接口 |
说明 |
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输入 1. `ProgramDesc` 2. `Scope` 3.`block_id`
解释执行步骤 1. 创建所有 Variables 2. 逐一创建 Operator 并运行
|
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### Operator/OpWithKernel/Kernel
- operator 无状态,Operator的核心是==Run==方法
- 一个operator可以注册多个kernel
- operator 可以无 kernel:while_op 、ifelse op
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#### Fluid Operator vs. PaddlePaddle layers
Layer |
Operator |
|
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1. 内部维护状态 2. 包含forward和backward方法 |
1. 内部无状态 2. 只有Run方法 |
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### ==4.== 内存管理
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### 目标
- 为异构设备提供统一的内存分配、回收接口
- 最小化管理内存所需的时间,最小化管理开销
- 减少内存碎片
- 将内存管理与计算(Operators/Kernels)完全剥离
- 统一内存管理是内存优化的基础
---
### Memory 接口
- 内存管理模块向上层应用逻辑提供三个基础接口:
```cpp
template
void* Alloc(Place place, size_t size);
template
void Free(Place place, void* ptr);
template
size_t Used(Place place);
struct Usage : public boost::static_visitor {
size_t operator()(const platform::CPUPlace& cpu) const;
size_t operator()(const platform::CUDAPlace& gpu) const;
};
```
- 模板参数 `Place` 指示内存分配发生的设备
- 实现时,需特化支持的 `Place`, 提供以上三个接口的实现
---
### 代码结构
内存管理模块可以理解为由以下两部分构成:
1. SystemAllocator:实际从物理设备上分配、释放的内存的接口
1. BuddyAllocator:内存管理算法
---
### System Allocator
- SystemAllocator 是实现物理内存分配、回收的基类
- 不同设备上的内存分配和回收终将转化为标准接口调用
- 为不同设备实现MemoryAllocator,继承自SystemAllocator
```cpp
class SystemAllocator {
public:
virtual ~SystemAllocator() {}
virtual void* Alloc(size_t& index, size_t size) = 0;
virtual void Free(void* p, size_t size, size_t index) = 0;
virtual bool UseGpu() const = 0;
};
```
---
### CPU/GPU Allocator
```cpp
class CPUAllocator : public SystemAllocator {
public:
virtual void* Alloc(size_t& index, size_t size);
virtual void Free(void* p, size_t size, size_t index);
virtual bool UseGpu() const;
};
#ifdef PADDLE_WITH_CUDA
class GPUAllocator : public SystemAllocator {
public:
virtual void* Alloc(size_t& index, size_t size);
virtual void Free(void* p, size_t size, size_t index);
virtual bool UseGpu() const;
private:
size_t gpu_alloc_size_ = 0;
size_t fallback_alloc_size_ = 0;
};
#endif
```
- CPUAllocator和GPUAllocator分别继承自SystemAllocator,分别调用相应的标准库函数实现物理内存的分配和释放。
- 一旦大块、连续的物理内存分配之后,将通过内存管理算法实现内存的按块分配、回收、重用等。
---
### CPU Allocator
- CPU 内存的分配提供两种选项:
1. non-pinned memory:可分页内存
2. pinned memory:页锁定内存
- 分配过大的页锁定内存有可能因为系统可使用的分页内存减少,影响系统性能,默认CPU下分配的是可分页内存
- 通过gflags进行设置一次性分配内存的大小以及是否使用页锁定内存。
```cpp
DEFINE_bool(use_pinned_memory, true, "If set, allocate cpu pinned memory.");
DEFINE_double(fraction_of_cpu_memory_to_use, 1,
"Default use 100% of CPU memory for PaddlePaddle,"
"reserve the rest for page tables, etc");
```
---
### GPU Allocator
- 通过 cudaMalloc 分配GPU显存
- GPUAllocator::Alloc 首先会计算指定GPU device上的可用显存
- 如果可用显存小于请求分配大小,调用cudaMalloc进行分配
- 如果可用显存不足,目前会报错退出。
- 通过gflags控制GPU下一次性分配显存的大小:
```cpp
DEFINE_double(fraction_of_gpu_memory_to_use, 0.92,
"Default use 92% of GPU memory for PaddlePaddle,"
"reserve the rest for page tables, etc");
```
---
#### 内存管理算法: [Buddy Memory Allocation](https://en.wikipedia.org/wiki/Buddy_memory_allocation)
- Memory Arena:一次性分配大块连续内存,之后会基于这块内存进行内存管理:动态分配、释放、重用内存块。
- 伙伴内存分配:
- 将内存划分为 2 的幂次方个分区,使用 best-fit 方法来分配内存请求。
- 当释放内存时,检查 buddy 块,查看相邻的内存块是否也已被释放。如果是,将内存块合并,以最小化内存碎片。
