# Paddle Fluid 开发者指南 --- ### ==1==. 为什么需要 PaddlePaddle Fluid? --- ### 两个基础问题 1. 如何描述机器学习模型和优化过程? - 完备自洽,表达能力足以支持潜在出现的各种计算需求 1. 如何充分利用资源高效计算? - 支持异步设备、多卡、分布式计算 - 降低计算/计算优化的开发成本 - …… --- ### 如何描述模型和优化过程?
一组连续执行的layers variable和operator构成的计算图 不再有模型的概念
2013 Caffe,Theano, Torch, PaddlePaddle
2015 TensorFlow, MxNet, Caffe2, ONNX, n-graph
2016 PyTorch, TensorFlow Eager Execution, **==PaddlePaddle Fluid==**
--- ###

目标

- 提高对各类机器学习任务的描述能力:能够描述潜在出现的任意机器学习模型。 - 代码结构逻辑清晰,各模块充分解耦:内外部贡献者能够专注于自己所需的功能模块,基于框架进行再次开发。 - 从设计上,留下技术优化的空间和潜力。 - 代码解耦后降低多设备支持、计算优化等的开发成本。 - 在统一的设计理念下,实现自动可伸缩,自动容错的分布式计算。 --- ## ==2.== Design Overview --- # Fluid: 系统形态 - [编译器式的执行流程,区分编译时和运行时](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/design/motivation/fluid_compiler.md)

--- #### 让我们在Fluid程序实例中,区分编译时和运行时 --- ### Fluid 编译时 - ==**定义前向计算**== ```python x = fluid.layers.data(name='x',shape=[13], dtype='float32') y_predict = fluid.layers.fc(input=x, size=1, act=None) y = fluid.layers.data(name='y', shape=[1], dtype='float32') cost = fluid.layers.square_error_cost(input=y_predict, label=y) avg_cost = fluid.layers.mean(x=cost) ``` - ==**添加反向、正则、优化**== ```python learning_rate = 0.01 sgd_optimizer = fluid.optimizer.SGD(learning_rate) sgd_optimizer.minimize(avg_cost) ``` --- ### `Program` vs. 计算图 - 在科学计算领域,计算图是一种描述计算的经典方式。下图展示了从前向计算图(蓝色)开始,通过添加反向(红色)和优化算法相关(绿色)操作,构建出整个计算图的过程: -

- Fluid ==使用`Program`而不是计算图==来描述模型和优化过程。`Program`由`Block`、`Operator`和`Variable`构成,相关概念会在后文详细展开。 - 编译时 Fluid 接受前向计算(这里可以先简单的理解为是一段有序的计算流)`Program`,为这段前向计算按照:前向 -> 反向 -> 梯度 clip -> 正则 -> 优化 的顺序,添加相关 `Operator`和`Variable`到`Program`到完整的计算。
--- ### Fluid 运行时 - ==**读入数据**== ```python train_reader = paddle.batch( paddle.reader.shuffle(paddle.dataset.uci_housing.train(), buf_size=500), batch_size=20) feeder = fluid.DataFeeder(place=place, feed_list=[x, y]) ``` - ==**定义执行程序的设备**== ```python place = fluid.CPUPlace() feeder = fluid.DataFeeder(place=place,feed_list=[x, y]) ``` - ==创建执行器(Executor),执行初始化 `Program`和训练`Program`== ```python exe = fluid.Executor(place) exe.run(fluid.default_startup_program()) PASS_NUM = 100 for pass_id in range(PASS_NUM): for data in train_reader(): avg_loss_value, = exe.run(fluid.default_main_program(), feed=feeder.feed(data), fetch_list=[avg_cost]) print(avg_loss_value) ``` --- ### 总结:框架做什么?用户做什么?
构建训练 执行训练
用户:描述前向运算
框架:添加反向运算
框架:添加优化运算
框架:添加内存优化
框架:添加并行/多设备/分布式相关的计算单元
框架:创建Operator(计算)+ Variable(数据)
框架:创建`Block`
框架:内存管理/设备管理
框架:执行计算
--- ###

总结:编译时

**用户编写一段Python程序,描述模型的前向计算** 1. 创建变量描述 `VarDesc` 1. 创建operators的描述 `OpDesc` 1. 创建operators的属性 1. 推断变量的类型和形状,进行静态检查:`inferShape` 1. 规划变量的内存复用 1. 创建反向计算 1. 添加优化相关的Operators 1. (可选)添加多卡/多机相关的Operator,生成在多卡/多机上运行的程序 --- ###

总结:运行时

**执行规划好的计算** 1. 创建`Executor` 1. 为将要执行的一段计算,在层级式的`Scope`空间中创建`Scope` 1. 创建`Block`,依次执行`Block`


Figure. 编译时运行时概览

--- ## ==3==. 用户如何描述计算? --- ### Fluid:==像写程序一样==定义计算 - 顺序执行 ```python x = fluid.layers.data(name='x',shape=[13], dtype='float32') y_predict = fluid.layers.fc(input=x, size=1, act=None) y = fluid.layers.data(name='y', shape=[1], dtype='float32') cost = fluid.layers.square_error_cost(input=y_predict, label=y) ``` - 条件分支: [swith](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/design/execution/switch.md)、[ifelse](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/design/execution/if_else_op.md) ```python a = fluid.Var(10) b = fluid.Var(0) switch = fluid.switch() with switch.block(): with switch.case(fluid.less_equal(a, 10)): fluid.print("Case 1") with switch.case(fluid.larger(a, 0)): fluid.print("Case 2") with switch.default(): fluid.print("Case 3") ``` >[A Lisp cond form may be compared to a continued if-then-else as found in many algebraic programming languages](https://www.cs.cmu.edu/Groups/AI/html/cltl/clm/node84.html). --- ### Fluid: ==像写程序一样==定义计算 - 循环:[while](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_machine_translation.py#L105) ```python d0 = layers.data("d0", shape=[10], dtype='float32') data_array = layers.array_write(x=d0, i=i) array_len = layers.fill_constant(shape=[1],dtype='int64', value=3) cond = layers.less_than(x=i, y=array_len) while_op = layers.While(cond=cond) with while_op.block(): d = layers.array_read(array=data_array, i=i) i = layers.increment(x=i, in_place=True) layers.array_write(result, i=i, array=d) layers.less_than(x=i, y=array_len, cond=cond) ``` - 完整实例请点查看 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests/test_while_op.py#L36-L44) - beam search [->]( https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_machine_translation.py#L105) --- ####

