_add_target(paddle_docs_cn
html
${BINARY_BUILD_DIR_CN}
${SPHINX_CACHE_DIR_CN}
${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}
${SPHINX_HTML_DIR_CN})
add_dependencies(paddle_docs_cn
gen_proto_py)
DataProvider的介绍
==================
DataProvider是PaddlePaddle负责提供数据的模块。其作用是将数据传入内存或显存,让神经网络可以进行训练或预测。用户可以通过简单使用Python接口 `PyDataProvider2 <pydataprovider2.html>`_ ,来自定义传数据的过程。如果有更复杂的使用,或者需要更高的效率,用户也可以在C++端自定义一个 ``DataProvider`` 。
DataProvider是PaddlePaddle负责提供数据的模块。其作用是将数据传入内存或显存,让神经网络可以进行训练或预测。用户可以通过简单使用Python接口 `PyDataProvider2 <pydataprovider2.html>`_ ,来自定义传数据的过程。如果有更复杂的使用,或者需要更高的效率,用户也可以在C++端自定义一个 ``DataProvider`` 。
PaddlePaddle需要用户在网络配置(trainer_config.py)中定义使用哪种DataProvider,并且在DataProvider中实现如何访问训练文件列表(train.list)或测试文件列表(test.list)。
- train.list和test.list存放在本地(推荐直接存放到训练目录,以相对路径引用)。一般情况下,两者均为纯文本文件,其中每一行对应一个数据文件地址:
- 如果数据文件存于本地磁盘,这个地址则为它的绝对路径或相对路径(相对于PaddlePaddle程序运行时的路径)。
- 地址也可以为hdfs文件路径,或者数据库连接路径等。
- 由于这个地址会被DataProvider使用,因此,如何解析该地址也是用户自定义DataProvider时需要考虑的地方。
- train.list和test.list存放在本地(推荐直接存放到训练目录,以相对路径引用)。一般情况下,两者均为纯文本文件,其中每一行对应一个数据文件地址:
- 如果数据文件存于本地磁盘,这个地址则为它的绝对路径或相对路径(相对于PaddlePaddle程序运行时的路径)。
- 地址也可以为hdfs文件路径,或者数据库连接路径等。
- 由于这个地址会被DataProvider使用,因此,如何解析该地址也是用户自定义DataProvider时需要考虑的地方。
- 如果没有设置test.list,或设置为None,那么在训练过程中不会执行测试操作;否则,会根据命令行参数指定的测试方式,在训练过程中进行测试,从而防止过拟合。
.. _api_pydataprovider:
.. _api_pydataprovider2:
PyDataProvider2
===============
......@@ -24,18 +24,18 @@ of 28 x 28 pixels.
A small part of the original data as an example is shown as below:
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/mnist_train.txt
.. literalinclude:: src/mnist_train.txt
Each line of the data contains two parts, separated by :code:`;`. The first part is
label of an image. The second part contains 28x28 pixel float values.
Just write path of the above data into train.list. It looks like this:
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/train.list
.. literalinclude:: src/train.list
The corresponding dataprovider is shown as below:
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/mnist_provider.py
.. literalinclude:: src/mnist_provider.dict.py
The first line imports PyDataProvider2 package.
The main function is the process function, that has two parameters.
......@@ -74,7 +74,7 @@ sample by using keywords :code:`yield`.
Only a few lines of codes need to be added into the training configuration file,
you can take this as an example.
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/mnist_config.py
.. literalinclude:: src/mnist_config.py
Here we specify training data by :code:`train.list`, and no testing data is specified.
The method which actually provide data is :code:`process`.
......@@ -83,7 +83,7 @@ User also can use another style to provide data, which defines the
:code:`data_layer`'s name explicitly when `yield`. For example,
the :code:`dataprovider` is shown as below.
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/mnist_provider.dict.py
.. literalinclude:: src/mnist_provider.dict.py
:linenos:
If user did't give the :code:`data_layer`'s name, PaddlePaddle will use
......@@ -104,6 +104,8 @@ And PaddlePadle will do all of the rest things\:
Is this cool?
.. _api_pydataprovider2_sequential_model:
DataProvider for the sequential model
-------------------------------------
A sequence model takes sequences as its input. A sequence is made up of several
......@@ -119,11 +121,11 @@ negative sentiment (marked by 0 and 1 respectively).
A small part of the original data as an example can be found in the path below:
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/sentimental_train.txt
.. literalinclude:: src/sentimental_train.txt
The corresponding data provider can be found in the path below:
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/sentimental_provider.py
.. literalinclude:: src/sentimental_provider.py
This data provider for sequential model is a little more complex than that
for MINST dataset.
......@@ -141,7 +143,7 @@ initialized. The :code:`on_init` function has the following parameters:
To pass these parameters into DataProvider, the following lines should be added
into trainer configuration file.
.. literalinclude:: ../../../doc_cn/ui/data_provider/sentimental_config.py
.. literalinclude:: src/sentimental_config.py
The definition is basically same as MNIST example, except:
* Load dictionary in this configuration
......
API
===
DataProvider API
----------------
.. toctree::
:maxdepth: 1
data_provider/dataprovider_cn.rst
data_provider/pydataprovider2_cn.rst
.. _api_trainer_config:
Model Config API
----------------
.. toctree::
:maxdepth: 1
trainer_config_helpers/optimizers.rst
trainer_config_helpers/data_sources.rst
trainer_config_helpers/layers.rst
trainer_config_helpers/activations.rst
trainer_config_helpers/poolings.rst
trainer_config_helpers/networks.rst
trainer_config_helpers/evaluators.rst
trainer_config_helpers/attrs.rst
Applications API
----------------
.. toctree::
:maxdepth: 1
predict/swig_py_paddle_cn.rst
......@@ -7,7 +7,7 @@ DataProvider API
.. toctree::
:maxdepth: 1
data_provider/index_en.rst
data_provider/dataprovider_en.rst
data_provider/pydataprovider2_en.rst
.. _api_trainer_config:
......
......@@ -34,7 +34,7 @@ PaddlePaddle使用swig对常用的预测接口进行了封装,通过编译会
如下是一段使用mnist model来实现手写识别的预测代码。完整的代码见 ``src_root/doc/ui/predict/predict_sample.py`` 。mnist model可以通过 ``src_root\demo\mnist`` 目录下的demo训练出来。
.. literalinclude:: ../../../doc/ui/predict/predict_sample.py
.. literalinclude:: src/predict_sample.py
:language: python
:lines: 15-18,121-136
......
......@@ -13,7 +13,7 @@ Here is a sample python script that shows the typical prediction process for the
MNIST classification problem. A complete sample code could be found at
:code:`src_root/doc/ui/predict/predict_sample.py`.
.. literalinclude:: ./predict_sample.py
.. literalinclude:: src/predict_sample.py
:language: python
:lines: 15-18,90-100,101-104
......@@ -23,7 +23,7 @@ python's :code:`help()` function. Let's walk through the above python script:
* At the beginning, use :code:`swig_paddle.initPaddle()` to initialize
PaddlePaddle with command line arguments, for more about command line arguments
see `Command Line Arguments <../cmd_argument/detail_introduction.html>`_.
see :ref:`cmd_detail_introduction` .
* Parse the configuration file that is used in training with :code:`parse_config()`.
Because data to predict with always have no label, and output of prediction work
normally is the output layer rather than the cost layer, so you should modify
......@@ -36,7 +36,7 @@ python's :code:`help()` function. Let's walk through the above python script:
- Note: As swig_paddle can only accept C++ matrices, we offer a utility
class DataProviderConverter that can accept the same input data with
PyDataProvider2, for more information please refer to document
of `PyDataProvider2 <../data_provider/pydataprovider2.html>`_.
of :ref:`api_pydataprovider2` .
* Do the prediction with :code:`forwardTest()`, which takes the converted
input data and outputs the activations of the output layer.
......
.. _api_trainer_config_helpers_layers:
======
Layers
======
......
......@@ -62,7 +62,7 @@ source_suffix = ['.rst', '.md', '.Rmd']
source_encoding = 'utf-8'
# The master toctree document.
master_doc = 'index'
master_doc = 'index_cn'
# The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation
# for a list of supported languages.
......@@ -79,7 +79,7 @@ language = 'zh_CN'
# List of patterns, relative to source directory, that match files and
# directories to ignore when looking for source files.
exclude_patterns = ['_build']
exclude_patterns = ['_build', '**/*_en*', '*_en*']
# The reST default role (used for this markup: `text`) to use for all
# documents.
......
......@@ -63,7 +63,7 @@ source_suffix = ['.rst', '.md', '.Rmd']
source_encoding = 'utf-8'
# The master toctree document.
master_doc = 'index'
master_doc = 'index_en'
# The language for content autogenerated by Sphinx. Refer to documentation
# for a list of supported languages.
......@@ -80,7 +80,7 @@ language = None
# List of patterns, relative to source directory, that match files and
# directories to ignore when looking for source files.
exclude_patterns = ['_build']
exclude_patterns = ['_build', '**/*_cn*', '*_cn*']
# The reST default role (used for this markup: `text`) to use for all
# documents.
......@@ -144,6 +144,6 @@ def setup(app):
# no c++ API for now
app.add_config_value('recommonmark_config', {
'url_resolver': lambda url: github_doc_root + url,
'enable_eval_rst': True,
'enable_eval_rst': True,
}, True)
app.add_transform(AutoStructify)
####################
PaddlePaddle常见问题
FAQ
####################
.. contents::
......@@ -33,10 +33,9 @@ PyDataProvider使用的是异步加载,同时在内存里直接随即选取数
个内存池实际上决定了shuffle的粒度。所以,如果将这个内存池减小,又要保证数据是随机的,
那么最好将数据文件在每次读取之前做一次shuffle。可能的代码为
.. literalinclude:: reduce_min_pool_size.py
.. literalinclude:: src/reduce_min_pool_size.py
这样做可以极大的减少内存占用,并且可能会加速训练过程,详细文档参考 `这里
<../ui/data_provider/pydataprovider2.html#provider>`_ 。
这样做可以极大的减少内存占用,并且可能会加速训练过程,详细文档参考 `这里 <../ui/data_provider/pydataprovider2.html#provider>`_ 。
神经元激活内存
++++++++++++++
......@@ -76,7 +75,7 @@ PaddlePaddle支持非常多的优化算法(Optimizer),不同的优化算法需
使用 :code:`pydataprovider`时,可以减少缓存池的大小,同时设置内存缓存功能,即可以极大的加速数据载入流程。
:code:`DataProvider` 缓存池的减小,和之前减小通过减小缓存池来减小内存占用的原理一致。
.. literalinclude:: reduce_min_pool_size.py
.. literalinclude:: src/reduce_min_pool_size.py
同时 :code:`@provider` 接口有一个 :code:`cache` 参数来控制缓存方法,将其设置成 :code:`CacheType.CACHE_PASS_IN_MEM` 的话,会将第一个 :code:`pass` (过完所有训练数据即为一个pass)生成的数据缓存在内存里,在之后的 :code:`pass` 中,不会再从 :code:`python` 端读取数据,而是直接从内存的缓存里读取数据。这也会极大减少数据读入的耗时。
......@@ -90,11 +89,11 @@ PaddlePaddle支持Sparse的训练,sparse训练需要训练特征是 :code:`spa
使用一个词前两个词和后两个词,来预测这个中间的词。这个任务的DataProvider为\:
.. literalinclude:: word2vec_dataprovider.py
.. literalinclude:: src/word2vec_dataprovider.py
这个任务的配置为\:
.. literalinclude:: word2vec_config.py
.. literalinclude:: src/word2vec_config.py
更多关于sparse训练的内容请参考 `sparse训练的文档 <TBD>`_
......@@ -158,7 +157,7 @@ PaddlePaddle的参数使用名字 :code:`name` 作为参数的ID,相同名字
这里 :code:`hidden_a` 和 :code:`hidden_b` 使用了同样的parameter和bias。并且softmax层的两个输入也使用了同样的参数 :code:`softmax_param`。
7. *-cp27mu-linux_x86_64.whl is not a supported wheel on this platform.