- 分配的内存在物理内存的自然边界对齐,提高内存访问效率。
- 算法的时间效率高,单使用 best-fit 方法的缘故,会产生一定的内存浪费
---
### Buddy Allocator
- BuddyAllocator 是一个单例,每个设备(如: GPU/CPU(0)/GPU(1)) 拥有一个BuddyAllocator
- BuddyAllocator 内部拥有一个私有成员变量 SystemAllocator
- 当请求的内存超过BuddyAllocator管理的空余内存时,将会调用SystemAllocator去指定的设备上分配物理内存
---
### 实例:CPU 下内存管理接口的实现
- 对上层应用,统一通过BuddyAllocator来实现内存的分配、释放以及用量查询
```cpp
template <>
void* Alloc(platform::CPUPlace place, size_t size) {
VLOG(10) << "Allocate " << size << " bytes on " << platform::Place(place);
void* p = GetCPUBuddyAllocator()->Alloc(size);
VLOG(10) << " pointer=" << p;
return p;
}
template <>
void Free(platform::CPUPlace place, void* p) {
VLOG(10) << "Free pointer=" << p << " on " << platform::Place(place);
GetCPUBuddyAllocator()->Free(p);
}
template <>
size_t Used(platform::CPUPlace place) {
return GetCPUBuddyAllocator()->Used();
}
```
---
### ==5.== 多设备支持
---
### 多设备支持(一)
- step 1:添加Place类型,由用户实现添加到框架
- 可以将Place类型理解为一个整数加上一个枚举型,包括:设备号 + 设备类型
- DeviceContext
- 不同的Place会对应一个相应的DeviceContext,用于组织管理与设备相关的信息
- 例如,GpuDeviceContext中会管理Cuda stream
- 目前实现中一些特殊的库也会对应有自己的DeviceContext:例如:
```cpp
class MKLDNNDeviceContext : public CPUDeviceContext {……}
```
- 每种设备对应的DeviceContext需要管理的内容不尽相同,视具体需求来实现
---
### 多设备支持(二)
- step 2: 增加KernelType,为相应的KernelType注册Kernel对象,由用户实现注册给框架 可以按照:
1. Place 执行设备
1. DataType 执行数据类型 FP32/FP64/INT32/INT64
1. Memory layout: 运行时 Tensor 在内存中的排布格式 NCHW、 NHWC
1. 使用的库
来区分Kernel,为同一个operator注册多个 Kernel。
```cpp
struct OpKernelType {
proto::DataType data_type_;
DataLayout data_layout_;
platform::Place place_;
LibraryType library_type_;
}
```
---
### 多设备支持(三)
step 3: 运行时的 KernelType 推断和Kernel切换,按需要修改Kernel推断和Kernel切换规则
- Expected Kernel:期待调用的Kernel:由(1)`Place`和计算精度决定;或(2)用户在配置中显示指定使用的计算库,如`cudnn`、`mkldnn`等。
- Actual Kernel:运行时从`Operator`的输入(`Variable`)可以推断出实际需要的`KernelType`
- 当Expected Kernel和Actual Kernel不一致的时候,框架会插入`data_transformer`或者`data_layerout_transform`等,保证Expected Kernel可以执行,包括:
- CPUPlace -> GPUPlace :跨设备内存复制
- NCHW -> nChw8c :Layout转换
- FP32 -> FP16 :精度转换 _**尚未支持**_
- ……
- 以上过程实现在OperatorWithKernel类的Run方法中 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/framework/operator.cc#L497)
---
## ==6.== while_op
---
### while_op
- 循环执行一段`Program`,直到条件operator判断循环条件不满足时终止循环
- while_op 的特殊之处:
1. while_op 没有 kernel
1. while_op 拥有自己的`Block`,会形成一段嵌套的`Block`
1. ==while_op 内部创建了一个 Executor,来循环执行`Block`==
- while_op 输入输出 : LoDTensorArray
```cpp
namespace paddle {
namespace framework {
using LoDTensorArray = std::vector;
}
}
```
- 每一次循环,从原始输入中“切出”一个片段
- LoDTensorArray 在Python端暴露,是Fluid支持的基础数据结构之一,用户可以直接创建并使用
---
### while_op [Run](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/while_op.cc#L42) 方法概览
```cpp
void Run(const framework::Scope &scope,
const platform::Place &dev_place) const override {
PADDLE_ENFORCE_NOT_NULL(scope.FindVar(Input(kCondition)));
auto &cond = scope.FindVar(Input(kCondition))->Get();
PADDLE_ENFORCE_EQ(cond.dims(), paddle::framework::make_ddim({1}));
framework::Executor executor(dev_place);
auto *block = Attr(kStepBlock);
auto *program = block->Program();
auto step_scopes =
scope.FindVar(Output(kStepScopes))->GetMutable();
while (cond.data()[0]) {
auto ¤t_scope = scope.NewScope();
step_scopes->push_back(¤t_scope);
executor.Run(*program, ¤t_scope, block->ID(),
false /*create_local_scope*/);