总结

1. 用户层提供的描述语法具有完备性、自洽性,有能力支持对复杂计算过程描述 1. 使用方式和核心概念可以类比编程语言,认知能够直接迁移 1. 能够支持:定义问题,逐步求解 --- ## ==3.== 核心概念 --- ### 编译时概念 :==变量和计算的描述== - `VarDesc` + `TensorDesc` + `OpDesc` -> `BlockDesc` -> `ProgramDesc` - https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/framework.proto - 什么是 Fluid Program - 在Fluid中,一个神经网络任务(训练/预测)被描述为一段`Program` - `Program`包含对`Variable`(数据)和 `Operator`(对数据的操作)的描述 - `Variable` 和 `Operator` 被组织为多个可以嵌套的`Block`,构成一段完整的`Fluid Program` >编译阶段最终,经过 Transpiler 的执行规划,变换处理,生成使用`protobuf`序列化后的`ProgramDesc`。可以发送给多卡或者网络中的其它计算节点执行 --- ### 编译时概念 :==**[Transpiler](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/design/motivation/fluid_compiler.md)**== 1. 接受一段`ProgramDesc`作为输入,生成一段新的`ProgramDesc` - *Memory optimization transpiler*:向原始`ProgramDesc` 中插入 `FreeMemoryOps`,在一次迭代优化结束前提前释放内存,使得能够维持较小的 memory footprint - *Distributed training transpiler*:将原始的`ProgramDesc`中转化为对应的分布式版本,生成两段新的`ProgramDesc`: 1. trainer进程执行的`ProgramDesc` 1. parameter server执行的`ProgramDesc` 1. ==**WIP**==: 接受一段`ProgramDesc`,生成可直接被`gcc`, `nvcc`, `icc`等编译的代码,编译后得到可执行文件 --- ### Transplier

--- ### 打印 `ProgramDesc`

- `default_startup_program`:创建可学习参数,对参数进行初始化 - `default_main_program`:由用户定义的模型,包括了前向、反向、优化及所有必要的计算 - 打印可读的 `Program` ```python from paddle.v2.fluid import debuger print debuger.pprint_program_codes(framework.default_main_program().desc) ``` --- ### 输出效果
variable in block 0 variable in block 0
--- ### 运行时概念 - 数据相关 - `Tensor` / `LoDTensor` / `Variable` - `Scope` - 计算相关 - `Block` - `Kernel`、`OpWithKernel`、`OpWithoutKernel`
protobuf messages C++ class objects
Data [VarDesc](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/framework.proto#L107) [Variable](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/variable.h#L24)
Operation [OpDesc](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/framework.proto#L35) [Operator](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/operator.h#L64)
Block BlockDesc Block
- 执行相关 :`Executor`
--- #### Tensor 和 LoD(Level-of-Detail) Tensor - Tensor 是$n$-dimensional arry的推广,LoDTensor是在Tensor基础上附加了序列信息 - Fluid中输入、输出,网络中的可学习参数全部统一使用LoDTensor(n-dimension array)表示 - 一个mini-batch输入数据是一个LoDTensor - 在Fluid中,RNN 处理变长序列无需padding,得益于 `LoDTensor`表示 - 可以简单将 LoD 理解为:`std::vector>` - 对非序列数据,LoD 信息为空
TensorFlow PaddlePaddle
RNN Support Support
recursive RNN Support Support
padding zeros Must No need
blob data type Tensor LODTensor
--- #### LoD 信息实例

- 图(a)的LoD 信息 ```cpp [0, 5, 8, 10, 14] ``` - 图(b)的 LoD 信息 ```cpp [[0, 5, 8, 10, 14] /*level=1*/, [0, 2, 3, 5, 7, 8, 10, 13, 14] /*level=2*/] ```
--- #### Tensor, Variable, Scope 之间的关系

1. `Block` 是一个实现层的概念,不在应用层暴露给用户。目前用户无法自行创建并利用`Block`,用户能够感知的只有`Program`这个概念。 1. 逻辑上,可以将 `Block` 类比为编程语言中的大括号:定义了一段作用域,其中运行一段代码 1. `Executor`会为每一个`Block`创建一个`Scope`,`Block`是可嵌套的,因此`Scope`也是可嵌套的 --- ### Executor
接口 说明

输入
1. `ProgramDesc`
2. `Scope`
3.`block_id`

解释执行步骤
1. 创建所有 Variables
2. 逐一创建 Operator 并运行
--- ### Operator/OpWithKernel/Kernel

- operator 无状态,Operator的核心是==Run==方法 - 一个operator可以注册多个kernel - operator 可以无 kernel:while_op 、ifelse op
--- #### Fluid Operator vs. PaddlePaddle layers
Layer Operator