-----------------------------------------------------------------------
---------------------------------------------------------------------------
出现这个问题的主要原因是,系统编译wheel包的时候,使用的 :code:`wheel` 包是最新的,
而系统中的 :code:`pip` 包比较老。具体的解决方法是,更新 :code:`pip` 包并重新编译PaddlePaddle。
......@@ -220,7 +219,7 @@ PaddlePaddle的参数使用名字 :code:`name` 作为参数的ID,相同名字
10. CMake源码编译, 找到的PythonLibs和PythonInterp版本不一致
----------------------------------------------------------
----------------------------------------------------------------
这是目前CMake寻找Python的逻辑存在缺陷,如果系统安装了多个Python版本,CMake找到的Python库和Python解释器版本可能有不一致现象,导致编译PaddlePaddle失败。正确的解决方法是,
用户强制指定特定的Python版本,具体操作如下:
......@@ -231,7 +230,7 @@ PaddlePaddle的参数使用名字 :code:`name` 作为参数的ID,相同名字
用户需要指定本机上Python的路径:``<exc_path>``, ``<lib_path>``, ``<inc_path>``
10. A protocol message was rejected because it was too big
10. A protocol message was rejected because it was too big
----------------------------------------------------------
如果在训练NLP相关模型时,出现以下错误:
......
......@@ -58,6 +58,7 @@ PaddlePaddle是源于百度的一个深度学习平台。这份简短的介绍
cost = regression_cost(input= ȳ, label=y)
outputs(cost)
这段简短的配置展示了PaddlePaddle的基本用法:
- 第一部分定义了数据输入。一般情况下,PaddlePaddle先从一个文件列表里获得数据文件地址,然后交给用户自定义的函数(例如上面的 `process`函数)进行读入和预处理从而得到真实输入。本文中由于输入数据是随机生成的不需要读输入文件,所以放一个空列表(`empty.list`)即可。
......@@ -65,10 +66,10 @@ PaddlePaddle是源于百度的一个深度学习平台。这份简短的介绍
- 第二部分主要是选择学习算法,它定义了模型参数改变的规则。PaddlePaddle提供了很多优秀的学习算法,这里使用一个基于momentum的随机梯度下降(SGD)算法,该算法每批量(batch)读取12个采样数据进行随机梯度计算来更新更新。
- 最后一部分是神经网络的配置。由于PaddlePaddle已经实现了丰富的网络层,所以很多时候你需要做的只是定义正确的网络层并把它们连接起来。这里使用了三种网络单元:
- **数据层**:数据层 `data_layer` 是神经网络的入口,它读入数据并将它们传输到接下来的网络层。这里数据层有两个,分别对应于变量 `x` 和 `y`。
- **全连接层**:全连接层 `fc_layer` 是基础的计算单元,这里利用它建模变量之间的线性关系。计算单元是神经网络的核心,PaddlePaddle支持大量的计算单元和任意深度的网络连接,从而可以拟合任意的函数来学习复杂的数据关系。
- **回归误差代价层**:回归误差代价层 `regression_cost` 是众多误差代价函数层的一种,它们在训练过程作为网络的出口,用来计算模型的误差,是模型参数优化的目标函数。
- **数据层**:数据层 `data_layer` 是神经网络的入口,它读入数据并将它们传输到接下来的网络层。这里数据层有两个,分别对应于变量 `x` 和 `y`。
- **全连接层**:全连接层 `fc_layer` 是基础的计算单元,这里利用它建模变量之间的线性关系。计算单元是神经网络的核心,PaddlePaddle支持大量的计算单元和任意深度的网络连接,从而可以拟合任意的函数来学习复杂的数据关系。
- **回归误差代价层**:回归误差代价层 `regression_cost` 是众多误差代价函数层的一种,它们在训练过程作为网络的出口,用来计算模型的误差,是模型参数优化的目标函数。
定义了网络结构并保存为 `trainer_config.py` 之后,运行以下训练命令:
......@@ -99,8 +100,8 @@ PaddlePaddle将每个模型参数作为一个numpy数组单独存为一个文件
# w=1.999743, b=0.300137
.. image:: ./parameters.png
:align: center
:scale: 80 %
:align: center
:scale: 80 %
从图中可以看到,虽然 `w` 和 `b` 都使用随机值初始化,但在起初的几轮训练中它们都在快速逼近真实值,并且后续仍在不断改进,使得最终得到的模型几乎与真实模型一致。
......
......@@ -99,11 +99,3 @@ In PaddlePaddle, training is just to get a collection of model parameters, which
Although starts from a random guess, you can see that value of ``w`` changes quickly towards 2 and ``b`` changes quickly towards 0.3. In the end, the predicted line is almost identical with real answer.
There, you have recovered the underlying pattern between ``X`` and ``Y`` only from observed data.
5. Where to Go from Here
-------------------------
- `Install and Build <../build_and_install/index.html>`_
- `Tutorials <../demo/quick_start/index_en.html>`_
- `Example and Demo <../demo/index.html>`_
PaddlePaddle的编译选项
======================
PaddlePaddle的编译选项,包括生成CPU/GPU二进制文件、链接何种BLAS库等。用户可在调用cmake的时候设置它们,详细的cmake使用方法可以参考 `官方文档 <https://cmake.org/cmake-tutorial>`_ 。
Bool型的编译选项
----------------
用户可在cmake的命令行中,通过使用 ``-D`` 命令设置该类编译选项,例如
.. code-block:: bash
cmake .. -DWITH_GPU=OFF
.. csv-table:: Bool型的编译选项
:widths: 1, 7, 2
:file: compile_options.csv
BLAS/CUDA/Cudnn的编译选项
--------------------------
BLAS
+++++
PaddlePaddle支持以下任意一种BLAS库:`MKL <https://software.intel.com/en-us/intel-mkl>`_ ,`ATLAS <http://math-atlas.sourceforge.net/>`_ ,`OpenBlAS <http://www.openblas.net/>`_ 和 `REFERENCE BLAS <http://www.netlib.org/blas/>`_ 。
.. csv-table:: BLAS路径相关的编译选项
:widths: 1, 2, 7
:file: cblas_settings.csv
CUDA/Cudnn
+++++++++++
PaddlePaddle可以使用cudnn v2之后的任何一个版本来编译运行,但尽量请保持编译和运行使用的cudnn是同一个版本。 我们推荐使用最新版本的cudnn v5.1。
编译选项的设置
++++++++++++++
PaddePaddle通过编译时指定路径来实现引用各种BLAS/CUDA/Cudnn库。cmake编译时,首先在系统路径(/usr/lib\:/usr/local/lib)中搜索这几个库,同时也会读取相关路径变量来进行搜索。 通过使用 ``-D`` 命令可以设置,例如
.. code-block:: bash
cmake .. -DMKL_ROOT=/opt/mkl/ -DCUDNN_ROOT=/opt/cudnnv5
PaddlePaddle的编译选项
======================
PaddlePaddle的编译选项,包括生成CPU/GPU二进制文件、链接何种BLAS库等。用户可在调用cmake的时候设置它们,详细的cmake使用方法可以参考 `官方文档 <https://cmake.org/cmake-tutorial>`_ 。
Bool型的编译选项
----------------
用户可在cmake的命令行中,通过使用 ``-D`` 命令设置该类编译选项,例如
.. code-block:: bash
cmake .. -DWITH_GPU=OFF
.. csv-table:: Bool型的编译选项
:widths: 1, 7, 2
:file: compile_options.csv
BLAS/CUDA/Cudnn的编译选项
--------------------------
BLAS
+++++
PaddlePaddle支持以下任意一种BLAS库:`MKL <https://software.intel.com/en-us/intel-mkl>`_ ,`ATLAS <http://math-atlas.sourceforge.net/>`_ ,`OpenBlAS <http://www.openblas.net/>`_ 和 `REFERENCE BLAS <http://www.netlib.org/blas/>`_ 。
.. csv-table:: BLAS路径相关的编译选项
:widths: 1, 2, 7
:file: cblas_settings.csv
CUDA/Cudnn
+++++++++++
PaddlePaddle可以使用cudnn v2之后的任何一个版本来编译运行,但尽量请保持编译和运行使用的cudnn是同一个版本。 我们推荐使用最新版本的cudnn v5.1。
编译选项的设置
++++++++++++++
PaddePaddle通过编译时指定路径来实现引用各种BLAS/CUDA/Cudnn库。cmake编译时,首先在系统路径(/usr/lib\:/usr/local/lib)中搜索这几个库,同时也会读取相关路径变量来进行搜索。 通过使用 ``-D`` 命令可以设置,例如
.. code-block:: bash
cmake .. -DMKL_ROOT=/opt/mkl/ -DCUDNN_ROOT=/opt/cudnnv5
注意:这几个编译选项的设置,只在第一次cmake的时候有效。如果之后想要重新设置,推荐清理整个编译目录(``rm -rf``)后,再指定。
\ No newline at end of file
选项,说明,默认值
WITH_GPU,是否支持GPU。,取决于是否寻找到CUDA工具链
WITH_DOUBLE,是否使用双精度浮点数。,否
WITH_DSO,是否运行时动态加载CUDA动态库,而非静态加载CUDA动态库。,是
WITH_AVX,是否编译含有AVX指令集的PaddlePaddle二进制文件,是
WITH_PYTHON,是否内嵌PYTHON解释器。方便今后的嵌入式移植工作。,是
WITH_STYLE_CHECK,是否编译时进行代码风格检查,是
WITH_RDMA,是否开启RDMA,否
WITH_GLOG,是否开启GLOG。如果不开启,则会使用一个简化版的日志,同时方便今后的嵌入式移植工作。,取决于是否寻找到GLOG
WITH_GFLAGS,是否使用GFLAGS。如果不开启,则会使用一个简化版的命令行参数解析器,同时方便今后的嵌入式移植工作。,取决于是否寻找到GFLAGS
WITH_TIMER,是否开启计时功能。如果开启会导致运行略慢,打印的日志变多,但是方便调试和测Benchmark,否
WITH_TESTING,是否开启单元测试,取决于是否寻找到GTEST
WITH_DOC,是否编译中英文文档,否
选项,说明,默认值
WITH_GPU,是否支持GPU。,取决于是否寻找到CUDA工具链
WITH_DOUBLE,是否使用双精度浮点数。,否
WITH_DSO,是否运行时动态加载CUDA动态库,而非静态加载CUDA动态库。,是
WITH_AVX,是否编译含有AVX指令集的PaddlePaddle二进制文件,是
WITH_PYTHON,是否内嵌PYTHON解释器。方便今后的嵌入式移植工作。,是
WITH_STYLE_CHECK,是否编译时进行代码风格检查,是
WITH_RDMA,是否开启RDMA,否
WITH_GLOG,是否开启GLOG。如果不开启,则会使用一个简化版的日志,同时方便今后的嵌入式移植工作。,取决于是否寻找到GLOG
WITH_GFLAGS,是否使用GFLAGS。如果不开启,则会使用一个简化版的命令行参数解析器,同时方便今后的嵌入式移植工作。,取决于是否寻找到GFLAGS
WITH_TIMER,是否开启计时功能。如果开启会导致运行略慢,打印的日志变多,但是方便调试和测Benchmark,否
WITH_TESTING,是否开启单元测试,取决于是否寻找到GTEST
WITH_DOC,是否编译中英文文档,否
WITH_SWIG_PY,是否编译PYTHON的SWIG接口,该接口可用于预测和定制化训练,取决于是否寻找到SWIG
\ No newline at end of file
......@@ -111,7 +111,24 @@ cuda相关的Driver和设备映射进container中,脚本类似于
简单的含有ssh的Dockerfile如下:
.. literalinclude:: paddle_ssh.Dockerfile
.. code-block:: bash
FROM paddledev/paddle:cpu-latest
MAINTAINER PaddlePaddle dev team <paddle-dev@baidu.com>
RUN apt-get update
RUN apt-get install -y openssh-server
RUN mkdir /var/run/sshd
RUN echo 'root:root' | chpasswd
RUN sed -ri 's/^PermitRootLogin\s+.*/PermitRootLogin yes/' /etc/ssh/sshd_config
RUN sed -ri 's/UsePAM yes/#UsePAM yes/g' /etc/ssh/sshd_config
EXPOSE 22
CMD ["/usr/sbin/sshd", "-D"]
使用该Dockerfile构建出镜像,然后运行这个container即可。相关命令为\:
......