}
}
```
---
### while_op 的重要应用:Dynamic RNN
---
### 什么是 `dynamicRNN` ?
1. 用户可以自定义在一个时间步之内的计算, 框架接受序列输入数据,在其上循环调用用户定义的单步计算
1. 可学习参数在多个时间步之间共享
1. `dynamicRNN` 由 `while_op` 实现
1. 如果`dynamicRNN`中定义了`memory`,将会构成一个循环神经网络,否则其行为就等于在输入序列上循环调用预定义的单步计算
---
#### `dynamic RNN` 用户接口
- `dynamicRNN` 中的重要元素
1. **step input**: `dynamicRNN` 每个时间步的输入
1. **step function**: 用户定义的单步计算
1. **memory**: 用于形成循环连接
1. **external/static memory**:单步计算的每一步都可以全部读取到的外部输入
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#### dynamicRNN 中的 Memory
`dynamicRNN`中`memory`的行为非常类似于 C++ 中的引用变量
- `memory` “指向” 一个operator的输出变量,记作: A
- `memory` 可以被 LoDTensor 初始化(当LoD信息为空时,为非序列,否则为序列),默认`memory`被初始化为零
- `memory` 在 operator A 前向计算之后,进行前向计算
- 当 `memory` 的前向计算会 "指向" A 的输出 LoDTensor
- `memory` 的输出可以是另一个 operator 的输入,于是形成了“循环”连接
---
### DynamicRNN 实现细节
- `while_op` 无法独立构成dynamicRNN,必须和一组相关的 operator 及数据结构配合
- 依赖的 operators (这里仅列出最重要的,并非全部):
- `lod_rank_table` operator
- `lod_tensor_to_array` operator
- `array_to_lod_tensor` operator
- `shrink_memory` operator
- 依赖的数据结构
- `TensorArray`
- `LoDRankTable`
- 在Fluid中,RNN接受变长序列输入,无需填充,以上数据结构和相关的operator配合工作,实现了对变长输入以batch计算
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### `dynamicRNN` 如何实现 batch 计算 ?
- 问题:
- RNN 可以看作是一个展开的前向网络,前向网络的深度是最长序列的长度
- 如果不对变长序列进行填充,将它们填充到一样长度,每个mini-batch输入将会不等长,每个样本展开长度不一致,导致前向和反向计算实现困难
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##### 实例 :RNN encoder-decoder with attention
- 以机器翻译的RNN encoder-decoder 模型(涉及了`dynamicRNN`的所有设计要素)为例,下图是 RNN encoder-decoder 的原始输入:
Figure. RNN encoder-decoder 原始batch 输入数据
- source word sequences 是encoder RNN的输出,是一个LoDTensor
- target word sequences 是look_uptable的输入,是一个LoDTensor
- 上图中一个矩形方块是CPU/GPU内存中一片连续的内存空间,表示一个dense vector
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### `dynamicRNN` 如何实现 batch 计算 ?
1. 对一个mini batch中不等长样本进行排序,最长样本变成batch中的第一个,最短样本是batch中最后一个
- `LoDTensor` -> `LoDRankTable` :heavy_plus_sign: `lod_rank_table operaator`
- 可以将`LoDRankTable`理解为对LoDTensor中的多个序列按照长度排序LoDRankTable 存储了排序之后的index
2. 构建每个时间步的batch输入:随着时间步增加,每个时间步的batch输入可能会逐渐缩小
- `TensorArray` :heavy_plus_sign: `lod_tensor_to_array` -> `LoDTensor` (without LoD)
3. 每个时间步输出写入一个输出 `LoDTensorArray`
3. `dynamicRNN`循环结束后, 按照`LoDRankTable`中记录的信息对输出`LoDTensorArray`重排序,还原会原始输入顺序
- `TensorArray` :heavy_plus_sign: `array_to_lod_tensor` -> `LoDTensor`
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### 运行实例
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### 运行实例
- 执行到第5~7个batch时,batch size将会缩小
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### 运行实例
- 第5 ~ 7个batch时RNN的`memory`会发生什么?