1. 内部维护状态
2. 包含forward和backward方法
1. 内部无状态
2. 只有Run方法
--- ### ==4.== 内存管理 --- ### 目标 - 为异构设备提供统一的内存分配、回收接口 - 最小化管理内存所需的时间,最小化管理开销 - 减少内存碎片 - 将内存管理与计算(Operators/Kernels)完全剥离 - 统一内存管理是内存优化的基础 --- ### Memory 接口 - 内存管理模块向上层应用逻辑提供三个基础接口: ```cpp template void* Alloc(Place place, size_t size); template void Free(Place place, void* ptr); template size_t Used(Place place); struct Usage : public boost::static_visitor { size_t operator()(const platform::CPUPlace& cpu) const; size_t operator()(const platform::CUDAPlace& gpu) const; }; ``` - 模板参数 `Place` 指示内存分配发生的设备 - 实现时,需特化支持的 `Place`, 提供以上三个接口的实现 --- ### 代码结构 内存管理模块可以理解为由以下两部分构成: 1. SystemAllocator:实际从物理设备上分配、释放的内存的接口 1. BuddyAllocator:内存管理算法 --- ### System Allocator - SystemAllocator 是实现物理内存分配、回收的基类 - 不同设备上的内存分配和回收终将转化为标准接口调用 - 为不同设备实现MemoryAllocator,继承自SystemAllocator ```cpp class SystemAllocator { public: virtual ~SystemAllocator() {} virtual void* Alloc(size_t& index, size_t size) = 0; virtual void Free(void* p, size_t size, size_t index) = 0; virtual bool UseGpu() const = 0; }; ``` --- ### CPU/GPU Allocator ```cpp class CPUAllocator : public SystemAllocator { public: virtual void* Alloc(size_t& index, size_t size); virtual void Free(void* p, size_t size, size_t index); virtual bool UseGpu() const; }; #ifdef PADDLE_WITH_CUDA class GPUAllocator : public SystemAllocator { public: virtual void* Alloc(size_t& index, size_t size); virtual void Free(void* p, size_t size, size_t index); virtual bool UseGpu() const; private: size_t gpu_alloc_size_ = 0; size_t fallback_alloc_size_ = 0; }; #endif ``` - CPUAllocator和GPUAllocator分别继承自SystemAllocator,分别调用相应的标准库函数实现物理内存的分配和释放。 - 一旦大块、连续的物理内存分配之后,将通过内存管理算法实现内存的按块分配、回收、重用等。 --- ### CPU Allocator - CPU 内存的分配提供两种选项: 1. non-pinned memory:可分页内存 2. pinned memory:页锁定内存 - 分配过大的页锁定内存有可能因为系统可使用的分页内存减少,影响系统性能,默认CPU下分配的是可分页内存 - 通过gflags进行设置一次性分配内存的大小以及是否使用页锁定内存。 ```cpp DEFINE_bool(use_pinned_memory, true, "If set, allocate cpu pinned memory."); DEFINE_double(fraction_of_cpu_memory_to_use, 1, "Default use 100% of CPU memory for PaddlePaddle," "reserve the rest for page tables, etc"); ``` --- ### GPU Allocator - 通过 cudaMalloc 分配GPU显存 - GPUAllocator::Alloc 首先会计算指定GPU device上的可用显存 - 如果可用显存小于请求分配大小,调用cudaMalloc进行分配 - 如果可用显存不足,目前会报错退出。 - 通过gflags控制GPU下一次性分配显存的大小: ```cpp DEFINE_double(fraction_of_gpu_memory_to_use, 0.92, "Default use 92% of GPU memory for PaddlePaddle," "reserve the rest for page tables, etc"); ``` --- #### 内存管理算法: [Buddy Memory Allocation](https://en.wikipedia.org/wiki/Buddy_memory_allocation) - Memory Arena:一次性分配大块连续内存,之后会基于这块内存进行内存管理:动态分配、释放、重用内存块。 - 伙伴内存分配: - 将内存划分为 2 的幂次方个分区,使用 best-fit 方法来分配内存请求。 - 当释放内存时,检查 buddy 块,查看相邻的内存块是否也已被释放。如果是,将内存块合并,以最小化内存碎片。 - 分配的内存在物理内存的自然边界对齐,提高内存访问效率。 - 算法的时间效率高,单使用 best-fit 方法的缘故,会产生一定的内存浪费 --- ### Buddy Allocator - BuddyAllocator 是一个单例,每个设备(如: GPU/CPU(0)/GPU(1)) 拥有一个BuddyAllocator - BuddyAllocator 内部拥有一个私有成员变量 SystemAllocator - 当请求的内存超过BuddyAllocator管理的空余内存时,将会调用SystemAllocator去指定的设备上分配物理内存 --- ### 实例:CPU 下内存管理接口的实现 - 对上层应用,统一通过BuddyAllocator来实现内存的分配、释放以及用量查询 ```cpp template <> void* Alloc(platform::CPUPlace place, size_t size) { VLOG(10) << "Allocate " << size << " bytes on " << platform::Place(place); void* p = GetCPUBuddyAllocator()->Alloc(size); VLOG(10) << " pointer=" << p; return p; } template <> void Free(platform::CPUPlace place, void* p) { VLOG(10) << "Free pointer=" << p << " on " << platform::Place(place); GetCPUBuddyAllocator()->Free(p); } template <> size_t Used(platform::CPUPlace place) { return GetCPUBuddyAllocator()->Used(); } ``` --- ### ==5.== 多设备支持 --- ### 多设备支持(一) - step 1:添加Place类型,由用户实现添加到框架 - 可以将Place类型理解为一个整数加上一个枚举型,包括:设备号 + 设备类型