......@@ -17,7 +17,7 @@ CPU-only one and a CUDA GPU one. We do so by configuring
`dockerhub.com <https://hub.docker.com/r/paddledev/paddle/>`_
automatically runs the following commands:
.. code-block:: base
.. code-block:: bash
docker build -t paddle:cpu -f paddle/scripts/docker/Dockerfile .
docker build -t paddle:gpu -f paddle/scripts/docker/Dockerfile.gpu .
......
......@@ -9,8 +9,8 @@ PaddlePaddle提供数个预编译的二进制来进行安装,包括Docker镜
.. toctree::
:maxdepth: 1
install/docker_install.rst
install/ubuntu_install.rst
docker_install_cn.rst
ubuntu_install_cn.rst
......@@ -19,9 +19,9 @@ PaddlePaddle提供数个预编译的二进制来进行安装,包括Docker镜
.. warning::
编译选项主要推荐高级用户查看,普通用户请走安装流程。
编译选项主要推荐高级用户查看,普通用户请走安装流程。
.. toctree::
:maxdepth: 1
.. toctree::
:maxdepth: 1
cmake/index.rst
cmake/build_from_source_cn.rst
\ No newline at end of file
......@@ -38,7 +38,20 @@ PaddlePaddle提供了ubuntu 14.04 deb安装包。
安装完成后,可以使用命令 :code:`paddle version` 查看安装后的paddle 版本:
.. literalinclude:: paddle_version.txt
.. code-block:: shell
PaddlePaddle 0.8.0b1, compiled with
with_avx: ON
with_gpu: OFF
with_double: OFF
with_python: ON
with_rdma: OFF
with_glog: ON
with_gflags: ON
with_metric_learning:
with_timer: OFF
with_predict_sdk:
可能遇到的问题
--------------
......@@ -48,9 +61,9 @@ libcudart.so/libcudnn.so找不到
安装完成后,运行 :code:`paddle train` 报错\:
.. code-block:: shell
.. code-block:: shell
0831 12:36:04.151525 1085 hl_dso_loader.cc:70] Check failed: nullptr != *dso_handle For Gpu version of PaddlePaddle, it couldn't find CUDA library: libcudart.so Please make sure you already specify its path.Note: for training data on Cpu using Gpu version of PaddlePaddle,you must specify libcudart.so via LD_LIBRARY_PATH.
0831 12:36:04.151525 1085 hl_dso_loader.cc:70] Check failed: nullptr != *dso_handle For Gpu version of PaddlePaddle, it couldn't find CUDA library: libcudart.so Please make sure you already specify its path.Note: for training data on Cpu using Gpu version of PaddlePaddle,you must specify libcudart.so via LD_LIBRARY_PATH.
原因是未设置cuda运行时环境变量。 如果使用GPU版本的PaddlePaddle,请安装CUDA 7.5 和CUDNN 5到本地环境中,并设置:
......
GET STARTED
============
.. toctree::
:maxdepth: 2
build_and_install/index_cn.rst
basic_usage/index_cn.rst
```eval_rst
.. _cmd_detail_introduction:
```
# Detail Description
## Common
......
```eval_rst
.. _cmd_line_index_en:
.. _cmd_line_index:
```
# How to Set Command-line Parameters
......
......@@ -8,29 +8,29 @@ PaddlePaddle是一个深度学习框架,支持单机模式和多机模式。
本文首先介绍trainer进程中的一些使用概念,然后介绍pserver进程中概念。
.. contents::
.. contents::
系统框图
========
下图描述了用户使用框图,PaddlePaddle的trainer进程里内嵌了Python解释器,trainer进程可以利用这个解释器执行Python脚本,Python脚本里定义了模型配置、训练算法、以及数据读取函数。其中,数据读取程序往往定义在一个单独Python脚本文件里,被称为数据提供器(DataProvider),通常是一个Python函数。模型配置、训练算法通常定义在另一单独Python文件中, 称为训练配置文件。下面将分别介绍这两部分。
.. graphviz::
digraph pp_process {
rankdir=LR;
config_file [label="用户神经网络配置"];
subgraph cluster_pp {
style=filled;
color=lightgrey;
node [style=filled, color=white, shape=box];
label = "PaddlePaddle C++";
py [label="Python解释器"];
}
data_provider [label="用户数据解析"];
config_file -> py;
py -> data_provider [dir="back"];
}
.. graphviz::
digraph pp_process {
rankdir=LR;
config_file [label="用户神经网络配置"];
subgraph cluster_pp {
style=filled;
color=lightgrey;
node [style=filled, color=white, shape=box];
label = "PaddlePaddle C++";
py [label="Python解释器"];
}
data_provider [label="用户数据解析"];
config_file -> py;
py -> data_provider [dir="back"];
}
数据提供器
==========
......@@ -47,7 +47,7 @@ DataProvider是PaddlePaddle系统的数据提供器,将用户的原始数据
一个简单的训练配置文件为:
.. literalinclude:: trainer_config.py
.. literalinclude:: src/trainer_config.py
:linenos:
文件开头 ``from paddle.trainer_config_helpers import *`` ,是因为PaddlePaddle配置文件与C++模块通信的最基础协议是protobuf,为了避免用户直接写复杂的protobuf string,我们为用户定以Python接口来配置网络,该Python代码可以生成protobuf包,这就是`trainer_config_helpers`_的作用。因此,在文件的开始,需要import这些函数。 这个包里面包含了模型配置需要的各个模块。
......@@ -100,11 +100,11 @@ DataProvider是PaddlePaddle系统的数据提供器,将用户的原始数据
例如,和 ``fc_layer`` 同样功能的 ``mixed_layer`` 是:
.. code-block:: python
.. code-block:: python
data = data_layer(name='data', size=200)
with mixed_layer(size=200) as out:
out += full_matrix_projection(input=data)
data = data_layer(name='data', size=200)
with mixed_layer(size=200) as out:
out += full_matrix_projection(input=data)
PaddlePaddle 可以使用 ``mixed layer`` 配置出非常复杂的网络,甚至可以直接配置一个完整的LSTM。用户可以参考 `mixed_layer`_ 的相关文档进行配置。
......@@ -114,13 +114,13 @@ PaddlePaddle 可以使用 ``mixed layer`` 配置出非常复杂的网络,甚
PaddlePaddle多机采用经典的 Parameter Server 架构对多个节点的 trainer 进行同步。多机训练的经典拓扑结构如下\:
.. graphviz:: pserver_topology.dot
.. graphviz:: src/pserver_topology.dot
图中每个灰色方块是一台机器,在每个机器中,先使用命令 ``paddle pserver`` 启动一个pserver进程,并指定端口号,可能的参数是\:
.. code-block:: bash
.. code-block:: bash
paddle pserver --port=5000 --num_gradient_servers=4 --tcp_rdma='tcp' --nics='eth0'
paddle pserver --port=5000 --num_gradient_servers=4 --tcp_rdma='tcp' --nics='eth0'
* ``--port=5000`` : 指定 pserver 进程端口是 5000 。
* ``--gradient_servers=4`` : 有四个训练进程(PaddlePaddle 将 trainer 也称作 GradientServer ,因为其为负责提供Gradient) 。
......@@ -128,9 +128,9 @@ PaddlePaddle多机采用经典的 Parameter Server 架构对多个节点的 trai
启动之后 pserver 进程之后,需要启动 trainer 训练进程,在各个机器上运行如下命令\:
.. code-block:: bash
.. code-block:: bash
paddle train --port=5000 --pservers=192.168.100.101,192.168.100.102,192.168.100.103,192.168.100.104 --config=...
paddle train --port=5000 --pservers=192.168.100.101,192.168.100.102,192.168.100.103,192.168.100.104 --config=...
对于简单的多机协同训练使用上述方式即可。另外,pserver/train 通常在高级情况下,还需要设置下面两个参数\:
......
How to Configure Deep Models
============================
.. toctree::
:maxdepth: 1
rnn/recurrent_group_cn.md
rnn/hierarchical_layer_cn.rst
rnn/hrnn_rnn_api_compare_cn.rst
rnn/hrnn_demo_cn.rst
......@@ -24,18 +24,18 @@
- 本例中的原始数据一共有10个样本。每个样本由两部分组成,一个label(此处都为2)和一个已经分词后的句子。这个数据也被单层RNN网络直接使用。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/Sequence/tour_train_wdseg
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/Sequence/tour_train_wdseg
:language: text
- 双层序列数据一共有4个样本。 每个样本间用空行分开,整体数据和原始数据完全一样。但于双层序列的LSTM来说,第一个样本同时encode两条数据成两个向量。这四条数据同时处理的句子数量为\ :code:`[2, 3, 2, 3]`\ 。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/Sequence/tour_train_wdseg.nest
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/Sequence/tour_train_wdseg.nest
:language: text
其次,对于两种不同的输入数据类型,不同DataProvider对比如下(`sequenceGen.py <https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/gserver/tests/sequenceGen.py>`_)\:
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequenceGen.py
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequenceGen.py
:language: python
:lines: 21-39
:linenos:
......@@ -43,10 +43,11 @@
- 这是普通的单层时间序列的DataProvider代码,其说明如下:
* DataProvider共返回两个数据,分别是words和label。即上述代码中的第19行。
- words是原始数据中的每一句话,所对应的词表index数组。它是integer_value_sequence类型的,即整数数组。words即为这个数据中的单层时间序列。
- label是原始数据中对于每一句话的分类标签,它是integer_value类型的。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequenceGen.py
- words是原始数据中的每一句话,所对应的词表index数组。它是integer_value_sequence类型的,即整数数组。words即为这个数据中的单层时间序列。
- label是原始数据中对于每一句话的分类标签,它是integer_value类型的。
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequenceGen.py
:language: python
:lines: 42-71
:linenos:
......@@ -63,7 +64,7 @@
首先,我们看一下单层RNN的配置。代码中9-15行(高亮部分)即为单层RNN序列的使用代码。这里使用了PaddlePaddle预定义好的RNN处理函数。在这个函数中,RNN对于每一个时间步通过了一个LSTM网络。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequence_layer_group.conf
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequence_layer_group.conf
:language: python
:lines: 38-63
:linenos:
......@@ -84,7 +85,7 @@
* 至此,\ :code:`lstm_last`\ 便和单层RNN配置中的\ :code:`lstm_last`\ 具有相同的结果了。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequence_nest_layer_group.conf
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequence_nest_layer_group.conf
:language: python
:lines: 38-64
:linenos:
......@@ -106,7 +107,7 @@
- 单层RNN:过了一个很简单的recurrent_group。每一个时间步,当前的输入y和上一个时间步的输出rnn_state做了一个全链接。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequence_rnn.conf
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequence_rnn.conf
:language: python
:lines: 36-48
......@@ -115,7 +116,7 @@
- 内层inner_step的recurrent_group和单层序列的几乎一样。除了boot_layer=outer_mem,表示将外层的outer_mem作为内层memory的初始状态。外层outer_step中,outer_mem是一个子句的最后一个向量,即整个双层group是将前一个子句的最后一个向量,作为下一个子句memory的初始状态。
- 从输入数据上看,单双层序列的句子是一样的,只是双层序列将其又做了子序列划分。因此双层序列的配置中,必须将前一个子句的最后一个元素,作为boot_layer传给下一个子句的memory,才能保证和单层序列的配置中“每个时间步都用了上一个时间步的输出结果”一致。
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequence_nest_rnn.conf
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequence_nest_rnn.conf
:language: python
:lines: 39-66
......@@ -151,14 +152,14 @@
* 单层RNN\:
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequence_rnn_multi_unequalength_inputs.py
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequence_rnn_multi_unequalength_inputs.py
:language: python
:lines: 42-59
:linenos:
* 双层RNN\ \:
.. literalinclude:: ../../../paddle/gserver/tests/sequence_nest_rnn_multi_unequalength_inputs.py
.. literalinclude:: ../../../../paddle/gserver/tests/sequence_nest_rnn_multi_unequalength_inputs.py
:language: python
:lines: 41-80
:linenos:
......@@ -181,11 +182,11 @@ Memory
Memory是PaddlePaddle实现RNN时候使用的一个概念。RNN即时间递归神经网络,通常要求时间步之间具有一些依赖性,即当前时间步下的神经网络依赖前一个时间步神经网络中某一个神经元输出。如下图所示。
.. graphviz:: glossary_rnn.dot
.. graphviz:: src/glossary_rnn.dot
上图中虚线的连接,即是跨越时间步的网络连接。PaddlePaddle在实现RNN的时候,将这种跨越时间步的连接用一个特殊的神经网络单元实现。这个神经网络单元就叫Memory。Memory可以缓存上一个时刻某一个神经元的输出,然后在下一个时间步输入给另一个神经元。使用Memory的RNN实现便如下图所示。
.. graphviz:: glossary_rnn_with_memory.dot
.. graphviz:: src/glossary_rnn_with_memory.dot
使用这种方式,PaddlePaddle可以比较简单的判断哪些输出是应该跨越时间步的,哪些不是。
......
