FAQ¶
Contents
- FAQ
- 1. 如何减少内存占用
- 2. 如何加速PaddlePaddle的训练速度
- 3. 遇到“非法指令”或者是“illegal instruction”
- 4. 如何选择SGD算法的学习率
- 5. 如何初始化参数
- 6. 如何共享参数
- 7. *-cp27mu-linux_x86_64.whl is not a supported wheel on this platform.
- 8. python相关的单元测试都过不了
- 9. 运行Docker GPU镜像出现 “CUDA driver version is insufficient”
- 10. CMake源码编译, 找到的PythonLibs和PythonInterp版本不一致
- 11. CMake源码编译,Paddle版本号为0.0.0
- 12. A protocol message was rejected because it was too big
- 13. 如何指定GPU设备
- 14. 训练过程中出现
Floating point exception
, 训练因此退出怎么办? - 15. 编译安装后执行 import paddle.v2 as paddle 报ImportError: No module named v2
1. 如何减少内存占用¶
神经网络的训练本身是一个非常消耗内存和显存的工作,经常会消耗数10GB的内存和数GB的显存。 PaddlePaddle的内存占用主要分为如下几个方面:
- DataProvider缓冲池内存(只针对内存)
- 神经元激活内存(针对内存和显存)
- 参数内存 (针对内存和显存)
- 其他内存杂项
其中,其他内存杂项是指PaddlePaddle本身所用的一些内存,包括字符串分配,临时变量等等,暂不考虑在内。
减少DataProvider缓冲池内存¶
PyDataProvider使用的是异步加载,同时在内存里直接随即选取数据来做Shuffle。即
所以,减小这个内存池即可减小内存占用,同时也可以加速开始训练前数据载入的过程。但是,这 个内存池实际上决定了shuffle的粒度。所以,如果将这个内存池减小,又要保证数据是随机的, 那么最好将数据文件在每次读取之前做一次shuffle。可能的代码为
@provider(min_pool_size=0, ...)
def process(settings, filename):
os.system('shuf %s > %s.shuf' % (filename, filename)) # shuffle before.
with open('%s.shuf' % filename, 'r') as f:
for line in f:
yield get_sample_from_line(line)
这样做可以极大的减少内存占用,并且可能会加速训练过程,详细文档参考 PyDataProvider2的使用 。
神经元激活内存¶
神经网络在训练的时候,会对每一个激活暂存一些数据,如神经元激活值等。 在反向传递的时候,这些数据会被用来更新参数。这些数据使用的内存主要和两个参数有关系, 一是batch size,另一个是每条序列(Sequence)长度。所以,其实也是和每个mini-batch中包含 的时间步信息成正比。
所以做法可以有两种:
- 减小batch size。 即在网络配置中
settings(batch_size=1000)
设置成一个小一些的值。但是batch size本身是神经网络的超参数,减小batch size可能会对训练结果产生影响。 - 减小序列的长度,或者直接扔掉非常长的序列。比如,一个数据集大部分序列长度是100-200, 但是突然有一个10000长的序列,就很容易导致内存超限,特别是在LSTM等RNN中。
2. 如何加速PaddlePaddle的训练速度¶
加速PaddlePaddle训练可以考虑从以下几个方面:
- 减少数据载入的耗时
- 加速训练速度
- 利用分布式训练驾驭更多的计算资源
减少数据载入的耗时¶
使用pydataprovider
时,可以减少缓存池的大小,同时设置内存缓存功能,即可以极大的加速数据载入流程。
DataProvider
缓存池的减小,和之前减小通过减小缓存池来减小内存占用的原理一致。
@provider(min_pool_size=0, ...)
def process(settings, filename):
os.system('shuf %s > %s.shuf' % (filename, filename)) # shuffle before.