- DeviceContext - 不同的Place会对应一个相应的DeviceContext,用于组织管理与设备相关的信息 - 例如,GpuDeviceContext中会管理Cuda stream - 目前实现中一些特殊的库也会对应有自己的DeviceContext:例如: ```cpp class MKLDNNDeviceContext : public CPUDeviceContext {……} ``` - 每种设备对应的DeviceContext需要管理的内容不尽相同,视具体需求来实现
--- ### 多设备支持(二) - step 2: 增加KernelType,为相应的KernelType注册Kernel对象,由用户实现注册给框架 可以按照: 1. Place 执行设备 1. DataType 执行数据类型 FP32/FP64/INT32/INT64 1. Memory layout: 运行时 Tensor 在内存中的排布格式 NCHW、 NHWC 1. 使用的库 来区分Kernel,为同一个operator注册多个 Kernel。 ```cpp struct OpKernelType { proto::DataType data_type_; DataLayout data_layout_; platform::Place place_; LibraryType library_type_; } ``` --- ### 多设备支持(三) step 3: 运行时的 KernelType 推断和Kernel切换,按需要修改Kernel推断和Kernel切换规则 - Expected Kernel:期待调用的Kernel:由(1)`Place`和计算精度决定;或(2)用户在配置中显示指定使用的计算库,如`cudnn`、`mkldnn`等。 - Actual Kernel:运行时从`Operator`的输入(`Variable`)可以推断出实际需要的`KernelType` - 当Expected Kernel和Actual Kernel不一致的时候,框架会插入`data_transformer`或者`data_layerout_transform`等,保证Expected Kernel可以执行,包括: - CPUPlace -> GPUPlace :跨设备内存复制 - NCHW -> nChw8c :Layout转换 - FP32 -> FP16 :精度转换 _**尚未支持**_ - …… - 以上过程实现在OperatorWithKernel类的Run方法中 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/operator.cc#L497) --- ## ==6.== while_op --- ### while_op - 循环执行一段`Program`,直到条件operator判断循环条件不满足时终止循环 - while_op 的特殊之处: 1. while_op 没有 kernel 1. while_op 拥有自己的`Block`,会形成一段嵌套的`Block` 1. ==while_op 内部创建了一个 Executor,来循环执行`Block`== - while_op 输入输出 : LoDTensorArray ```cpp namespace paddle { namespace framework { using LoDTensorArray = std::vector; } } ``` - 每一次循环,从原始输入中“切出”一个片段 - LoDTensorArray 在Python端暴露,是Fluid支持的基础数据结构之一,用户可以直接创建并使用 --- ### while_op [Run](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/while_op.cc#L42) 方法概览 ```cpp void Run(const framework::Scope &scope, const platform::Place &dev_place) const override { PADDLE_ENFORCE_NOT_NULL(scope.FindVar(Input(kCondition))); auto &cond = scope.FindVar(Input(kCondition))->Get(); PADDLE_ENFORCE_EQ(cond.dims(), paddle::framework::make_ddim({1})); framework::Executor executor(dev_place); auto *block = Attr(kStepBlock); auto *program = block->Program(); auto step_scopes = scope.FindVar(Output(kStepScopes))->GetMutable(); while (cond.data()[0]) { auto ¤t_scope = scope.NewScope(); step_scopes->push_back(¤t_scope); executor.Run(*program, ¤t_scope, block->ID(), false /*create_local_scope*/); } } ``` --- ### while_op 的重要应用:Dynamic RNN --- ### 什么是 `dynamicRNN` ?
1. 用户可以自定义在一个时间步之内的计算, 框架接受序列输入数据,在其上循环调用用户定义的单步计算 1. 可学习参数在多个时间步之间共享 1. `dynamicRNN` 由 `while_op` 实现 1. 如果`dynamicRNN`中定义了`memory`,将会构成一个循环神经网络,否则其行为就等于在输入序列上循环调用预定义的单步计算
--- #### `dynamic RNN` 用户接口

- `dynamicRNN` 中的重要元素 1. **step input**: `dynamicRNN` 每个时间步的输入 1. **step function**: 用户定义的单步计算 1. **memory**: 用于形成循环连接 1. **external/static memory**:单步计算的每一步都可以全部读取到的外部输入
--- #### dynamicRNN 中的 Memory `dynamicRNN`中`memory`的行为非常类似于 C++ 中的引用变量 - `memory` “指向” 一个operator的输出变量,记作: A - `memory` 可以被 LoDTensor 初始化(当LoD信息为空时,为非序列,否则为序列),默认`memory`被初始化为零 - `memory` 在 operator A 前向计算之后,进行前向计算 - 当 `memory` 的前向计算会 "指向" A 的输出 LoDTensor - `memory` 的输出可以是另一个 operator 的输入,于是形成了“循环”连接 --- ### DynamicRNN 实现细节 - `while_op` 无法独立构成dynamicRNN,必须和一组相关的 operator 及数据结构配合 - 依赖的 operators (这里仅列出最重要的,并非全部): - `lod_rank_table` operator - `lod_tensor_to_array` operator - `array_to_lod_tensor` operator - `shrink_memory` operator - 依赖的数据结构 - `TensorArray` - `LoDRankTable` - 在Fluid中,RNN接受变长序列输入,无需填充,以上数据结构和相关的operator配合工作,实现了对变长输入以batch计算 --- ### `dynamicRNN` 如何实现 batch 计算 ? - 问题: - RNN 可以看作是一个展开的前向网络,前向网络的深度是最长序列的长度 - 如果不对变长序列进行填充,将它们填充到一样长度,每个mini-batch输入将会不等长,每个样本展开长度不一致,导致前向和反向计算实现困难 ---- ##### 实例 :RNN encoder-decoder with attention - 以机器翻译的RNN encoder-decoder 模型(涉及了`dynamicRNN`的所有设计要素)为例,下图是 RNN encoder-decoder 的原始输入:


Figure. RNN encoder-decoder 原始batch 输入数据

- source word sequences 是encoder RNN的输出,是一个LoDTensor - target word sequences 是look_uptable的输入,是一个LoDTensor - 上图中一个矩形方块是CPU/GPU内存中一片连续的内存空间,表示一个dense vector
--- ### `dynamicRNN` 如何实现 batch 计算 ? 1. 对一个mini batch中不等长样本进行排序,最长样本变成batch中的第一个,最短样本是batch中最后一个 - `LoDTensor` -> `LoDRankTable` :heavy_plus_sign: `lod_rank_table operaator` - 可以将`LoDRankTable`理解为对LoDTensor中的多个序列按照长度排序LoDRankTable 存储了排序之后的index 2. 构建每个时间步的batch输入:随着时间步增加,每个时间步的batch输入可能会逐渐缩小 - `TensorArray` :heavy_plus_sign: `lod_tensor_to_array` -> `LoDTensor` (without LoD) 3. 每个时间步输出写入一个输出 `LoDTensorArray` 3. `dynamicRNN`循环结束后, 按照`LoDRankTable`中记录的信息对输出`LoDTensorArray`重排序,还原会原始输入顺序 - `TensorArray` :heavy_plus_sign: `array_to_lod_tensor` -> `LoDTensor` --- ### 运行实例

--- ### 运行实例

- 执行到第5~7个batch时,batch size将会缩小 --- ### 运行实例

- 第5 ~ 7个batch时RNN的`memory`会发生什么? - `memory` 指向某个operator的输出Tensor,在该operator前向计算之后,“取回”其计算结果 - 5 ~ 7时,遇到了序列的结束,==下一个时间步计算不再需要在已经结束的序列上展开== - 在`dynamicRNN`中`shrink_memory` operator 用来缩小`memory`的batch输入 --- ### 运行实例:batch 1 ~ 2