- `memory` 指向某个operator的输出Tensor,在该operator前向计算之后,“取回”其计算结果
- 5 ~ 7时,遇到了序列的结束,==下一个时间步计算不再需要在已经结束的序列上展开==
- 在`dynamicRNN`中`shrink_memory` operator 用来缩小`memory`的batch输入
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### 运行实例:batch 1 ~ 2
Figure. 第1、2个batch输入dynamicRNN的batch输入
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### 运行实例:batch 3 ~ 4
Figure. 第3、4个batch输入dynamicRNN的batch输入
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### 运行实例:batch 5 ~ 7
Figure. 第5、6、7个batch输入dynamicRNN的batch输入
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### ==7.== Fluid 代码结构
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### Fluid 代码结构
代码结构 |
模块结构 |
|
|
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### ==8.== 文档总结
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- 设计概览
- 重构概览 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/refactorization.md)
- fluid [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/fluid.md)
- fluid_compiler [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/design/motivation/fluid_compiler.md)
- 核心概念
- variable 描述 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/var_desc.md)
- Tensor [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/framework/tensor.md)
- LoDTensor [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/framework/lod_tensor.md)
- TensorArray [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/tensor_array.md)
- Program [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/program.md)
- Block [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/block.md)
- Scope [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/scope.md)
---
- 重要功能模块
- backward [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/backward.md)
- 内存优化 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/memory_optimization.md)
- evaluator [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/executor.md)
- python API [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/python_api.md)
- regularization [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/regularization.md)
- 开发指南
- 支持新设硬件设备库 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/design/support_new_device.md)
- 添加新的Operator [->](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/howto/dev/new_op_cn.md)
- 添加新的Kernel [->](
https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/howto/dev/new_op_kernel_en.md)
---
### ==9.== 开发指南
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#### 建议开发环境:使用 Docker 编译和测试
Docker编译PaddlePaddle源码: [->](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/build_and_install/docker_install_cn.html)
PaddlePaddle 在 Dockerhub 地址:[->](
https://hub.docker.com/r/paddlepaddle/paddle/tags/)
1. 获取PaddlePaddle的Docker镜像
```bash
docker pull paddlepaddle/paddle:latest-dev
```
1. 启动 docker container
```bash
docker run -it -v $PWD/Paddle:/paddle paddlepaddle/paddle:latest-dev /bin/bash
```
1. 进入docker container后,从源码编译,请参考文档 [->]( http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/build_and_install/build_from_source_cn.html)
---
### 一些说明
1. PaddlePaddle的Docker镜像为了减小体积,默认没有安装vim,可以在容器中执行`apt-get install -y vim`来安装vim。
1. 开发推荐使用tag为`latest-dev`的镜像,其中打包了所有编译依赖。`latest`及`lastest-gpu`是production镜像,主要用于运行PaddlePaddle程序。
2. 在Docker中运行GPU程序,推荐使用nvidia-docker,[否则需要将CUDA库和设备挂载到Docker容器内](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/build_and_install/docker_install_cn.html)。
```bash
nvidia-docker run -it -v $PWD/Paddle:/paddle paddlepaddle/paddle:latest-dev /bin/bash
```
---
### [如何贡献](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/dev/contribute_to_paddle_cn.html)
- ==提交PullRequest前请务必阅读==: [->](http://www.paddlepaddle.org/docs/develop/documentation/fluid/zh/dev/contribute_to_paddle_cn.html)
- 代码要求
1. 代码注释遵守 Doxygen 的样式
1. 确保编译器选项 WITH_STYLE_CHECK 已打开,并且编译能通过代码样式检查
1. 所有代码必须具有单元测试,且能够通过所有单元测试
- 使用 `pre-commit` 钩子提交Pull Request
1. 帮助格式化源代码(C++,Python)
1. 在提交前自动检查一些基本事宜:如每个文件只有一个 EOL,Git 中不要添加大文件等