with open('%s.shuf' % filename, 'r') as f:
for line in f:
yield get_sample_from_line(line)
同时 @provider
接口有一个 cache
参数来控制缓存方法,将其设置成 CacheType.CACHE_PASS_IN_MEM
的话,会将第一个 pass
(过完所有训练数据即为一个pass)生成的数据缓存在内存里,在之后的 pass
中,不会再从 python
端读取数据,而是直接从内存的缓存里读取数据。这也会极大减少数据读入的耗时。
加速训练速度¶
PaddlePaddle支持Sparse的训练,sparse训练需要训练特征是 sparse_binary_vector
、 sparse_vector
、或者 integer_value
的任一一种。同时,与这个训练数据交互的Layer,需要将其Parameter设置成 sparse 更新模式,即设置 sparse_update=True
这里使用简单的 word2vec
训练语言模型距离,具体使用方法为:
使用一个词前两个词和后两个词,来预测这个中间的词。这个任务的DataProvider为:
DICT_DIM = 3000
@provider(input_types=[integer_sequence(DICT_DIM), integer_value(DICT_DIM)])
def process(settings, filename):
with open(filename) as f:
# yield word ids to predict inner word id
# such as [28, 29, 10, 4], 4
# It means the sentance is 28, 29, 4, 10, 4.
yield read_next_from_file(f)
这个任务的配置为:
... # the settings and define data provider is omitted.
DICT_DIM = 3000 # dictionary dimension.
word_ids = data_layer('word_ids', size=DICT_DIM)
emb = embedding_layer(
input=word_ids, size=256, param_attr=ParamAttr(sparse_update=True))
emb_sum = pooling_layer(input=emb, pooling_type=SumPooling())
predict = fc_layer(input=emb_sum, size=DICT_DIM, act=Softmax())
outputs(
classification_cost(
input=predict, label=data_layer(
'label', size=DICT_DIM)))
3. 遇到“非法指令”或者是“illegal instruction”¶
PaddlePaddle使用avx SIMD指令提高cpu执行效率,因此错误的使用二进制发行版可能会导致这种错误,请选择正确的版本。
4. 如何选择SGD算法的学习率¶
在采用sgd/async_sgd进行训练时,一个重要的问题是选择正确的learning_rate。如果learning_rate太大,那么训练有可能不收敛,如果learning_rate太小,那么收敛可能很慢,导致训练时间过长。
通常做法是从一个比较大的learning_rate开始试,如果不收敛,那减少学习率10倍继续试验,直到训练收敛为止。那么如何判断训练不收敛呢?可以估计出如果模型采用不变的输出最小的cost0是多少。
如果训练过程的的cost明显高于这个常数输出的cost,那么我们可以判断为训练不收敛。举一个例子,假如我们是三分类问题,采用multi-class-cross-entropy作为cost,数据中0,1,2三类的比例为 0.2, 0.5, 0.3
, 那么常数输出所能达到的最小cost是 -(0.2*log(0.2)+0.5*log(0.5)+0.3*log(0.3))=1.03
。如果训练一个pass(或者更早)后,cost还大于这个数,那么可以认为训练不收敛,应该降低学习率。
5. 如何初始化参数¶
默认情况下,PaddlePaddle使用均值0,标准差为 \(\frac{1}{\sqrt{d}}\) 来初始化参数。其中 \(d\) 为参数矩阵的宽度。这种初始化方式在一般情况下不会产生很差的结果。如果用户想要自定义初始化方式,PaddlePaddle目前提供两种参数初始化的方式:
- 高斯分布。将
param_attr
设置成param_attr=ParamAttr(initial_mean=0.0, initial_std=1.0)
- 均匀分布。将
param_attr
设置成param_attr=ParamAttr(initial_max=1.0, initial_min=-1.0)
比如设置一个全连接层的参数初始化方式和bias初始化方式,可以使用如下代码。
hidden = fc_layer(input=ipt, param_attr=ParamAttr(initial_max=1.0, initial_min=-1.0),
bias_attr=ParamAttr(initial_mean=1.0, initial_std=0.0))
上述代码将bias全部初始化为1.0, 同时将参数初始化为 [1.0, -1.0]
的均匀分布。
6. 如何共享参数¶
PaddlePaddle的参数使用名字 name
作为参数的ID,相同名字的参数,会共享参数。设置参数的名字,可以使用 ParamAttr(name="YOUR_PARAM_NAME")
来设置。更方便的设置方式,是使得要共享的参数使用同样的 ParamAttr
对象。
简单的全连接网络,参数共享的配置示例为:
from paddle.trainer_config_helpers import *
settings(learning_rate=1e-4, batch_size=1000)
a = data_layer(name='feature_a', size=200)
b = data_layer(name='feature_b', size=200)
fc_param = ParamAttr(name='fc_param', initial_max=1.0, initial_min=-1.0)