Figure. 第1、2个batch输入dynamicRNN的batch输入

--- ### 运行实例:batch 3 ~ 4


Figure. 第3、4个batch输入dynamicRNN的batch输入

--- ### 运行实例:batch 5 ~ 7


Figure. 第5、6、7个batch输入dynamicRNN的batch输入

--- ### ==7.== Fluid 代码结构 --- ### Fluid 代码结构
代码结构 模块结构

--- ### ==8.== 文档总结 --- - 设计概览 - 重构概览 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/refactorization.md) - fluid [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/fluid.md) - fluid_compiler [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/design/motivation/fluid_compiler.md) - 核心概念 - variable 描述 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/var_desc.md) - Tensor [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/framework/tensor.md) - LoDTensor [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/framework/lod_tensor.md) - TensorArray [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/tensor_array.md) - Program [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/program.md) - Block [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/block.md) - Scope [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/scope.md) --- - 重要功能模块 - backward [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/backward.md) - 内存优化 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/memory_optimization.md) - evaluator [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/executor.md) - python API [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/python_api.md) - regularization [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/regularization.md) - 开发指南 - 支持新设硬件设备库 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/support_new_device.md) - 添加新的Operator [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/howto/dev/new_op_cn.md) - 添加新的Kernel [->]( https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/howto/dev/new_op_kernel_en.md) --- ### ==9.== 开发指南 --- #### 建议开发环境:使用 Docker 编译和测试 Docker编译PaddlePaddle源码: [->](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/build_and_install/docker_install_cn.html) PaddlePaddle 在 Dockerhub 地址:[->]( https://hub.docker.com/r/paddlepaddle/paddle/tags/) 1. 获取PaddlePaddle的Docker镜像 ```bash docker pull paddlepaddle/paddle:latest-dev ``` 1. 启动 docker container ```bash docker run -it -v $PWD/Paddle:/paddle paddlepaddle/paddle:latest-dev /bin/bash ``` 1. 进入docker container后,从源码编译,请参考文档 [->]( http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/build_and_install/build_from_source_cn.html) --- ### 一些说明 1. PaddlePaddle的Docker镜像为了减小体积,默认没有安装vim,可以在容器中执行`apt-get install -y vim`来安装vim。 1. 开发推荐使用tag为`latest-dev`的镜像,其中打包了所有编译依赖。`latest`及`lastest-gpu`是production镜像,主要用于运行PaddlePaddle程序。 2. 在Docker中运行GPU程序,推荐使用nvidia-docker,[否则需要将CUDA库和设备挂载到Docker容器内](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/build_and_install/docker_install_cn.html)。 ```bash nvidia-docker run -it -v $PWD/Paddle:/paddle paddlepaddle/paddle:latest-dev /bin/bash ``` --- ### [如何贡献](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/dev/contribute_to_paddle_cn.html) - ==提交PullRequest前请务必阅读==: [->](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/dev/contribute_to_paddle_cn.html) - 代码要求 1. 代码注释遵守 Doxygen 的样式 1. 确保编译器选项 WITH_STYLE_CHECK 已打开,并且编译能通过代码样式检查 1. 所有代码必须具有单元测试,且能够通过所有单元测试 - 使用 `pre-commit` 钩子提交Pull Request 1. 帮助格式化源代码(C++,Python) 1. 在提交前自动检查一些基本事宜:如每个文件只有一个 EOL,Git 中不要添加大文件等 1. 安装pre-commit,并在PaddlePaddle根目录运行: ```bash ➜ pip install pre-commit ➜ pre-commit install ``` --- ### 如何贡献 1. 开始开发之前请先建立issue。 - 让其它同学知道某项工作已经有人在进行,以避免多人开发同一功能的情况。 1. 提交PR必须关联相关的issue。做法请参考:[->](https://help.github.com/articles/closing-issues-using-keywords/) - 目的:为了在提交的版本中留有记录描述这个PR是为了开发什么样的功能,为了解决什么样的问题。 - 当PR被merge后,关联的issue会被自动关闭。 1. PR review 中,reviewer的每条comment都必须回复。 - 如修改完可直接回复:Done。 - 目的:review comment 中可能会有(1)询问类型的问题;(2)可以在下一个PR修改的问题;(3)comment意见不合理等。需要明确回复,以便reviewer和其他人有历史可查,便于区分是否已经进行修改,或者准备下一个PR修改,或者意见不合理可以不用进行修改。 --- ### ==10.== 添加新的 Operator --- ### 概念简介 添加一个新的operator,会涉及实现以下C++类的派生类: 1. `framework::OperatorBase`: Operator(简写,Op)基类。 1. `framework::OpKernel`: Op计算函数的基类,称作Kernel。 1. `framework::OperatorWithKernel`:继承自OperatorBase,Op有计算函数,称作有Kernel。 1. `class OpProtoAndCheckerMaker`:描述该Op的输入、输出、属性、注释,主要用于Python API接口生成 依据是否包含kernel,可以将Op分为两种: 1. 包含Kernel的Op:继承自OperatorWithKernel,==绝大多数operator都属于这一类== 1. 不包含kernel的Op,继承自OperatorBase,只有少量Op属于这一类,例如while_op,ifelse_op 这里主要介绍带Kernel的Op如何编写。 --- #### 添加新的Operator需要修改/添加哪些文件?
内容 定义位置
OpProtoMake定义 `.cc`文件,Backward Op不需要OpProtoMaker
Op定义 `.cc`文件
Kernel实现 CPU、CUDA共享Kernel实现在`.h`文件中,否则,CPU 实现在`.cc`文件中,CUDA 实现在`.cu`文件中。
注册Op Op注册实现在`.cc`文件;Kernel注册CPU实现在`.cc`文件中,CUDA实现在`.cu`文件中
- 添加 Operator 之前请阅读:[Operator 命名规范](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/63cca04cfd488a4dab6d6273fd04a8017ef45932/doc/fluid/dev/name_convention.md)及[Operator Markdown注释规范](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/63cca04cfd488a4dab6d6273fd04a8017ef45932/doc/fluid/dev/op_markdown_format.md)。 - 实现新的op都添加至目录[paddle/operators](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/tree/develop/paddle/fluid/operators)下,文件命名以`*_op.h`(如有) 、 `*_op.cc` 、`*_op.cu`(如有)结尾。 - 根据文件名自动构建op和Python端绑定,请务必遵守以上命名,否则需要进一步修改PyBind相关文件及CMakeLists.txt