1. 安装pre-commit,并在PaddlePaddle根目录运行:
```bash
➜ pip install pre-commit
➜ pre-commit install
```
---
### 如何贡献
1. 开始开发之前请先建立issue。
- 让其它同学知道某项工作已经有人在进行,以避免多人开发同一功能的情况。
1. 提交PR必须关联相关的issue。做法请参考:[->](https://help.github.com/articles/closing-issues-using-keywords/)
- 目的:为了在提交的版本中留有记录描述这个PR是为了开发什么样的功能,为了解决什么样的问题。
- 当PR被merge后,关联的issue会被自动关闭。
1. PR review 中,reviewer的每条comment都必须回复。
- 如修改完可直接回复:Done。
- 目的:review comment 中可能会有(1)询问类型的问题;(2)可以在下一个PR修改的问题;(3)comment意见不合理等。需要明确回复,以便reviewer和其他人有历史可查,便于区分是否已经进行修改,或者准备下一个PR修改,或者意见不合理可以不用进行修改。
---
### ==10.== 添加新的 Operator
---
### 概念简介
添加一个新的operator,会涉及实现以下C++类的派生类:
1. `framework::OperatorBase`: Operator(简写,Op)基类。
1. `framework::OpKernel`: Op计算函数的基类,称作Kernel。
1. `framework::OperatorWithKernel`:继承自OperatorBase,Op有计算函数,称作有Kernel。
1. `class OpProtoAndCheckerMaker`:描述该Op的输入、输出、属性、注释,主要用于Python API接口生成
依据是否包含kernel,可以将Op分为两种:
1. 包含Kernel的Op:继承自OperatorWithKernel,==绝大多数operator都属于这一类==
1. 不包含kernel的Op,继承自OperatorBase,只有少量Op属于这一类,例如while_op,ifelse_op
这里主要介绍带Kernel的Op如何编写。
---
#### 添加新的Operator需要修改/添加哪些文件?
内容 |
定义位置 |
OpProtoMake定义
|
`.cc`文件,Backward Op不需要OpProtoMaker
|
Op定义
|
`.cc`文件
|
Kernel实现
|
CPU、CUDA共享Kernel实现在`.h`文件中,否则,CPU 实现在`.cc`文件中,CUDA 实现在`.cu`文件中。
|
注册Op
|
Op注册实现在`.cc`文件;Kernel注册CPU实现在`.cc`文件中,CUDA实现在`.cu`文件中
|
- 添加 Operator 之前请阅读:[Operator 命名规范](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/63cca04cfd488a4dab6d6273fd04a8017ef45932/doc/fluid/dev/name_convention.md)及[Operator Markdown注释规范](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/63cca04cfd488a4dab6d6273fd04a8017ef45932/doc/fluid/dev/op_markdown_format.md)。
- 实现新的op都添加至目录[paddle/operators](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/tree/develop/paddle/fluid/operators)下,文件命名以`*_op.h`(如有) 、 `*_op.cc` 、`*_op.cu`(如有)结尾。
- 根据文件名自动构建op和Python端绑定,请务必遵守以上命名,否则需要进一步修改PyBind相关文件及CMakeLists.txt。
---
###### 实现带Kernel的Operator step1: 定义ProtoMaker类
下面均以[clip_op](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/clip_op.h)为例进行介绍
- clip_op计算公式:$Out = \min(\max(X, min), max)$
- 首先定义`ProtoMaker`来描述该Op的输入、输出,并添加注释(*下面代码段的中注释进行了简化,实现时需按照规范添加注释*):
```cpp
template
class ClipOpMaker : public framework::OpProtoAndCheckerMaker {
public:
ClipOpMaker(OpProto* proto, OpAttrChecker* op_checker)
: OpProtoAndCheckerMaker(proto, op_checker) {
AddInput("X","(Tensor)The input of clip op.");
AddOutput("Out", "(Tensor),The output of clip op.");
AddAttr(
"min", "(float),Minimum value.");
AddAttr(
"max", "(float),Maximum value.");
AddComment(R"DOC(
……
)DOC");
}
};
```
---
###### 实现带Kernel的Operator step2: 定义Operator类
下面的代码段实现了`clip_op`的定义:
```cpp
class ClipOp : public framework::OperatorWithKernel {
public:
using framework::OperatorWithKernel::OperatorWithKernel;
void InferShape(framework::InferShapeContext* ctx) const override {
PADDLE_ENFORCE(ctx->HasInput("X"),
"Input(X) of ClipOp should not be null.");
PADDLE_ENFORCE(ctx->HasOutput("Out"),
"Output(Out) of ClipOp should not be null.");
auto x_dims = ctx->GetInputDim("X");
auto max = ctx->Attrs().Get("max");
auto min = ctx->Attrs().Get("min");
PADDLE_ENFORCE_LT(min, max, "max should be greater than min.");
ctx->SetOutputDim("Out", x_dims);
ctx->ShareLoD("X", /*->*/ "Out");
}
};
```
---
### Operator 类中需要完成的工作
1. clip_op 继承自`OperatorWithKernel`,
```cpp
using framework::OperatorWithKernel::OperatorWithKernel;
```
表示使用基类`OperatorWithKernel`的构造函数。
1. 重写`InferShape`接口。
- `InferShape` 为const函数,不能修改Op的成员变
- `InferShape` 的参数为 `const framework::InferShapeContext &ctx`,从中可获取到输入输出以及属性
- `InferShape` 会被调用两次,一次是编译时(创建op),一次是运行时(调用op的`Run`方法时),需要完成以下功能:
1. 做检查, 尽早报错:检查输入数据维度、类型等是否合法
2. 设置输出Tensor的形状
通常`OpProtoMaker`和`Op`类的定义写在`.cc`文件中。
---
### 补充说明
1. `InferShape`目前支持两种实现方式,二者最后都会生成一个functor注册给OpInfo结构体。
1. 继承framework::InferShapeBase,实现为一个functor(参考 [mul_op](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/mul_op.cc#L22))
2. override InferShape函数(参考 [clip_op](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/clip_op.cc#L24))
1. 什么是`functor` ?