bias_param = ParamAttr(name='bias_param', initial_mean=0.0, initial_std=0.0)
softmax_param = ParamAttr(
name='softmax_param', initial_max=1.0, initial_min=-1.0)
hidden_a = fc_layer(
input=a, size=200, param_attr=fc_param, bias_attr=bias_param)
hidden_b = fc_layer(
input=b, size=200, param_attr=fc_param, bias_attr=bias_param)
predict = fc_layer(
input=[hidden_a, hidden_b],
param_attr=[softmax_param, softmax_param],
bias_attr=False,
size=10,
act=SoftmaxActivation())
outputs(
classification_cost(
input=predict, label=data_layer(
name='label', size=10)))
这里 hidden_a
和 hidden_b
使用了同样的parameter和bias。并且softmax层的两个输入也使用了同样的参数 softmax_param
。
7. *-cp27mu-linux_x86_64.whl is not a supported wheel on this platform.¶
出现这个问题的主要原因是,系统编译wheel包的时候,使用的 wheel
包是最新的,
而系统中的 pip
包比较老。具体的解决方法是,更新 pip
包并重新编译PaddlePaddle。
更新 pip
包的方法是:
pip install --upgrade pip
8. python相关的单元测试都过不了¶
如果出现以下python相关的单元测试都过不了的情况:
24 - test_PyDataProvider (Failed)
26 - test_RecurrentGradientMachine (Failed)
27 - test_NetworkCompare (Failed)
28 - test_PyDataProvider2 (Failed)
32 - test_Prediction (Failed)
33 - test_Compare (Failed)
34 - test_Trainer (Failed)
35 - test_TrainerOnePass (Failed)
36 - test_CompareTwoNets (Failed)
37 - test_CompareTwoOpts (Failed)
38 - test_CompareSparse (Failed)
39 - test_recurrent_machine_generation (Failed)
40 - test_PyDataProviderWrapper (Failed)
41 - test_config_parser (Failed)
42 - test_swig_api (Failed)
43 - layers_test (Failed)
并且查询PaddlePaddle单元测试的日志,提示:
paddle package is already in your PYTHONPATH. But unittest need a clean environment.
Please uninstall paddle package before start unittest. Try to 'pip uninstall paddle'.
解决办法是:
- 卸载PaddlePaddle包
pip uninstall paddle
, 清理掉老旧的PaddlePaddle安装包,使得单元测试有一个干净的环境。如果PaddlePaddle包已经在python的site-packages里面,单元测试会引用site-packages里面的python包,而不是源码目录里/python
目录下的python包。同时,即便设置PYTHONPATH
到/python
也没用,因为python的搜索路径是优先已经安装的python包。
9. 运行Docker GPU镜像出现 “CUDA driver version is insufficient”¶
用户在使用PaddlePaddle GPU的Docker镜像的时候,常常出现 Cuda Error: CUDA driver version is insufficient for CUDA runtime version, 原因在于没有把机器上CUDA相关的驱动和库映射到容器内部。 具体的解决方法是:
$ export CUDA_SO="$(\ls usr/lib64/libcuda* | xargs -I{} echo '-v {}:{}') $(\ls /usr/lib64/libnvidia* | xargs -I{} echo '-v {}:{}')"
$ export DEVICES=$(\ls /dev/nvidia* | xargs -I{} echo '--device {}:{}')
$ docker run ${CUDA_SO} ${DEVICES} -it paddledev/paddlepaddle:latest-gpu
更多关于Docker的安装与使用, 请参考 PaddlePaddle Docker 文档 。
10. CMake源码编译, 找到的PythonLibs和PythonInterp版本不一致¶
这是目前CMake寻找Python的逻辑存在缺陷,如果系统安装了多个Python版本,CMake找到的Python库和Python解释器版本可能有不一致现象,导致编译PaddlePaddle失败。正确的解决方法是, 用户强制指定特定的Python版本,具体操作如下:
cmake .. -DPYTHON_EXECUTABLE=<exc_path> -DPYTHON_LIBRARY=<lib_path> -DPYTHON_INCLUDE_DIR=<inc_path>
用户需要指定本机上Python的路径:<exc_path>
, <lib_path>
, <inc_path>
11. CMake源码编译,Paddle版本号为0.0.0¶
如果运行 paddle version
, 出现 PaddlePaddle 0.0.0
;或者运行 cmake ..