--- ###### 实现带Kernel的Operator step1: 定义ProtoMaker类 下面均以[clip_op](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/clip_op.h)为例进行介绍 - clip_op计算公式:$Out = \min(\max(X, min), max)$ - 首先定义`ProtoMaker`来描述该Op的输入、输出,并添加注释(*下面代码段的中注释进行了简化,实现时需按照规范添加注释*): ```cpp template class ClipOpMaker : public framework::OpProtoAndCheckerMaker { public: ClipOpMaker(OpProto* proto, OpAttrChecker* op_checker) : OpProtoAndCheckerMaker(proto, op_checker) { AddInput("X","(Tensor)The input of clip op."); AddOutput("Out", "(Tensor),The output of clip op."); AddAttr( "min", "(float),Minimum value."); AddAttr( "max", "(float),Maximum value."); AddComment(R"DOC( …… )DOC"); } }; ``` --- ###### 实现带Kernel的Operator step2: 定义Operator类 下面的代码段实现了`clip_op`的定义: ```cpp class ClipOp : public framework::OperatorWithKernel { public: using framework::OperatorWithKernel::OperatorWithKernel; void InferShape(framework::InferShapeContext* ctx) const override { PADDLE_ENFORCE(ctx->HasInput("X"), "Input(X) of ClipOp should not be null."); PADDLE_ENFORCE(ctx->HasOutput("Out"), "Output(Out) of ClipOp should not be null."); auto x_dims = ctx->GetInputDim("X"); auto max = ctx->Attrs().Get("max"); auto min = ctx->Attrs().Get("min"); PADDLE_ENFORCE_LT(min, max, "max should be greater than min."); ctx->SetOutputDim("Out", x_dims); ctx->ShareLoD("X", /*->*/ "Out"); } }; ``` --- ### Operator 类中需要完成的工作 1. clip_op 继承自`OperatorWithKernel`, ```cpp using framework::OperatorWithKernel::OperatorWithKernel; ``` 表示使用基类`OperatorWithKernel`的构造函数。 1. 重写`InferShape`接口。 - `InferShape` 为const函数,不能修改Op的成员变 - `InferShape` 的参数为 `const framework::InferShapeContext &ctx`,从中可获取到输入输出以及属性 - `InferShape` 会被调用两次,一次是编译时(创建op),一次是运行时(调用op的`Run`方法时),需要完成以下功能: 1. 做检查, 尽早报错:检查输入数据维度、类型等是否合法 2. 设置输出Tensor的形状 通常`OpProtoMaker`和`Op`类的定义写在`.cc`文件中。 --- ### 补充说明 1. `InferShape`目前支持两种实现方式,二者最后都会生成一个functor注册给OpInfo结构体。 1. 继承framework::InferShapeBase,实现为一个functor(参考 [mul_op](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/mul_op.cc#L22)) 2. override InferShape函数(参考 [clip_op](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/clip_op.cc#L24)) 1. 什么是`functor` ? - 类或结构体仅重载了`()`,一般是可被多个kernel复用的计算函数。 ```cpp template class CrossEntropyFunctor { public: void operator()(const platform::CPUDeviceContext& ctx, framework::Tensor* out, const framework::Tensor* prob, const framework::Tensor* labels, const bool softLabel) { …… } }; ``` - 在 clip_op 内也会看到将一段计算函数抽象为functor的使用法: [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/clip_op.h#L27)。 --- ###### 实现带Kernel的Operator step3: 定义OpKernel类 - `ClipKernel`继承自`framework::OpKernel`,带有下面两个模板参数: 1. `typename DeviceContext`: 表示设备类型,不同设备共享同一个Kernel时,需添加该模板参数。不共享时,需要提供针对不同设备的特化实现。 1. `typename T` : 表示支持的数据类型,如`float`, `double`等 - 在`ClipKernel`类中重写`Compute`方法 1. `Compute`接受输入参数:`const framework::ExecutionContext& context` - `ExecutionContext` 是从 `Scope`中将运行时Op的输入、输出`Variable`组织在一起,使得Op在调用`Compute`方法时,能够简单地通过名字拿到需要的输入输出`Variable` - 与`InferShapeContext`相比,`ExecutionContext` 中增加了设备类型 1. 在`Compute`函数里实现`OpKernel`的具体计算逻辑 --- #### ClipKernel 代码概览 ```cpp template class ClipKernel : public framework::OpKernel { public: void Compute(const framework::ExecutionContext& context) const override { auto max = context.Attr("max"); auto min = context.Attr("min"); auto* x = context.Input("X"); auto* out = context.Output("Out"); T* out_data = out->mutable_data(context.GetPlace()); const T* x_data = x->data(); int64_t numel = x->numel(); Transform trans; trans(context.template device_context(), x_data, x_data + numel, out_data, ClipFunctor(min, max)); } }; ``` - 为了使`OpKernel`的计算过程书写更加简单,并且CPU、CUDA的代码可以复用, Fluid 使用 Eigen 作为基础的矩阵运算库 - Fluid对Eigen unsupported Tensor提供了一些基本的封装,可以在`Compute`接口中直接调用 - 关于在PaddlePaddle中如何使用Eigen库,请参考[使用文档](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/dev/use_eigen_cn.md)。 --- ###### 实现带Kernel的Operator step4: 实现反向Op - ==**反向Op没有`ProtoMaker`**==,除此之外定义与实现方式前向Op完全一致,不再赘述 - 这里仅对反向Op的输入输出进行说明: 1. 反向Op的输入 - 前向Op的输出 - 反向传播过程中传递给当前Op的梯度 - 需要注意,Fluid中,不区分Cost Op和中间层Op,所有Op都必须正确处理接收到的梯度 2. 反向Op的输出 - 对可学习参数的求导结果 - 对所有输入的求导结果 --- ###### 实现带Kernel的Operator step5: 注册Op及Kernel 至此Op和Op kernel都已经实现完毕,接下来,需要在`.cc`和`cu`文件中注册op和kernel 1. 在`.cc`文件中注册前向、反向Op类,注册CPU Kernel。 ```cpp namespace ops = paddle::operators; REGISTER_OP(clip, ops::ClipOp, ops::ClipOpMaker, clip_grad, ops::ClipOpGrad); REGISTER_OP_CPU_KERNEL( clip, ops::ClipKernel); REGISTER_OP_CPU_KERNEL( clip_grad, ops::ClipGradKernel); ``` - 在上面的代码片段中: 1. `REGISTER_OP` : 注册`ops::ClipOp`类,类型名为`clip`,该类的`ProtoMaker`为`ops::ClipOpMaker`,注册`ops::ClipOpGrad`,类型名为`clip_grad` 1. `REGISTER_OP_WITHOUT_GRADIENT` : 用于注册没有反向的Op,例如:优化算法相关的Op 1. `REGISTER_OP_CPU_KERNEL` :注册`ops::ClipKernel`类,并特化模板参数为`paddle::platform::CPUPlace`和`float`类型,同理,注册`ops::ClipGradKernel`类 1. 按照同样方法,在`.cu`文件中注册GPU Kernel - 如果CUDA Kernel的实现基于Eigen,需在 `.cu`的开始加上宏定义 `#define EIGEN_USE_GPU` --- ##### 编译和Python端绑定 - 运行下面命令可以仅编译新添加的Op: ``` make mul_op ``` - 需注意,运行单元测试需要编译整个工程 - 如果遵循前文的文件命名规则,构建过程中,会自动为新增的op添加Python端绑定,并链接到生成的lib库中 --- ###### 实现带Kernel的Operator step6: 添加前向单测及梯度检测 - 新增Op的单元测试统一添加至:[python/paddle/v2/fluid/tests/unittests](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/tree/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests)目录 - 前向Operator单测 1. Op单元测试继承自`OpTest`,各项具体的单元测试在`TestClipOp`里完成,所有单测case都以`TestXX`命名 1. 