# Recurrent Group教程
## 概述
序列数据是自然语言处理任务面对的一种主要输入数据类型。
一句话是由词语构成的序列,多句话进一步构成了段落。因此,段落可以看作是一个嵌套的双层的序列,这个序列的每个元素又是一个序列。
双层序列是PaddlePaddle支持的一种非常灵活的数据组织方式,帮助我们更好地描述段落、多轮对话等更为复杂的语言数据。基于双层序列输入,我们可以设计搭建一个灵活的、层次化的RNN,分别从词语和句子级别编码输入数据,同时也能够引入更加复杂的记忆机制,更好地完成一些复杂的语言理解任务。
在PaddlePaddle中,`recurrent_group`是一种任意复杂的RNN单元,用户只需定义RNN在一个时间步内完成的计算,PaddlePaddle负责完成信息和误差在时间序列上的传播。
更进一步,`recurrent_group`同样可以扩展到双层序列的处理上。通过两个嵌套的`recurrent_group`分别定义子句级别和词语级别上需要完成的运算,最终实现一个层次化的复杂RNN。
目前,在PaddlePaddle中,能够对双向序列进行处理的有`recurrent_group`和部分Layer,具体可参考文档:<a href = "hierarchical-layer.html">支持双层序列作为输入的Layer</a>
## 相关概念
### 基本原理
`recurrent_group` 是PaddlePaddle支持的一种任意复杂的RNN单元。使用者只需要关注于设计RNN在一个时间步之内完成的计算,PaddlePaddle负责完成信息和梯度在时间序列上的传播。
PaddlePaddle中,`recurrent_group`的一个简单调用如下:
``` python
recurrent_group(step, input, reverse)
```
- step:一个可调用的函数,定义一个时间步之内RNN单元完成的计算
- input:输入,必须是一个单层序列,或者一个双层序列
- reverse:是否以逆序处理输入序列
使用`recurrent_group`的核心是设计step函数的计算逻辑。step函数内部可以自由组合PaddlePaddle支持的各种layer,完成任意的运算逻辑。`recurrent_group` 的输入(即input)会成为step函数的输入,由于step 函数只关注于RNN一个时间步之内的计算,在这里`recurrent_group`替我们完成了原始输入数据的拆分。
### 输入
`recurrent_group`处理的输入序列主要分为以下三种类型:
- **数据输入**:一个双层序列进入`recurrent_group`会被拆解为一个单层序列,一个单层序列进入`recurrent_group`会被拆解为非序列,然后交给step函数,这一过程对用户是完全透明的。可以有以下两种:1)通过data_layer拿到的用户输入;2)其它layer的输出。
- **只读Memory输入**`StaticInput` 定义了一个只读的Memory,由`StaticInput`指定的输入不会被`recurrent_group`拆解,`recurrent_group` 循环展开的每个时间步总是能够引用所有输入,可以是一个非序列,或者一个单层序列。
- **序列生成任务的输入**`GeneratedInput`只用于在序列生成任务中指定输入数据。
### 输入示例
序列生成任务大多遵循encoder-decoer架构,encoder和decoder可以是能够处理序列的任意神经网络单元,而RNN是最流行的选择。
给定encoder输出和当前词,decoder每次预测产生下一个最可能的词语。在这种结构中,decoder接受两个输入:
- 要生成的目标序列:是decoder的数据输入,也是decoder循环展开的依据,`recurrent_group`会对这类输入进行拆解。
- encoder输出,可以是一个非序列,或者一个单层序列:是一个unbounded memory,decoder循环展开的每一个时间步会引用全部结果,不应该被拆解,这种类型的输入必须通过`StaticInput`指定。关于Unbounded Memory的更多讨论请参考论文 [Neural Turning Machine](https://arxiv.org/abs/1410.5401)
在序列生成任务中,decoder RNN总是引用上一时刻预测出的词的词向量,作为当前时刻输入。`GeneratedInput`自动完成这一过程。
### 输出
`step`函数必须返回一个或多个Layer的输出,这个Layer的输出会作为整个`recurrent_group` 最终的输出结果。在输出的过程中,`recurrent_group` 会将每个时间步的输出拼接,这个过程对用户也是透明的。
### memory
memory只能在`recurrent_group`中定义和使用。memory不能独立存在,必须指向一个PaddlePaddle定义的Layer。引用memory得到这layer上一时刻输出,因此,可以将memory理解为一个时延操作。
可以显示地指定一个layer的输出用于初始化memory。不指定时,memory默认初始化为0。
## 双层RNN介绍
`recurrent_group`帮助我们完成对输入序列的拆分,对输出的合并,以及计算逻辑在序列上的循环展开。
利用这种特性,两个嵌套的`recurrent_group`能够处理双层序列,实现词语和句子两个级别的双层RNN结构。
- 单层(word-level)RNN:每个状态(state)对应一个词(word)。
- 双层(sequence-level)RNN:一个双层RNN由多个单层RNN组成,每个单层RNN(即双层RNN的每个状态)对应一个子句(subseq)。
为了描述方便,下文以NLP任务为例,将含有子句(subseq)的段落定义为一个双层序列,将含有词语的句子定义为一个单层序列,那么0层序列即为一个词语。
## 双层RNN的使用
### 训练流程的使用方法
使用 `recurrent_group`需要遵循以下约定:
- **单进单出**:输入和输出都是单层序列。
- 如果有多个输入,不同输入序列含有的词语数必须严格相等。
- 输出一个单层序列,输出序列的词语数和输入序列一致。
- memory:在step函数中定义 memory指向一个layer,通过引用memory得到这个layer上一个时刻输出,形成recurrent 连接。memory的is_seq参数必须为false。如果没有定义memory,每个时间步之内的运算是独立的。
- boot_layer:memory的初始状态,默认初始状为0,memory的is_seq参数必须为false。
- **双进双出**:输入和输出都是双层序列。
- 如果有多个输入序列,不同输入含有的子句(subseq)数必须严格相等,但子句含有的词语数可以不相等。
- 输出一个双层序列,子句(subseq)数、子句的单词数和指定的一个输入序列一致,默认为第一个输入。
- memory:在step函数中定义memory,指向一个layer,通过引用memory得到这个layer上一个时刻的输出,形成recurrent连接。定义在外层`recurrent_group` step函数中的memory,能够记录上一个subseq 的状态,可以是一个单层序列(只作为read-only memory),也可以是一个词语。如果没有定义memory,那么 subseq 之间的运算是独立的。
- boot_layer:memory 初始状态,可以是一个单层序列(只作为read-only memory)或一个向量。默认不设置,即初始状态为0。
- **双进单出**:目前还未支持,会报错"In hierachical RNN, all out links should be from sequences now"。
### 生成流程的使用方法
使用`beam_search`需要遵循以下约定:
- 单层RNN:从一个word生成下一个word。
# Recurrent Group教程
## 概述
序列数据是自然语言处理任务面对的一种主要输入数据类型。
一句话是由词语构成的序列,多句话进一步构成了段落。因此,段落可以看作是一个嵌套的双层的序列,这个序列的每个元素又是一个序列。
双层序列是PaddlePaddle支持的一种非常灵活的数据组织方式,帮助我们更好地描述段落、多轮对话等更为复杂的语言数据。基于双层序列输入,我们可以设计搭建一个灵活的、层次化的RNN,分别从词语和句子级别编码输入数据,同时也能够引入更加复杂的记忆机制,更好地完成一些复杂的语言理解任务。
在PaddlePaddle中,`recurrent_group`是一种任意复杂的RNN单元,用户只需定义RNN在一个时间步内完成的计算,PaddlePaddle负责完成信息和误差在时间序列上的传播。
更进一步,`recurrent_group`同样可以扩展到双层序列的处理上。通过两个嵌套的`recurrent_group`分别定义子句级别和词语级别上需要完成的运算,最终实现一个层次化的复杂RNN。
目前,在PaddlePaddle中,能够对双向序列进行处理的有`recurrent_group`和部分Layer,具体可参考文档:<a href = "hierarchical-layer.html">支持双层序列作为输入的Layer</a>
## 相关概念
### 基本原理
`recurrent_group` 是PaddlePaddle支持的一种任意复杂的RNN单元。使用者只需要关注于设计RNN在一个时间步之内完成的计算,PaddlePaddle负责完成信息和梯度在时间序列上的传播。
PaddlePaddle中,`recurrent_group`的一个简单调用如下:
``` python
recurrent_group(step, input, reverse)
```
- step:一个可调用的函数,定义一个时间步之内RNN单元完成的计算
- input:输入,必须是一个单层序列,或者一个双层序列
- reverse:是否以逆序处理输入序列
使用`recurrent_group`的核心是设计step函数的计算逻辑。step函数内部可以自由组合PaddlePaddle支持的各种layer,完成任意的运算逻辑。`recurrent_group` 的输入(即input)会成为step函数的输入,由于step 函数只关注于RNN一个时间步之内的计算,在这里`recurrent_group`替我们完成了原始输入数据的拆分。
### 输入
`recurrent_group`处理的输入序列主要分为以下三种类型:
- **数据输入**:一个双层序列进入`recurrent_group`会被拆解为一个单层序列,一个单层序列进入`recurrent_group`会被拆解为非序列,然后交给step函数,这一过程对用户是完全透明的。可以有以下两种:1)通过data_layer拿到的用户输入;2)其它layer的输出。
- **只读Memory输入**`StaticInput` 定义了一个只读的Memory,由`StaticInput`指定的输入不会被`recurrent_group`拆解,`recurrent_group` 循环展开的每个时间步总是能够引用所有输入,可以是一个非序列,或者一个单层序列。
- **序列生成任务的输入**`GeneratedInput`只用于在序列生成任务中指定输入数据。
### 输入示例
序列生成任务大多遵循encoder-decoer架构,encoder和decoder可以是能够处理序列的任意神经网络单元,而RNN是最流行的选择。
给定encoder输出和当前词,decoder每次预测产生下一个最可能的词语。在这种结构中,decoder接受两个输入:
- 要生成的目标序列:是decoder的数据输入,也是decoder循环展开的依据,`recurrent_group`会对这类输入进行拆解。
- encoder输出,可以是一个非序列,或者一个单层序列:是一个unbounded memory,decoder循环展开的每一个时间步会引用全部结果,不应该被拆解,这种类型的输入必须通过`StaticInput`指定。关于Unbounded Memory的更多讨论请参考论文 [Neural Turning Machine](https://arxiv.org/abs/1410.5401)
在序列生成任务中,decoder RNN总是引用上一时刻预测出的词的词向量,作为当前时刻输入。`GeneratedInput`自动完成这一过程。
### 输出
`step`函数必须返回一个或多个Layer的输出,这个Layer的输出会作为整个`recurrent_group` 最终的输出结果。在输出的过程中,`recurrent_group` 会将每个时间步的输出拼接,这个过程对用户也是透明的。
### memory
memory只能在`recurrent_group`中定义和使用。memory不能独立存在,必须指向一个PaddlePaddle定义的Layer。引用memory得到这layer上一时刻输出,因此,可以将memory理解为一个时延操作。
可以显示地指定一个layer的输出用于初始化memory。不指定时,memory默认初始化为0。
## 双层RNN介绍
`recurrent_group`帮助我们完成对输入序列的拆分,对输出的合并,以及计算逻辑在序列上的循环展开。
利用这种特性,两个嵌套的`recurrent_group`能够处理双层序列,实现词语和句子两个级别的双层RNN结构。
- 单层(word-level)RNN:每个状态(state)对应一个词(word)。
- 双层(sequence-level)RNN:一个双层RNN由多个单层RNN组成,每个单层RNN(即双层RNN的每个状态)对应一个子句(subseq)。
为了描述方便,下文以NLP任务为例,将含有子句(subseq)的段落定义为一个双层序列,将含有词语的句子定义为一个单层序列,那么0层序列即为一个词语。
## 双层RNN的使用
### 训练流程的使用方法
使用 `recurrent_group`需要遵循以下约定:
- **单进单出**:输入和输出都是单层序列。
- 如果有多个输入,不同输入序列含有的词语数必须严格相等。
- 输出一个单层序列,输出序列的词语数和输入序列一致。
- memory:在step函数中定义 memory指向一个layer,通过引用memory得到这个layer上一个时刻输出,形成recurrent 连接。memory的is_seq参数必须为false。如果没有定义memory,每个时间步之内的运算是独立的。
- boot_layer:memory的初始状态,默认初始状为0,memory的is_seq参数必须为false。
- **双进双出**:输入和输出都是双层序列。
- 如果有多个输入序列,不同输入含有的子句(subseq)数必须严格相等,但子句含有的词语数可以不相等。
- 输出一个双层序列,子句(subseq)数、子句的单词数和指定的一个输入序列一致,默认为第一个输入。
- memory:在step函数中定义memory,指向一个layer,通过引用memory得到这个layer上一个时刻的输出,形成recurrent连接。定义在外层`recurrent_group` step函数中的memory,能够记录上一个subseq 的状态,可以是一个单层序列(只作为read-only memory),也可以是一个词语。如果没有定义memory,那么 subseq 之间的运算是独立的。