- 类或结构体仅重载了`()`,一般是可被多个kernel复用的计算函数。
```cpp
template
class CrossEntropyFunctor {
public:
void operator()(const platform::CPUDeviceContext& ctx,
framework::Tensor* out,
const framework::Tensor* prob,
const framework::Tensor* labels, const bool softLabel) {
……
}
};
```
- 在 clip_op 内也会看到将一段计算函数抽象为functor的使用法: [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/paddle/fluid/operators/clip_op.h#L27)。
---
###### 实现带Kernel的Operator step3: 定义OpKernel类
- `ClipKernel`继承自`framework::OpKernel`,带有下面两个模板参数:
1. `typename DeviceContext`: 表示设备类型,不同设备共享同一个Kernel时,需添加该模板参数。不共享时,需要提供针对不同设备的特化实现。
1. `typename T` : 表示支持的数据类型,如`float`, `double`等
- 在`ClipKernel`类中重写`Compute`方法
1. `Compute`接受输入参数:`const framework::ExecutionContext& context`
- `ExecutionContext` 是从 `Scope`中将运行时Op的输入、输出`Variable`组织在一起,使得Op在调用`Compute`方法时,能够简单地通过名字拿到需要的输入输出`Variable`
- 与`InferShapeContext`相比,`ExecutionContext` 中增加了设备类型
1. 在`Compute`函数里实现`OpKernel`的具体计算逻辑
---
#### ClipKernel 代码概览
```cpp
template
class ClipKernel : public framework::OpKernel {
public:
void Compute(const framework::ExecutionContext& context) const override {
auto max = context.Attr("max");
auto min = context.Attr("min");
auto* x = context.Input("X");
auto* out = context.Output("Out");
T* out_data = out->mutable_data(context.GetPlace());
const T* x_data = x->data();
int64_t numel = x->numel();
Transform trans;
trans(context.template device_context(), x_data,
x_data + numel, out_data, ClipFunctor(min, max));
}
};
```
- 为了使`OpKernel`的计算过程书写更加简单,并且CPU、CUDA的代码可以复用, Fluid 使用 Eigen 作为基础的矩阵运算库
- Fluid对Eigen unsupported Tensor提供了一些基本的封装,可以在`Compute`接口中直接调用
- 关于在PaddlePaddle中如何使用Eigen库,请参考[使用文档](https://github.com/PaddlePaddle/Fluiddoc/blob/develop/doc/fluid/dev/use_eigen_cn.md)。
---
###### 实现带Kernel的Operator step4: 实现反向Op
- ==**反向Op没有`ProtoMaker`**==,除此之外定义与实现方式前向Op完全一致,不再赘述
- 这里仅对反向Op的输入输出进行说明:
1. 反向Op的输入
- 前向Op的输出
- 反向传播过程中传递给当前Op的梯度
- 需要注意,Fluid中,不区分Cost Op和中间层Op,所有Op都必须正确处理接收到的梯度
2. 反向Op的输出
- 对可学习参数的求导结果
- 对所有输入的求导结果
---
###### 实现带Kernel的Operator step5: 注册Op及Kernel
至此Op和Op kernel都已经实现完毕,接下来,需要在`.cc`和`cu`文件中注册op和kernel
1. 在`.cc`文件中注册前向、反向Op类,注册CPU Kernel。
```cpp
namespace ops = paddle::operators;
REGISTER_OP(clip, ops::ClipOp, ops::ClipOpMaker, clip_grad,
ops::ClipOpGrad);
REGISTER_OP_CPU_KERNEL(
clip, ops::ClipKernel);
REGISTER_OP_CPU_KERNEL(
clip_grad, ops::ClipGradKernel);
```
- 在上面的代码片段中:
1. `REGISTER_OP` : 注册`ops::ClipOp`类,类型名为`clip`,该类的`ProtoMaker`为`ops::ClipOpMaker`,注册`ops::ClipOpGrad`,类型名为`clip_grad`