单元测试Operator,需要: 1. 在`setUp`函数定义输入、输出,以及相关的属性参数 1. 生成随机的输入数据 1. 在Python脚本中实现与前向operator相同的计算逻辑,得到输出值,与operator前向计算的输出进行对比 1. 反向梯度检测流程测试框架已经实现,直接调用相应接口`check_grad`即可 - `clip_op` 单测代码请参考 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests/test_clip_op.py),这里不再展开 --- #### 编译执行单测 - `python/paddle/v2/framework/tests` 目录下新增的 `test_*.py` 单元测试会被自动加入工程进行编译 - 运行单元测试测时需要编译整个工程,并且编译时需要打开`WITH_TESTING`, 即`cmake paddle_dir -DWITH_TESTING=ON` - 编译成功后,执行下面的命令来运行单元测试: ```bash make test ARGS="-R test_mul_op -V" ``` 或者: ``` ctest -R test_mul_op ``` --- ### 添加Op的一些注意事项 - 为每个Op创建单独的`*_op.h`(如有)、`*_op.cc`和`*_op.cu`(如有)。不允许一个文件中包含多个Op,将会导致编译出错。 - 注册Op时的类型名,需要和该Op的名字一样。不允许在`A_op.cc`里面,注册`REGISTER_OP(B, ...)`,会导致单元测试出错。 - 如果Op没有实现CUDA Kernel,不要创建空的`*_op.cu`,会导致单元测试出错。 - 如果多个Op依赖一些共用的函数,可以创建非`*_op.*`格式的文件来存放,如`gather.h`文件。 --- ### ==10.== 使用相关问题 --- ### 定义前向计算 - 当在python端执行时: ```python import paddle.v2.fluid as fluid ``` [`framework.py`](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/framework.py#L1040)定义了两个全局`Program`: ```python # program is a global instance. _main_program_ = Program() _startup_program_ = Program() ``` - 前向定义的过程就是不断往`mian_program`中添加Op和Variable - 如果需要执行一个新的`mian_program`时,可以调用调用: ```python def switch_main_program(program): """ Switch the main program to a new program. This funtion returns the previous main program. """ …… ``` --- ### 自定义参数的初始化 - 调用`fluid.ParamAttr(……)`接口,自定义参数的初始化 ```python w_param_attrs = ParamAttr(name=None, initializer=UniformInitializer(low=-1.0, high=1.0, seed=0), learning_rate=1.0, regularizer=L1Decay(1.0), trainable=True, clip=GradientClipByValue(-1.0, 1.0), ) y_predict = fluid.layers.fc(input=x, size=1, param_attr=w_param_attrs) ``` - 补充问题:如何创建 `Variable` ```python cur_program = Program() cur_block = cur_program.current_block() new_var = cur_block.create_var(name="X", shape=[-1, 16, 16], dtype="float32") ``` --- ### 添加反向Op - 调用`fluid.backward.append_backward(X)`(`X`是一个Variable),来为一段前向`ProgramDesc`添加反Op ```python data = fluid.layers.data(name="data", shape=(2,3,4)) out = fluid.layers.fc(input=data,size=128,act=None) loss = fluid.layers.reduce_sum(out) fluid.backward.append_backward(loss=loss) ``` - 添加优化相关的Op ```python sgd_optimizer = fluid.optimizer.SGD(learning_rate=0.001) sgd_optimizer.minimize(loss) ``` - 可以随时调用`print(fluid.default_main_program())`来输出当前的`main_program` - 当构建完成整个`Program`后,调用下面的接口执行内存优化: ```python fluid.memory_optimize(fluid.default_main_program()) ``` - _注:内存优化目前仍在持续开发中,有可能不够稳定。_ --- ### 总结:编译时执行流程 - 用户定义前向计算 - 添加反向Op到`default_main_program` - 添加 gradient clipping Op 到 - 添加 regularization Op 到`default_main_program` - 为指定的优化算法,添加相关的状态 variable of optimizer 到`default_startup_program` - 状态相关 variable是指如学习率, 历史 momentum, 二阶momentum等 - 添加初始化 variable 的Op 到 `default_startup_program` - 为整个网络最后一个op,添加设置其接受到的梯度的Op到`default_main_program` - 进行内存优化规划 --- ### Feed 数据 (一):通过 feed 字典 - 执行executor的run方法时,指定feed字典,feed op 会将指定的数据放到`x`和`y`两个Variable中 ```python y_data = np.random.randint(0, 8, [1]).astype("int32") y_tensor = core.Tensor() y_tensor.set(y_data, place) x_data = np.random.uniform(0.1, 1, [11, 8]).astype("float32") x_tensor = core.Tensor() x_tensor.set(x_data, place) …… cost = exe.run( fluid.default_main_program(), feed={'x': x_tensor, 'y': y_tensor}, fetchlist=[avg_cost]) ``` - 这种方法较为底层,一般用于单测中 --- ### Feed 数据 (二):使用 DataFeeder接口 - 编写一个data_reader函数,data_reader是一个Python generator ```python def demo_reader(): def random_generator(): yield np.random.uniform(0.1, 1, [4]), np.random.randint(0, 1, [1]) return random_generator ``` - 在训练任务中使用 DataFeeder 接口 ```python cost = exe.run( fluid.default_main_program(), feed={'x': x_tensor, 'y': y_tensor}, fetchlist=[avg_cost]) train_reader = paddle.batch( paddle.reader.shuffle(demo_reader(), buf_size=500), batch_size=4) feeder = fluid.DataFeeder(place=place, feed_list=[x, y]) for data in train_reader(): cost = exe.run( fluid.default_main_program(), feed=feeder.feed(data), fetch_list=[cost]) ``` --- ### 常见问题 - 如何使用 evaluator ? [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_label_semantic_roles.py#L168) ```python accuracy = fluid.evaluator.Accuracy(input=predict, label=label) for pass_id in range(PASS_NUM): accuracy.reset() for data in train_reader(): loss, acc = exe.run(fluid.default_main_program(), feed=feeder.feed(data), fetch_list=[avg_cost] + accuracy.metrics) pass_acc = accuracy.eval(exe) # acc 当前一个batch 的 accuracy # pass_acc 当前batch 的 accuracy pass_total_acc = accuracy.eval(exe) # 整个pass的accuracy ``` - 如何在训练中测试?[->](https://github.com/dzhwinter/benchmark/blob/master/fluid/vgg16.py#L144) - 如何保存训练好的模型?[->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_recognize_digits.py#L143) - 如何加载训练好的模型进行预测?[->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_recognize_digits.py#L154) - 如何在同一个训练任务中定义多个Program,并交替运行? [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/demo/fc_gan.py) - 如何profile?Fluid 实现了profile 工具,可以直接调用。请参考示例 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests/test_profiler.py) ---