- boot_layer:memory 初始状态,可以是一个单层序列(只作为read-only memory)或一个向量。默认不设置,即初始状态为0。
- **双进单出**:目前还未支持,会报错"In hierachical RNN, all out links should be from sequences now"。
### 生成流程的使用方法
使用`beam_search`需要遵循以下约定:
- 单层RNN:从一个word生成下一个word。
- 双层RNN:即把单层RNN生成后的subseq给拼接成一个新的双层seq。从语义上看,也不存在一个subseq直接生成下一个subseq的情况。
......@@ -30,7 +30,7 @@ Then at the :code:`process` function, each :code:`yield` function will return th
yield src_ids, trg_ids, trg_ids_next
For more details description of how to write a data provider, please refer to `PyDataProvider2 <../../ui/data_provider/index.html>`_. The full data provider file is located at :code:`demo/seqToseq/dataprovider.py`.
For more details description of how to write a data provider, please refer to :ref:`api_pydataprovider2` . The full data provider file is located at :code:`demo/seqToseq/dataprovider.py`.
===============================================
Configure Recurrent Neural Network Architecture
......@@ -42,8 +42,8 @@ Simple Gated Recurrent Neural Network
Recurrent neural network process a sequence at each time step sequentially. An example of the architecture of LSTM is listed below.
.. image:: ../../../tutorials/sentiment_analysis/bi_lstm.jpg
:align: center
.. image:: ../../../tutorials/sentiment_analysis/src/bi_lstm.jpg
:align: center
Generally speaking, a recurrent network perform the following operations from :math:`t=1` to :math:`t=T`, or reversely from :math:`t=T` to :math:`t=1`.
......@@ -102,11 +102,11 @@ Sequence to Sequence Model with Attention
We will use the sequence to sequence model with attention as an example to demonstrate how you can configure complex recurrent neural network models. An illustration of the sequence to sequence model with attention is shown in the following figure.
.. image:: ../../../tutorials/text_generation/encoder-decoder-attention-model.png
:align: center
:align: center
In this model, the source sequence :math:`S = \{s_1, \dots, s_T\}` is encoded with a bidirectional gated recurrent neural networks. The hidden states of the bidirectional gated recurrent neural network :math:`H_S = \{H_1, \dots, H_T\}` is called *encoder vector* The decoder is a gated recurrent neural network. When decoding each token :math:`y_t`, the gated recurrent neural network generates a set of weights :math:`W_S^t = \{W_1^t, \dots, W_T^t\}`, which are used to compute a weighted sum of the encoder vector. The weighted sum of the encoder vector is utilized to condition the generation of the token :math:`y_t`.
The encoder part of the model is listed below. It calls :code:`grumemory` to represent gated recurrent neural network. It is the recommended way of using recurrent neural network if the network architecture is simple, because it is faster than :code:`recurrent_group`. We have implemented most of the commonly used recurrent neural network architectures, you can refer to `Layers <../../ui/api/trainer_config_helpers/layers_index.html>`_ for more details.
The encoder part of the model is listed below. It calls :code:`grumemory` to represent gated recurrent neural network. It is the recommended way of using recurrent neural network if the network architecture is simple, because it is faster than :code:`recurrent_group`. We have implemented most of the commonly used recurrent neural network architectures, you can refer to :ref:`api_trainer_config_helpers_layers` for more details.
We also project the encoder vector to :code:`decoder_size` dimensional space, get the first instance of the backward recurrent network, and project it to :code:`decoder_size` dimensional space:
......@@ -246,6 +246,6 @@ The code is listed below:
outputs(beam_gen)
Notice that this generation technique is only useful for decoder like generation process. If you are working on sequence tagging tasks, please refer to `Semantic Role Labeling Demo <../../demo/semantic_role_labeling/index.html>`_ for more details.
Notice that this generation technique is only useful for decoder like generation process. If you are working on sequence tagging tasks, please refer to :ref:`semantic_role_labeling` for more details.
The full configuration file is located at :code:`demo/seqToseq/seqToseq_net.py`.
HOW TO
=======
Usage
-------
.. toctree::
:maxdepth: 1
concepts/use_concepts_cn.rst
cluster/k8s/paddle_on_k8s_cn.md
cluster/k8s/distributed_training_on_k8s_cn.md
Development
------------
.. toctree::
:maxdepth: 1
write_docs/index_cn.rst
deep_model/index_cn.rst
Optimization
-------------
.. toctree::
:maxdepth: 1
......@@ -51,7 +51,7 @@ In this tutorial, we will focus on nvprof and nvvp.
:code:`test_GpuProfiler` from :code:`paddle/math/tests` directory will be used to evaluate
above profilers.
.. literalinclude:: ../../paddle/math/tests/test_GpuProfiler.cpp
.. literalinclude:: ../../../paddle/math/tests/test_GpuProfiler.cpp
:language: c++
:lines: 111-124
:linenos:
......@@ -77,7 +77,7 @@ As a simple example, consider the following:
1. Add :code:`REGISTER_TIMER_INFO` and :code:`printAllStatus` functions (see the emphasize-lines).
.. literalinclude:: ../../paddle/math/tests/test_GpuProfiler.cpp
.. literalinclude:: ../../../paddle/math/tests/test_GpuProfiler.cpp
:language: c++
:lines: 111-124
:emphasize-lines: 8-10,13
......@@ -124,7 +124,7 @@ To use this command line profiler **nvprof**, you can simply issue the following
1. Add :code:`REGISTER_GPU_PROFILER` function (see the emphasize-lines).
.. literalinclude:: ../../paddle/math/tests/test_GpuProfiler.cpp
.. literalinclude:: ../../../paddle/math/tests/test_GpuProfiler.cpp
:language: c++
:lines: 111-124
:emphasize-lines: 6-7
......
PaddlePaddle 文档
======================
.. toctree::
:maxdepth: 1
getstarted/index_cn.rst
tutorials/index_cn.md
howto/index_cn.rst
api/index_cn.rst
faq/index_cn.rst
......@@ -8,4 +8,5 @@ PaddlePaddle Documentation
tutorials/index_en.md
howto/index_en.rst
api/index_en.rst
about/index_en.rst
about/index_en.rst
\ No newline at end of file
......@@ -93,7 +93,7 @@ where `train.sh` is almost the same as `demo/seqToseq/translation/train.sh`, the
- `--init_model_path`: path of the initialization model, here is `data/paraphrase_model`
- `--load_missing_parameter_strategy`: operations when model file is missing, here use a normal distibution to initialize the other parameters except for the embedding layer
For users who want to understand the dataset format, model architecture and training procedure in detail, please refer to [Text generation Tutorial](../text_generation/text_generation.md).
For users who want to understand the dataset format, model architecture and training procedure in detail, please refer to [Text generation Tutorial](../text_generation/index_en.md).
## Optional Function ##
### Embedding Parameters Observation
......