1. `REGISTER_OP_WITHOUT_GRADIENT` : 用于注册没有反向的Op,例如:优化算法相关的Op
1. `REGISTER_OP_CPU_KERNEL` :注册`ops::ClipKernel`类,并特化模板参数为`paddle::platform::CPUPlace`和`float`类型,同理,注册`ops::ClipGradKernel`类
1. 按照同样方法,在`.cu`文件中注册GPU Kernel
- 如果CUDA Kernel的实现基于Eigen,需在 `.cu`的开始加上宏定义 `#define EIGEN_USE_GPU`
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##### 编译和Python端绑定
- 运行下面命令可以仅编译新添加的Op:
```
make mul_op
```
- 需注意,运行单元测试需要编译整个工程
- 如果遵循前文的文件命名规则,构建过程中,会自动为新增的op添加Python端绑定,并链接到生成的lib库中
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###### 实现带Kernel的Operator step6: 添加前向单测及梯度检测
- 新增Op的单元测试统一添加至:[python/paddle/v2/fluid/tests/unittests](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/tree/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests)目录
- 前向Operator单测
1. Op单元测试继承自`OpTest`,各项具体的单元测试在`TestClipOp`里完成,所有单测case都以`TestXX`命名
1. 单元测试Operator,需要:
1. 在`setUp`函数定义输入、输出,以及相关的属性参数
1. 生成随机的输入数据
1. 在Python脚本中实现与前向operator相同的计算逻辑,得到输出值,与operator前向计算的输出进行对比
1. 反向梯度检测流程测试框架已经实现,直接调用相应接口`check_grad`即可
- `clip_op` 单测代码请参考 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests/test_clip_op.py),这里不再展开
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#### 编译执行单测
- `python/paddle/v2/framework/tests` 目录下新增的 `test_*.py` 单元测试会被自动加入工程进行编译
- 运行单元测试测时需要编译整个工程,并且编译时需要打开`WITH_TESTING`, 即`cmake paddle_dir -DWITH_TESTING=ON`
- 编译成功后,执行下面的命令来运行单元测试:
```bash
make test ARGS="-R test_mul_op -V"
```
或者:
```
ctest -R test_mul_op
```
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### 添加Op的一些注意事项
- 为每个Op创建单独的`*_op.h`(如有)、`*_op.cc`和`*_op.cu`(如有)。不允许一个文件中包含多个Op,将会导致编译出错。
- 注册Op时的类型名,需要和该Op的名字一样。不允许在`A_op.cc`里面,注册`REGISTER_OP(B, ...)`,会导致单元测试出错。
- 如果Op没有实现CUDA Kernel,不要创建空的`*_op.cu`,会导致单元测试出错。
- 如果多个Op依赖一些共用的函数,可以创建非`*_op.*`格式的文件来存放,如`gather.h`文件。
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### ==10.== 使用相关问题
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### 定义前向计算
- 当在python端执行时:
```python
import paddle.v2.fluid as fluid
```
[`framework.py`](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/framework.py#L1040)定义了两个全局`Program`:
```python
# program is a global instance.
_main_program_ = Program()
_startup_program_ = Program()
```
- 前向定义的过程就是不断往`mian_program`中添加Op和Variable
- 如果需要执行一个新的`mian_program`时,可以调用调用:
```python
def switch_main_program(program):
"""
Switch the main program to a new program.
This funtion returns the previous main program.