,出现
CMake Warning at cmake/version.cmake:20 (message):
Cannot add paddle version from git tag
那么用户需要拉取所有的远程分支到本机,命令为 git fetch upstream
,然后重新cmake即可。
12. A protocol message was rejected because it was too big¶
如果在训练NLP相关模型时,出现以下错误:
[libprotobuf ERROR google/protobuf/io/coded_stream.cc:171] A protocol message was rejected because it was too big (more than 67108864 bytes). To increase the limit (or to disable these warnings), see CodedInputStream::SetTotalBytesLimit() in google/protobuf/io/coded_stream.h.
F1205 14:59:50.295174 14703 TrainerConfigHelper.cpp:59] Check failed: m->conf.ParseFromString(configProtoStr)
可能的原因是:传给dataprovider的某一个args过大,一般是由于直接传递大字典导致的。错误的define_py_data_sources2类似:
src_dict = dict()
for line_count, line in enumerate(open(src_dict_path, "r")):
src_dict[line.strip()] = line_count
define_py_data_sources2(
train_list,
test_list,
module="dataprovider",
obj="process",
args={"src_dict": src_dict})
解决方案是:将字典的地址作为args传给dataprovider,然后在dataprovider里面根据该地址加载字典。即define_py_data_sources2应改为:
define_py_data_sources2(
train_list,
test_list,
module="dataprovider",
obj="process",
args={"src_dict_path": src_dict_path})
完整源码可参考 seqToseq 示例。
13. 如何指定GPU设备¶
例如机器上有4块GPU,编号从0开始,指定使用2、3号GPU:
- 方式1:通过 CUDA_VISIBLE_DEVICES 环境变量来指定特定的GPU。
env CUDA_VISIBLE_DEVICES=2,3 paddle train --use_gpu=true --trainer_count=2
- 方式2:通过命令行参数
--gpu_id
指定。
paddle train --use_gpu=true --trainer_count=2 --gpu_id=2
14. 训练过程中出现 Floating point exception
, 训练因此退出怎么办?¶
Paddle二进制在运行时捕获了浮点数异常,只要出现浮点数异常(即训练过程中出现NaN或者Inf),立刻退出。浮点异常通常的原因是浮点数溢出、除零等问题。 主要原因包括两个方面:
- 训练过程中参数或者训练过程中的梯度尺度过大,导致参数累加,乘除等时候,导致了浮点数溢出。
- 模型一直不收敛,发散到了一个数值特别大的地方。
- 训练数据有问题,导致参数收敛到了一些奇异的情况。或者输入数据尺度过大,有些特征的取值达到数百万,这时进行矩阵乘法运算就可能导致浮点数溢出。
主要的解决办法是减小学习律或者对数据进行归一化处理。
15. 编译安装后执行 import paddle.v2 as paddle 报ImportError: No module named v2¶
先查看一下是否曾经安装过paddle v1版本,有的话需要先卸载:
pip uninstall py_paddle paddle
然后安装paddle的python环境, 在build目录下执行
pip install python/dist/paddle*.whl && pip install ../paddle/dist/py_paddle*.whl