# Model Zoo - ImageNet #
[ImageNet](http://www.image-net.org/) 是通用物体分类领域一个众所周知的数据库。本教程提供了一个用于ImageNet上的卷积分类网络模型。
## ResNet 介绍
论文 [Deep Residual Learning for Image Recognition](http://arxiv.org/abs/1512.03385) 中提出的ResNet网络结构在2015年ImageNet大规模视觉识别竞赛(ILSVRC 2015)的分类任务中赢得了第一名。他们提出残差学习的框架来简化网络的训练,所构建网络结构的的深度比之前使用的网络有大幅度的提高。下图展示的是基于残差的连接方式。左图构造网络模块的方式被用于34层的网络中,而右图的瓶颈连接模块用于50层,101层和152层的网络结构中。
<center>![resnet_block](./resnet_block.jpg)</center>
<center>图 1. ResNet 网络模块</center>
本教程中我们给出了三个ResNet模型,这些模型都是由原作者提供的模型<https://github.com/KaimingHe/deep-residual-networks>转换过来的。我们使用PaddlePaddle在ILSVRC的验证集共50,000幅图像上测试了模型的分类错误率,其中输入图像的颜色通道顺序为**BGR**,保持宽高比缩放到短边为256,只截取中心方形的图像区域。分类错误率和模型大小由下表给出。
<center>
<table border="2" cellspacing="0" cellpadding="6" rules="all" frame="border">
<colgroup>
<col class="left" />
<col class="left" />
<col class="left" />
</colgroup>
<thead>
<tr>
<th scope="col" class="left">ResNet</th>
<th scope="col" class="left">Top-1</th>
<th scope="col" class="left">Model Size</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td class="left">ResNet-50</td>
<td class="left">24.9%</td>
<td class="left">99M</td>
</tr>
<tr>
<td class="left">ResNet-101</td>
<td class="left">23.7%</td>
<td class="left">173M</td>
</tr>
<tr>
<td class="left">ResNet-152</td>
<td class="left">23.2%</td>
<td class="left">234M</td>
</tr>
</tbody>
</table></center>
<br>
## ResNet 模型
50层,101层和152层的网络配置文件可参照```demo/model_zoo/resnet/resnet.py```。你也可以通过在命令行参数中增加一个参数如```--config_args=layer_num=50```来指定网络层的数目。
### 网络可视化
你可以通过执行下面的命令来得到ResNet网络的结构可视化图。该脚本会生成一个dot文件,然后可以转换为图片。需要安装graphviz来转换dot文件为图片。
```
cd demo/model_zoo/resnet
./net_diagram.sh
```
### 模型下载
```
cd demo/model_zoo/resnet
./get_model.sh
```
你可以执行上述命令来下载所有的模型和均值文件,如果下载成功,这些文件将会被保存在```demo/model_zoo/resnet/model```路径下。
```
mean_meta_224 resnet_101 resnet_152 resnet_50
```
* resnet_50: 50层网络模型。
* resnet_101: 101层网络模型。
* resnet_152: 152层网络模型。
* mean\_meta\_224: 均值图像文件,图像大小为3 x 224 x 224,颜色通道顺序为**BGR**。你也可以使用这三个值: 103.939, 116.779, 123.68。
### 参数信息
* **卷积层权重**
由于每个卷积层后面连接的是batch normalization层,因此该层中没有偏置(bias)参数,并且只有一个权重。
形状: `(Co, ky, kx, Ci)`
* Co: 输出特征图的通道数目
* ky: 滤波器核在垂直方向上的尺寸
* kx: 滤波器核在水平方向上的尺寸
* Ci: 输入特征图的通道数目
二维矩阵: (Co * ky * kx, Ci), 行优先次序存储。
* **全连接层权重**
二维矩阵: (输入层尺寸, 本层尺寸), 行优先次序存储。
* **[Batch Normalization](<http://arxiv.org/abs/1502.03167>) 层权重**
本层有四个参数,实际上只有.w0和.wbias是需要学习的参数,另外两个分别是滑动均值和方差。在测试阶段它们将会被加载到模型中。下表展示了batch normalization层的参数。
<center>
<table border="2" cellspacing="0" cellpadding="6" rules="all" frame="border">
<colgroup>
<col class="left" />
<col class="left" />
<col class="left" />
</colgroup>
<thead>
<tr>
<th scope="col" class="left">参数名</th>
<th scope="col" class="left">尺寸</th>
<th scope="col" class="left">含义</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr>
<td class="left">_res2_1_branch1_bn.w0</td>
<td class="left">256</td>
<td class="left">gamma, 缩放参数</td>
</tr>
<tr>
<td class="left">_res2_1_branch1_bn.w1</td>
<td class="left">256</td>
<td class="left">特征图均值</td>
</tr>
<tr>
<td class="left">_res2_1_branch1_bn.w2</td>
<td class="left">256</td>
<td class="left">特征图方差</td>
</tr>
<tr>
<td class="left">_res2_1_branch1_bn.wbias</td>
<td class="left">256</td>
<td class="left">beta, 偏置参数</td>
</tr>
</tbody>
</table></center>
<br>
### 参数读取
使用者可以使用下面的Python脚本来读取参数值:
```
import sys
import numpy as np
def load(file_name):
with open(file_name, 'rb') as f:
f.read(16) # skip header for float type.
return np.fromfile(f, dtype=np.float32)
if __name__=='__main__':
weight = load(sys.argv[1])
```
或者直接使用下面的shell命令:
```
od -j 16 -f _res2_1_branch1_bn.w0
```
## 特征提取
我们提供了C++和Python接口来提取特征。下面的例子使用了`demo/model_zoo/resnet/example`中的数据,详细地展示了整个特征提取的过程。
### C++接口
首先,在配置文件中的`define_py_data_sources2`里指定图像数据列表,具体请参照示例`demo/model_zoo/resnet/resnet.py`
```
train_list = 'train.list' if not is_test else None
# mean.meta is mean file of ImageNet dataset.
# mean.meta size : 3 x 224 x 224.
# If you use three mean value, set like:
# "mean_value:103.939,116.779,123.68;"
args={
'mean_meta': "model/mean_meta_224/mean.meta",
'image_size': 224, 'crop_size': 224,
'color': True,'swap_channel:': [2, 1, 0]}
define_py_data_sources2(train_list,
'example/test.list',
module="example.image_list_provider",
obj="processData",
args=args)
```
第二步,在`resnet.py`文件中指定要提取特征的网络层的名字。例如,
```
Outputs("res5_3_branch2c_conv", "res5_3_branch2c_bn")
```
第三步,在`extract_fea_c++.sh`文件中指定模型路径和输出的目录,然后执行下面的命令。
```
cd demo/model_zoo/resnet
./extract_fea_c++.sh
```
如果执行成功,特征将会存到`fea_output/rank-00000`文件中,如下所示。同时你可以使用`load_feature.py`文件中的`load_feature_c`接口来加载该文件。
```
-0.115318 -0.108358 ... -0.087884;-1.27664 ... -1.11516 -2.59123;
-0.126383 -0.116248 ... -0.00534909;-1.42593 ... -1.04501 -1.40769;
```
* 每行存储的是一个样本的特征。其中,第一行存的是图像`example/dog.jpg`的特征,第二行存的是图像`example/cat.jpg`的特征。
* 不同层的特征由分号`;`隔开,并且它们的顺序与`Outputs()`中指定的层顺序一致。这里,左边是`res5_3_branch2c_conv`层的特征,右边是`res5_3_branch2c_bn`层特征。
### Python接口
示例`demo/model_zoo/resnet/classify.py`中展示了如何使用Python来提取特征。下面的例子同样使用了`./example/test.list`中的数据。执行的命令如下:
```
cd demo/model_zoo/resnet
./extract_fea_py.sh
```
extract_fea_py.sh:
```
python classify.py \
--job=extract \
--conf=resnet.py\
--use_gpu=1 \
--mean=model/mean_meta_224/mean.meta \
--model=model/resnet_50 \
--data=./example/test.list \
--output_layer="res5_3_branch2c_conv,res5_3_branch2c_bn" \
--output_dir=features
```
* \--job=extract: 指定工作模式来提取特征。
* \--conf=resnet.py: 网络配置文件。
* \--use_gpu=1: 指定是否使用GPU。
* \--model=model/resnet_50: 模型路径。
* \--data=./example/test.list: 数据列表。
* \--output_layer="xxx,xxx": 指定提取特征的层。
* \--output_dir=features: 输出目录。
如果运行成功,你将会看到特征存储在`features/batch_0`文件中,该文件是由cPickle产生的。你可以使用`load_feature.py`中的`load_feature_py`接口来打开该文件,它将返回如下的字典:
```
{
'cat.jpg': {'res5_3_branch2c_conv': array([[-0.12638293, -0.116248 , -0.11883899, ..., -0.00895038, 0.01994277, -0.00534909]], dtype=float32), 'res5_3_branch2c_bn': array([[-1.42593431, -1.28918779, -1.32414699, ..., -1.45933616, -1.04501402, -1.40769434]], dtype=float32)},
'dog.jpg': {'res5_3_branch2c_conv': array([[-0.11531784, -0.10835785, -0.08809858, ...,0.0055237, 0.01505112, -0.08788397]], dtype=float32), 'res5_3_branch2c_bn': array([[-1.27663755, -1.18272924, -0.90937918, ..., -1.25178063, -1.11515927, -2.59122872]], dtype=float32)}
}
```
仔细观察,这些特征值与上述使用C++接口提取的结果是一致的。
## 预测
`classify.py`文件也可以用于对样本进行预测。我们提供了一个示例脚本`predict.sh`,它使用50层的ResNet模型来对`example/test.list`中的数据进行预测。
```
cd demo/model_zoo/resnet
./predict.sh
```
predict.sh调用了`classify.py`:
```
python classify.py \
--job=predict \
--conf=resnet.py\
--multi_crop \
--model=model/resnet_50 \
--use_gpu=1 \
--data=./example/test.list
```
* \--job=extract: 指定工作模型进行预测。
* \--conf=resnet.py: 网络配置文件。network configure.
* \--multi_crop: 使用10个裁剪图像块,预测概率取平均。
* \--use_gpu=1: 指定是否使用GPU。
* \--model=model/resnet_50: 模型路径。
* \--data=./example/test.list: 数据列表。
如果运行成功,你将会看到如下结果,其中156和285是这些图像的分类标签。
```
Label of example/dog.jpg is: 156
Label of example/cat.jpg is: 282
```
......@@ -52,7 +52,7 @@ See ```demo/model_zoo/resnet/resnet.py```. This config contains network of 50, 1
### Network Visualization
You can get a diagram of ResNet network by running the following commands. The script generates dot file and then converts dot file to PNG file, which uses installed draw_dot tool in our server. If you can not access the server, just install graphviz to convert dot file.
You can get a diagram of ResNet network by running the following commands. The script generates dot file and then converts dot file to PNG file, which needs to install graphviz to convert.
```
cd demo/model_zoo/resnet
......@@ -138,7 +138,7 @@ There are four parameters in this layer. In fact, only .w0 and .wbias are the le
### Parameter Observation
Users who want to observe the parameters can use python to read:
Users who want to observe the parameters can use Python to read:
```
import sys
......@@ -209,7 +209,7 @@ If successful, features are saved in `fea_output/rank-00000` as follows. And you
### Python Interface
`demo/model_zoo/resnet/classify.py` is an example to show how to use python to extract features. Following example still uses data of `./example/test.list`. Command is as follows:
`demo/model_zoo/resnet/classify.py` is an example to show how to use Python to extract features. Following example still uses data of `./example/test.list`. Command is as follows:
```
cd demo/model_zoo/resnet
......@@ -238,8 +238,6 @@ python classify.py \
* \--output_layer="xxx,xxx": specify layers to extract features.
* \--output_dir=features: output diretcoty.
Note, since the convolution layer in these ResNet models is suitable for the cudnn implementation which only support GPU. It not support CPU mode because of compatibility issue and we will fix later.
If run successfully, you will see features saved in `features/batch_0`, this file is produced with cPickle. You can use `load_feature_py` interface in `load_feature.py` to open the file, and it returns a dictionary as follows:
```
......
# TUTORIALS
There are several examples and demos here.
## Quick Start
* [Quick Start](quick_start/index_cn.rst)
## Image
* TBD
## NLP
* [Sentiment Analysis](sentiment_analysis/index_cn.md)
* [Semantic Role Labeling](semantic_role_labeling/index_cn.rst)
## Recommendation
* TBD
## Model Zoo
* TBD
# TUTORIALS
There are serveral examples and demos here.