"""
……
```
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### 自定义参数的初始化
- 调用`fluid.ParamAttr(……)`接口,自定义参数的初始化
```python
w_param_attrs = ParamAttr(name=None,
initializer=UniformInitializer(low=-1.0, high=1.0, seed=0),
learning_rate=1.0,
regularizer=L1Decay(1.0),
trainable=True,
clip=GradientClipByValue(-1.0, 1.0),
)
y_predict = fluid.layers.fc(input=x, size=1, param_attr=w_param_attrs)
```
- 补充问题:如何创建 `Variable`
```python
cur_program = Program()
cur_block = cur_program.current_block()
new_var = cur_block.create_var(name="X", shape=[-1, 16, 16], dtype="float32")
```
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### 添加反向Op
- 调用`fluid.backward.append_backward(X)`(`X`是一个Variable),来为一段前向`ProgramDesc`添加反Op
```python
data = fluid.layers.data(name="data", shape=(2,3,4))
out = fluid.layers.fc(input=data,size=128,act=None)
loss = fluid.layers.reduce_sum(out)
fluid.backward.append_backward(loss=loss)
```
- 添加优化相关的Op
```python
sgd_optimizer = fluid.optimizer.SGD(learning_rate=0.001)
sgd_optimizer.minimize(loss)
```
- 可以随时调用`print(fluid.default_main_program())`来输出当前的`main_program`
- 当构建完成整个`Program`后,调用下面的接口执行内存优化:
```python
fluid.memory_optimize(fluid.default_main_program())
```
- _注:内存优化目前仍在持续开发中,有可能不够稳定。_
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### 总结:编译时执行流程
- 用户定义前向计算
- 添加反向Op到`default_main_program`
- 添加 gradient clipping Op 到
- 添加 regularization Op 到`default_main_program`
- 为指定的优化算法,添加相关的状态 variable of optimizer 到`default_startup_program`
- 状态相关 variable是指如学习率, 历史 momentum, 二阶momentum等
- 添加初始化 variable 的Op 到 `default_startup_program`
- 为整个网络最后一个op,添加设置其接受到的梯度的Op到`default_main_program`
- 进行内存优化规划
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### Feed 数据 (一):通过 feed 字典
- 执行executor的run方法时,指定feed字典,feed op 会将指定的数据放到`x`和`y`两个Variable中
```python
y_data = np.random.randint(0, 8, [1]).astype("int32")
y_tensor = core.Tensor()
y_tensor.set(y_data, place)
x_data = np.random.uniform(0.1, 1, [11, 8]).astype("float32")
x_tensor = core.Tensor()
x_tensor.set(x_data, place)
……
cost = exe.run(
fluid.default_main_program(),
feed={'x': x_tensor,
'y': y_tensor},
fetchlist=[avg_cost])
```
- 这种方法较为底层,一般用于单测中
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### Feed 数据 (二):使用 DataFeeder接口
- 编写一个data_reader函数,data_reader是一个Python generator
```python
def demo_reader():
def random_generator():
yield np.random.uniform(0.1, 1, [4]), np.random.randint(0, 1, [1])
return random_generator
```
- 在训练任务中使用 DataFeeder 接口
```python
cost = exe.run(
fluid.default_main_program(),
feed={'x': x_tensor,
'y': y_tensor},
fetchlist=[avg_cost])
train_reader = paddle.batch(
paddle.reader.shuffle(demo_reader(), buf_size=500), batch_size=4)
feeder = fluid.DataFeeder(place=place, feed_list=[x, y])
for data in train_reader():
cost = exe.run(
fluid.default_main_program(),
feed=feeder.feed(data),
fetch_list=[cost])
```
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### 常见问题
- 如何使用 evaluator ? [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_label_semantic_roles.py#L168)
```python
accuracy = fluid.evaluator.Accuracy(input=predict, label=label)
for pass_id in range(PASS_NUM):
accuracy.reset()
for data in train_reader():
loss, acc = exe.run(fluid.default_main_program(),
feed=feeder.feed(data),
fetch_list=[avg_cost] + accuracy.metrics)
pass_acc = accuracy.eval(exe)
# acc 当前一个batch 的 accuracy
# pass_acc 当前batch 的 accuracy
pass_total_acc = accuracy.eval(exe) # 整个pass的accuracy
```
- 如何在训练中测试?[->](https://github.com/dzhwinter/benchmark/blob/master/fluid/vgg16.py#L144)
- 如何保存训练好的模型?[->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_recognize_digits.py#L143)
- 如何加载训练好的模型进行预测?[->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/book/test_recognize_digits.py#L154)
- 如何在同一个训练任务中定义多个Program,并交替运行? [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/demo/fc_gan.py)
- 如何profile?Fluid 实现了profile 工具,可以直接调用。请参考示例 [->](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/python/paddle/fluid/tests/unittests/test_profiler.py)
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