There are several examples and demos here.
## [Quick Start](quick_start/index_en.md)
## Quick Start
* [Quick Start](quick_start/index_en.md)
## Image
......
......@@ -21,7 +21,7 @@ PaddlePaddle快速入门教程
使用PaddlePaddle, 每一个任务流程都可以被划分为如下五个步骤。
.. image:: Pipeline.jpg
.. image:: src/Pipeline_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -99,7 +99,7 @@ Python脚本读取数据
本小节我们将介绍模型网络结构。
.. image:: PipelineNetwork.jpg
.. image:: src/PipelineNetwork_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -112,7 +112,7 @@ Python脚本读取数据
具体流程如下:
.. image:: NetLR.jpg
.. image:: src/NetLR_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -147,9 +147,9 @@ Python脚本读取数据
**效果总结**:我们将在后面介绍训练和预测流程的脚本。在此为方便对比不同网络结构,我们总结了各个网络的复杂度和效果。
===================== =============================== =================
网络名称 参数数量 错误率
网络名称 参数数量 错误率
===================== =============================== =================
逻辑回归 252 KB 8.652 %
逻辑回归 252 KB 8.652 %
===================== =============================== =================
词向量模型
......@@ -176,7 +176,7 @@ embedding模型需要稍微改变提供数据的Python脚本,即 ``dataprovide
该模型依然使用逻辑回归分类网络的框架, 只是将句子用连续向量表示替换为用稀疏向量表示, 即对第三步进行替换。句子表示的计算更新为两步:
.. image:: NetContinuous.jpg
.. image:: src/NetContinuous_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -197,9 +197,9 @@ embedding模型需要稍微改变提供数据的Python脚本,即 ``dataprovide
**效果总结:**
===================== =============================== ==================
网络名称 参数数量 错误率
网络名称 参数数量 错误率
===================== =============================== ==================
词向量模型 15 MB 8.484 %
词向量模型 15 MB 8.484 %
===================== =============================== ==================
卷积模型
......@@ -207,7 +207,7 @@ embedding模型需要稍微改变提供数据的Python脚本,即 ``dataprovide
卷积网络是一种特殊的从词向量表示到句子表示的方法, 也就是将词向量模型进一步演化为三个新步骤。
.. image:: NetConv.jpg
.. image:: src/NetConv_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -230,15 +230,15 @@ embedding模型需要稍微改变提供数据的Python脚本,即 ``dataprovide
**效果总结:**
===================== =============================== ========================
网络名称 参数数量 错误率
网络名称 参数数量 错误率
===================== =============================== ========================
卷积模型 16 MB 5.628 %
卷积模型 16 MB 5.628 %
===================== =============================== ========================
时序模型
----------
.. image:: NetRNN.jpg
.. image:: src/NetRNN_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -260,9 +260,9 @@ embedding模型需要稍微改变提供数据的Python脚本,即 ``dataprovide
本次试验,我们采用单层LSTM模型,并使用了Dropout,**效果总结:**
===================== =============================== =========================
网络名称 参数数量 错误率
网络名称 参数数量 错误率
===================== =============================== =========================
时序模型 16 MB 4.812 %
时序模型 16 MB 4.812 %
===================== =============================== =========================
优化算法
......@@ -284,7 +284,7 @@ Momentum, RMSProp,AdaDelta,AdaGrad,ADAM,Adamax等,这里采用Adam优
在数据加载和网络配置完成之后, 我们就可以训练模型了。
.. image:: PipelineTrain.jpg
.. image:: src/PipelineTrain_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -294,7 +294,7 @@ Momentum, RMSProp,AdaDelta,AdaGrad,ADAM,Adamax等,这里采用Adam优
./train.sh
``train.sh``中包含了训练模型的基本命令。训练时所需设置的主要参数如下:
``train.sh`` 中包含了训练模型的基本命令。训练时所需设置的主要参数如下:
.. code-block:: bash
......@@ -312,7 +312,7 @@ Momentum, RMSProp,AdaDelta,AdaGrad,ADAM,Adamax等,这里采用Adam优
当模型训练好了之后,我们就可以进行预测了。
.. image:: PipelineTest.jpg
.. image:: src/PipelineTest_cn.jpg
:align: center
:scale: 80%
......@@ -348,12 +348,12 @@ Momentum, RMSProp,AdaDelta,AdaGrad,ADAM,Adamax等,这里采用Adam优
对于Amazon-Elec测试集(25k), 如下表格,展示了上述网络模型的训练效果:
===================== =============================== ============= ==================================
网络名称 参数数量 错误率 配置文件
网络名称 参数数量 错误率 配置文件
===================== =============================== ============= ==================================
逻辑回归模型 252 KB 8.652% trainer_config.lr.py
词向量模型 15 MB 8.484% trainer_config.emb.py
逻辑回归模型 252 KB 8.652% trainer_config.lr.py
词向量模型 15 MB 8.484% trainer_config.emb.py
卷积模型 16 MB 5.628% trainer_config.cnn.py
时序模型 16 MB 4.812% trainer_config.lstm.py
时序模型 16 MB 4.812% trainer_config.lstm.py
===================== =============================== ============= ==================================
......@@ -384,12 +384,12 @@ Momentum, RMSProp,AdaDelta,AdaGrad,ADAM,Adamax等,这里采用Adam优
模型训练会看到类似上面这样的日志信息,详细的参数解释,请参考如下表格:
=========================================== ==============================================================
名称 解释
名称 解释
=========================================== ==============================================================
Batch=20 表示过了20个batch
samples=2560 表示过了2560个样本
AvgCost 每个pass的第0个batch到当前batch所有样本的平均cost
CurrentCost 当前log_period个batch所有样本的平均cost
Eval: classification_error_evaluator 每个pass的第0个batch到当前batch所有样本的平均分类错误率
CurrentEval: classification_error_evaluator 当前log_period个batch所有样本的平均分类错误率
Batch=20 表示过了20个batch
samples=2560 表示过了2560个样本
AvgCost 每个pass的第0个batch到当前batch所有样本的平均cost
CurrentCost 当前log_period个batch所有样本的平均cost
Eval: classification_error_evaluator 每个pass的第0个batch到当前batch所有样本的平均分类错误率
CurrentEval: classification_error_evaluator 当前log_period个batch所有样本的平均分类错误率
=========================================== ==============================================================
......@@ -32,7 +32,7 @@ The monitor breaks down two months after purchase.
the classifier should output “negative“.
To build your text classification system, your code will need to perform five steps:
<center> ![](./Pipeline_en.jpg) </center>
<center> ![](./src/Pipeline_en.jpg) </center>
- Preprocess data into a standardized format.
- Provide data to the learning model.
......@@ -160,14 +160,14 @@ You can refer to the following link for more detailed examples and data formats:
## Network Architecture
You will describe four kinds of network architectures in this section.
<center> ![](./PipelineNetwork_en.jpg) </center>
<center> ![](./src/PipelineNetwork_en.jpg) </center>
First, you will build a logistic regression model. Later, you will also get chance to build other more powerful network architectures.
For more detailed documentation, you could refer to: <a href = "../../api/trainer_config_helpers/layers.html">layer documentation</a>. All configuration files are in `demo/quick_start` directory.
### Logistic Regression
The architecture is illustrated in the following picture:
<center> ![](./NetLR_en.png) </center>
<center> ![](./src/NetLR_en.png) </center>
- You need define the data for text features. The size of the data layer is the number of words in the dictionary.
......@@ -182,10 +182,10 @@ label = data_layer(name="label", size=label_dim)
```
- It uses logistic regression model to classify the vector, and it will output the classification error during training.
- Each layer has an *input* argument that specifies its input layer. Some layers can have multiple input layers. You can use a list of the input layers as input in that case.
- *size* for each layer means the number of neurons of the layer.
- *act_type* means activation function applied to the output of each neuron independently.
- Some layers can have additional special inputs. For example, `classification_cost` needs ground truth label as input to compute classification loss and error.
- Each layer has an *input* argument that specifies its input layer. Some layers can have multiple input layers. You can use a list of the input layers as input in that case.
- *size* for each layer means the number of neurons of the layer.
- *act_type* means activation function applied to the output of each neuron independently.
- Some layers can have additional special inputs. For example, `classification_cost` needs ground truth label as input to compute classification loss and error.
```python
# Define a fully connected layer with logistic activation (also called softmax activation).
output = fc_layer(input=word,
......@@ -240,7 +240,7 @@ def process(settings, file_name):
```
This model is very similar to the framework of logistic regression, but it uses word embedding vectors instead of a sparse vectors to represent words.
<center> ![](./NetContinuous_en.png) </center>
<center> ![](./src/NetContinuous_en.png) </center>
- It can look up the dense word embedding vector in the dictionary (its words embedding vector is `word_dim`). The input is a sequence of N words, the output is N word_dim dimensional vectors.
......@@ -283,7 +283,7 @@ The performance is summarized in the following table:
### Convolutional Neural Network Model
Convolutional neural network converts a sequence of word embeddings into a sentence representation using temporal convolutions. You will transform the fully connected layer of the word embedding model to 3 new sub-steps.
<center> ![](./NetConv_en.png) </center>
<center> ![](./src/NetConv_en.png) </center>
Text convolution has 3 steps:
......@@ -295,8 +295,8 @@ Text convolution has 3 steps:
# context_len means convolution kernel size.
# context_start means the start of the convolution. It can be negative. In that case, zero padding is applied.
text_conv = sequence_conv_pool(input=emb,
context_start=k,
context_len=2 * k + 1)
context_start=k,
context_len=2 * k + 1)
```
The performance is summarized in the following table:
......@@ -324,7 +324,7 @@ The performance is summarized in the following table:
<br>
### Recurrent Model
<center> ![](./NetRNN_en.png) </center>
<center> ![](./src/NetRNN_en.png) </center>
You can use Recurrent neural network as our time sequence model, including simple RNN model, GRU model, and LSTM model。
......@@ -378,7 +378,7 @@ settings(batch_size=128,
## Training Model
After completing data preparation and network architecture specification, you will run the training script.
<center> ![](./PipelineTrain_en.png) </center>
<center> ![](./src/PipelineTrain_en.png) </center>
Training script: our training script is in `train.sh` file. The training arguments are listed below:
......@@ -395,7 +395,7 @@ We do not provide examples on how to train on clusters here. If you want to trai
## Inference
You can use the trained model to perform prediction on the dataset with no labels. You can also evaluate the model on dataset with labels to obtain its test accuracy.
<center> ![](./PipelineTest_en.png) </center>
<center> ![](./src/PipelineTest_en.png) </center>
The test script is listed below. PaddlePaddle can evaluate a model on the data with labels specified in `test.list`.
......
```eval_rst
.. _demo_ml_dataset_en:
.. _demo_ml_dataset:
```
# MovieLens Dataset
......
......@@ -16,7 +16,7 @@ Data Preparation
````````````````
Download and extract dataset
''''''''''''''''''''''''''''
We use :ref:`demo_ml_dataset_en` here.
We use :ref:`demo_ml_dataset` here.
To download and unzip the dataset, simply run the following commands.
.. code-block:: bash
......@@ -264,7 +264,7 @@ In this :code:`dataprovider.py`, we should set\:
* use_seq\: Whether this :code:`dataprovider.py` in sequence mode or not.
* process\: Return each sample of data to :code:`paddle`.
The data provider details document see :ref:`api_pydataprovider`.
The data provider details document see :ref:`api_pydataprovider2`.
Train
`````
......@@ -280,7 +280,7 @@ The run.sh is shown as follow:
It just start a paddle training process, write the log to `log.txt`,
then print it on screen.
Each command line argument in :code:`run.sh`, please refer to the :ref:`cmd_line_index_en` page. The short description of these arguments is shown as follow.
Each command line argument in :code:`run.sh`, please refer to the :ref:`cmd_line_index` page. The short description of these arguments is shown as follow.
* config\: Tell paddle which file is neural network configuration.
* save_dir\: Tell paddle save model into './output'
......
......@@ -149,7 +149,7 @@ paddle train \
训练后,模型将保存在目录`output`中。 我们的训练曲线如下:
<center>
![pic](./curve.jpg)
![pic](./src/curve.jpg)
</center>
### 测试
......
```eval_rst
.. _semantic_role_labeling:
```
# Semantic Role labeling Tutorial #
Semantic role labeling (SRL) is a form of shallow semantic parsing whose goal is to discover the predicate-argument structure of each predicate in a given input sentence. SRL is useful as an intermediate step in a wide range of natural language processing tasks, such as information extraction. automatic document categorization and question answering. An instance is as following [1]:
......@@ -41,13 +45,13 @@ Unlike Bidirectional-LSTM that used in Sentiment Analysis demo, the DB-LSTM ado
The following figure shows a temporal expanded 2-layer DB-LSTM network.
<center>
![pic](./network_arch.png)
![pic](./src/network_arch.png)
</center>
### Features
Two input features play an essential role in this pipeline: predicate (pred) and argument (argu). Two other features: predicate context (ctx-p) and region mark (mr) are also adopted. Because a single predicate word can not exactly describe the predicate information, especially when the same words appear more than one times in a sentence. With the predicate context, the ambiguity can be largely eliminated. Similarly, we use region mark m<sub>r</sub> = 1 to denote the argument position if it locates in the predicate context region, or m<sub>r</sub> = 0 if does not. These four simple features are all we need for our SRL system. Features of one sample with context size set to 1 is showed as following[2]:
<center>
![pic](./feature.jpg)
![pic](./src/feature.jpg)
</center>
In this sample, the coresponding labelled sentence is:
......@@ -148,7 +152,7 @@ paddle train \
After training, the models will be saved in directory `output`. Our training curve is as following:
<center>
![pic](./curve.jpg)
![pic](./src/curve.jpg)
</center>
### Run testing
......
# 语义角色标注教程 #
语义角色标注(Semantic role labeling, SRL)是浅语义解析的一种形式,其目的是在给定的输入句子中发现每个谓词的谓词参数结构。 SRL作为很多自然语言处理任务中的中间步骤是很有用的,如信息提取、文档自动分类和问答。 实例如下 [1]:
[ <sub>A0</sub> 他 ] [ <sub>AM-MOD</sub> 将 ][ <sub>AM-NEG</sub> 不会 ] [ <sub>V</sub> 接受] [ <sub>A1</sub> 任何东西 ] 从 [<sub>A2</sub> 那些他写的东西中 ]。
- V: 动词
- A0: 接受者
- A1: 接受的东西
- A2: 从……接受
- A3: 属性
- AM-MOD: 情态动词
- AM-NEG: 否定
给定动词“接受”,句子中的大部分将会扮演某些语义角色。这里,标签方案来自 Penn Proposition Bank。
到目前为止,大多数成功的SRL系统是建立在某种形式的解析结果之上的,其中在语法结构上使用了预先定义的特征模板。 本教程将介绍使用深度双向长短期记忆(DB-LSTM)模型[2]的端到端系统来解决SRL任务,这在很大程度上优于先前的最先进的系统。 这个系统将SRL任务视为序列标记问题。
## 数据描述
相关论文[2]采用 CoNLL-2005&2012 共享任务中设置的数据进行训练和测试。根据数据许可证,演示采用 CoNLL-2005 的测试数据集,可以在网站上找到。
用户只需执行以下命令就可以下载并处理原始数据:
```bash
cd data
./get_data.sh
```
`data `目录会出现如下几个新的文件:
```bash
conll05st-release:the test data set of CoNll-2005 shared task
test.wsj.words:the Wall Street Journal data sentences
test.wsj.props: the propositional arguments
feature: the extracted features from data set
```
## 训练
### DB-LSTM
请参阅情绪分析的演示以了解有关长期短期记忆单元的更多信息。
与在 Sentiment Analysis 演示中使用的 Bidirectional-LSTM 不同,DB-LSTM 采用另一种方法来堆叠LSTM层。首先,标准LSTM以正向处理该序列。该 LSTM 层的输入和输出作为下一个 LSTM 层的输入,并被反向处理。这两个标准 LSTM 层组成一对 LSTM。然后我们堆叠一对对的 LSTM 层后得到深度 LSTM 模型。
下图展示了时间扩展的2层 DB-LSTM 网络。
<center>
![pic](./network_arch.png)
</center>
### 特征
两个输入特性在这个管道中起着至关重要的作用:predicate(pred)和argument(arguments)。 还采用了两个其他特征:谓词上下文(ctx-p)和区域标记(mr)。 因为单个谓词不能精确地描述谓词信息,特别是当相同的词在句子中出现多于一次时。 使用谓词上下文,可以在很大程度上消除歧义。类似地,如果它位于谓词上下文区域中,则使用区域标记 m<sub>r</sub> = 1 来表示参数位置,反之则 m<sub>r</sub> = 0。这四个简单的特征是我们的SRL系统所需要的。上下文大小设置为1的一个样本的特征如下[2]所示:
<center>
![pic](./feature.jpg)
</center>
在这个示例中,相应的标记句子是:
[ <sub>A1</sub> A record date ] has [ <sub>AM-NEG</sub> n't ] been [ <sub>V</sub> set ] .
在演示中, 我们采用上面的特征模板, 包括: `argument`, `predicate`, `ctx-p (p=-1,0,1)`, `mark` 并使用 `B/I/O` 方案来标记每个参数。这些特征和标签存储在 `feature` 文件中, 用`\t`分割。
### 数据提供
`dataprovider.py` 是一个包装数据的 Python 文件。 函数 `hook()` 定义了网络的数据槽。六个特征和标签都是索引槽。
```
def hook(settings, word_dict, label_dict, **kwargs):
settings.word_dict = word_dict
settings.label_dict = label_dict
#all inputs are integral and sequential type
settings.slots = [
integer_value_sequence(len(word_dict)),
integer_value_sequence(len(predicate_dict)),
integer_value_sequence(len(word_dict)),
integer_value_sequence(len(word_dict)),
integer_value_sequence(len(word_dict)),
integer_value_sequence(len(word_dict)),
integer_value_sequence(len(word_dict)),
integer_value_sequence(2),
integer_value_sequence(len(label_dict))]
```
相应的数据迭代器如下:
```
@provider(init_hook=hook, should_shuffle=True, calc_batch_size=get_batch_size,
can_over_batch_size=False, cache=CacheType.CACHE_PASS_IN_MEM)
def process(settings, file_name):
with open(file_name, 'r') as fdata:
for line in fdata:
sentence, predicate, ctx_n2, ctx_n1, ctx_0, ctx_p1, ctx_p2, mark, label = \
line.strip().split('\t')
words = sentence.split()
sen_len = len(words)
word_slot = [settings.word_dict.get(w, UNK_IDX) for w in words]
predicate_slot = [settings.predicate_dict.get(predicate)] * sen_len
ctx_n2_slot = [settings.word_dict.get(ctx_n2, UNK_IDX)] * sen_len
ctx_n1_slot = [settings.word_dict.get(ctx_n1, UNK_IDX)] * sen_len
ctx_0_slot = [settings.word_dict.get(ctx_0, UNK_IDX)] * sen_len
ctx_p1_slot = [settings.word_dict.get(ctx_p1, UNK_IDX)] * sen_len
ctx_p2_slot = [settings.word_dict.get(ctx_p2, UNK_IDX)] * sen_len
marks = mark.split()
mark_slot = [int(w) for w in marks]
label_list = label.split()
label_slot = [settings.label_dict.get(w) for w in label_list]
yield word_slot, predicate_slot, ctx_n2_slot, ctx_n1_slot, \
ctx_0_slot, ctx_p1_slot, ctx_p2_slot, mark_slot, label_slot
```
函数 `process` 产出有8个特征和标签的9个表。
### 神经网络配置
`db_lstm.py` 是在训练过程中加载字典并定义数据提供程序模块和网络架构的神经网络配置文件。
九个 `data_layer` 从数据提供程序加载实例。八个特征分别转换为嵌入,并由`mixed_layer`混合。 深度双向LSTM层提取softmax层的特征。目标函数是标签的交叉熵。
### 训练
训练的脚本是 `train.sh`,用户只需执行:
```bash
./train.sh
```
`train.sh` 中的内容:
```
paddle train \
--config=./db_lstm.py \
--use_gpu=0 \
--log_period=5000 \
--trainer_count=1 \
--show_parameter_stats_period=5000 \
--save_dir=./output \
--num_passes=10000 \
--average_test_period=10000000 \
--init_model_path=./data \
--load_missing_parameter_strategy=rand \
--test_all_data_in_one_period=1 \
2>&1 | tee 'train.log'
```
- \--config=./db_lstm.py : 网络配置文件
- \--use_gpu=false: 使用 CPU 训练(如果已安装 PaddlePaddle GPU版本并想使用 GPU 训练可以设置为true,目前 crf_layer 不支持 GPU)
- \--log_period=500: 每20批(batch)输出日志
- \--trainer_count=1: 设置线程数(或 GPU 数)
- \--show_parameter_stats_period=5000: 每100批显示参数统计
- \--save_dir=./output: 模型输出路径
- \--num_passes=10000: 设置通过数,一次通过意味着PaddlePaddle训练数据集中的所有样本一次
- \--average_test_period=10000000: 每个 average_test_period 批次对平均参数进行测试
- \--init_model_path=./data: 参数初始化路径
- \--load_missing_parameter_strategy=rand: 随机初始不存在的参数
- \--test_all_data_in_one_period=1: 在一个周期内测试所有数据
训练后,模型将保存在目录`output`中。 我们的训练曲线如下:
<center>
![pic](./curve.jpg)
</center>
### 测试
测试脚本是 `test.sh`, 执行:
```bash
./test.sh
```
`tesh.sh` 的主要部分:
```
paddle train \
--config=./db_lstm.py \
--model_list=$model_list \
--job=test \
--config_args=is_test=1 \
```
- \--config=./db_lstm.py: 网络配置文件
- \--model_list=$model_list.list: 模型列表文件
- \--job=test: 指示测试任务
- \--config_args=is_test=1: 指示测试任务的标记
- \--test_all_data_in_one_period=1: 在一个周期内测试所有数据
### 预测
预测脚本是 `predict.sh`,用户只需执行:
```bash
./predict.sh
```
`predict.sh`中,用户应该提供网络配置文件,模型路径,标签文件,字典文件,特征文件。
```
python predict.py
-c $config_file \
-w $best_model_path \
-l $label_file \
-p $predicate_dict_file \
-d $dict_file \
-i $input_file \
-o $output_file
```
`predict.py` 是主要的可执行python脚本,其中包括函数:加载模型,加载数据,数据预测。网络模型将输出标签的概率分布。 在演示中,我们使用最大概率的标签作为结果。用户还可以根据概率分布矩阵实现集束搜索或维特比解码。
预测后,结果保存在 `predict.res` 中。
## 引用
[1] Martha Palmer, Dan Gildea, and Paul Kingsbury. The Proposition Bank: An Annotated Corpus of Semantic Roles , Computational Linguistics, 31(1), 2005.
[2] Zhou, Jie, and Wei Xu. "End-to-end learning of semantic role labeling using recurrent neural networks." Proceedings of the Annual Meeting of the Association for Computational Linguistics. 2015.
此差异已折叠。
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