# 优化数据准备的性能 `Ascend` `GPU` `CPU` `数据准备` `初级` `中级` `高级` - [优化数据准备的性能](#优化数据准备的性能) - [概述](#概述) - [整体流程](#整体流程) - [准备环节](#准备环节) - [导入模块](#导入模块) - [下载所需数据集](#下载所需数据集) - [数据加载性能优化](#数据加载性能优化) - [性能优化方案](#性能优化方案) - [代码示例](#代码示例) - [shuffle性能优化](#shuffle性能优化) - [性能优化方案](#性能优化方案-1) - [代码示例](#代码示例-1) - [数据增强性能优化](#数据增强性能优化) - [性能优化方案](#性能优化方案-2) - [代码示例](#代码示例-2) - [性能优化方案总结](#性能优化方案总结) - [多线程优化方案](#多线程优化方案) - [多进程优化方案](#多进程优化方案) - [Compose优化方案](#compose优化方案) - [算子融合优化方案](#算子融合优化方案)    ## 概述 数据是整个深度学习中最重要的一环,因为数据的好坏决定了最终结果的上限,模型的好坏只是去无限逼近这个上限,所以高质量的数据输入,会在整个深度神经网络中起到积极作用,数据在整个数据处理和数据增强的过程像经过pipeline管道的水一样,源源不断地流向训练系统,如图所示: ![title](./images/pipeline.png) MindSpore为用户提供了数据处理以及数据增强的功能,在数据的整个pipeline过程中,其中的每一步骤,如果都能够进行合理的运用,那么数据的性能会得到很大的优化和提升。本次体验将基于CIFAR-10数据集来为大家展示如何在数据加载、数据处理和数据增强的过程中进行性能的优化。 ## 整体流程 - 准备环节。 - 数据加载性能优化。 - shuffle性能优化。 - 数据增强性能优化。 - 性能优化方案总结。 ## 准备环节 ### 导入模块 `dataset`模块提供API用来加载和处理数据集。 ```python import mindspore.dataset as ds ``` `numpy`模块用于生成ndarray数组。 ```python import numpy as np ``` ### 下载所需数据集 1. 在当前工作目录下创建`./dataset/Cifar10Data`目录,本次体验所用的数据集存放在该目录下。 2. 在当前工作目录下创建`./transform`目录,本次体验转换生成的数据集存放在该目录下。 3. 下载[CIFAR-10二进制格式数据集](https://www.cs.toronto.edu/~kriz/cifar-10-binary.tar.gz),并将数据集文件解压到`./dataset/Cifar10Data/cifar-10-batches-bin`目录下,数据加载的时候使用该数据集。 4. 下载[CIFAR-10 Python文件格式数据集](https://www.cs.toronto.edu/~kriz/cifar-10-python.tar.gz),并将数据集文件解压到`./dataset/Cifar10Data/cifar-10-batches-py`目录下,数据转换的时候使用该数据集。 目录结构如下所示: dataset/Cifar10Data ├── cifar-10-batches-bin │   ├── batches.meta.txt │   ├── data_batch_1.bin │   ├── data_batch_2.bin │   ├── data_batch_3.bin │   ├── data_batch_4.bin │   ├── data_batch_5.bin │   ├── readme.html │   └── test_batch.bin └── cifar-10-batches-py ├── batches.meta ├── data_batch_1 ├── data_batch_2 ├── data_batch_3 ├── data_batch_4 ├── data_batch_5 ├── readme.html └── test_batch 其中: - `cifar-10-batches-bin`目录为CIFAR-10二进制格式数据集目录。 - `cifar-10-batches-py`目录为CIFAR-10 Python文件格式数据集目录。 ## 数据加载性能优化 MindSpore为用户提供了多种数据加载方式,其中包括常用数据集加载、用户自定义数据集加载、MindSpore数据格式加载,详情内容请参考[加载数据集](https://www.mindspore.cn/tutorial/zh-CN/master/use/data_preparation/loading_the_datasets.html)。对于数据集加载,底层实现方式的不同,会导致数据集加载的性能存在差异,如下所示: | | 常用数据集 | 用户自定义 | MindRecord | | :----: | :----: | :----: | :----: | | 底层实现 | C++ | Python | C++ | | 性能 | 高 | 中 | 高| ### 性能优化方案 ![title](./images/data_loading_performance_scheme.png) 数据加载性能优化建议如下: - 已经支持的数据集格式优选内置加载算子,具体内容请参考[内置加载算子](https://www.mindspore.cn/api/zh-CN/master/api/python/mindspore/mindspore.dataset.html),如果性能仍无法满足需求,则可采取多线程并发方案,请参考本文[多线程优化方案](#多线程优化方案)。 - 不支持的数据集格式,优选转换为MindSpore数据格式后再使用`MindDataset`类进行加载,具体内容请参考[将数据集转换为MindSpore数据格式](https://www.mindspore.cn/tutorial/zh-CN/master/use/data_preparation/converting_datasets.html),如果性能仍无法满足需求,则可采取多线程并发方案,请参考本文[多线程优化方案](#多线程优化方案)。 - 不支持的数据集格式,算法快速验证场景,优选用户自定义`GeneratorDataset`类实现,如果性能仍无法满足需求,则可采取多进程并发方案,请参考本文[多进程优化方案](#多进程优化方案)。 ### 代码示例 基于以上的数据加载性能优化建议,本次体验分别使用内置加载算子`Cifar10Dataset`类、数据转换后使用`MindDataset`类、使用`GeneratorDataset`类进行数据加载,代码演示如下: 1. 使用内置算子`Cifar10Dataset`类加载CIFAR-10数据集,这里使用的是CIFAR-10二进制格式的数据集,加载数据时采取多线程优化方案,开启了4个线程并发完成任务,最后对数据创建了字典迭代器,并通过迭代器读取了一条数据记录。 ```python cifar10_path = "./dataset/Cifar10Data/cifar-10-batches-bin/" # create Cifar10Dataset for reading data cifar10_dataset = ds.Cifar10Dataset(cifar10_path,num_parallel_workers=4) # create a dictionary iterator and read a data record through the iterator print(next(cifar10_dataset.create_dict_iterator())) ``` 输出: {'image': array([[[235, 235, 235], [230, 230, 230], [234, 234, 234], ..., [248, 248, 248], [248, 248, 248], [249, 249, 249]], ..., [120, 120, 119], [146, 146, 146], [177, 174, 190]]], dtype=uint8), 'label': array(9, dtype=uint32)} 2. 使用`Cifar10ToMR`这个类将CIFAR-10数据集转换为MindSpore数据格式,这里使用的是CIFAR-10 python文件格式的数据集,然后使用`MindDataset`类加载MindSpore数据格式数据集,加载数据采取多线程优化方案,开启了4个线程并发完成任务,最后对数据创建了字典迭代器,并通过迭代器读取了一条数据记录。 ```python from mindspore.mindrecord import Cifar10ToMR cifar10_path = './dataset/Cifar10Data/cifar-10-batches-py/' cifar10_mindrecord_path = './transform/cifar10.record' cifar10_transformer = Cifar10ToMR(cifar10_path,cifar10_mindrecord_path) # executes transformation from Cifar10 to MindRecord cifar10_transformer.transform(['label']) # create MindDataset for reading data cifar10_mind_dataset = ds.MindDataset(dataset_file=cifar10_mindrecord_path,num_parallel_workers=4) # create a dictionary iterator and read a data record through the iterator print(next(cifar10_mind_dataset.create_dict_iterator())) ``` 输出: {'data': array([255, 216, 255, ..., 63, 255, 217], dtype=uint8), 'id': array(30474, dtype=int64), 'label': array(2, dtype=int64)} 3. 使用`GeneratorDataset`类加载自定义数据集,并且采取多进程优化方案,开启了4个进程并发完成任务,最后对数据创建了字典迭代器,并通过迭代器读取了一条数据记录。 ```python def generator_func(num): for i in range(num): yield (np.array([i]),) # create GeneratorDataset for reading data dataset = ds.GeneratorDataset(source=generator_func(5),column_names=["data"],num_parallel_workers=4) # create a dictionary iterator and read a data record through the iterator print(next(dataset.create_dict_iterator())) ``` 输出: {'data': array([0], dtype=int64)} ## shuffle性能优化 shuffle操作主要是对有序的数据集或者进行过repeat的数据集进行混洗,MindSpore专门为用户提供了`shuffle`函数,其中设定的`buffer_size`参数越大,混洗程度越大,但时间、计算资源消耗也会大。该接口支持用户在整个pipeline的任何时候都可以对数据进行混洗,具体内容请参考[shuffle处理](https://www.mindspore.cn/tutorial/zh-CN/master/use/data_preparation/data_processing_and_augmentation.html#shuffle)。但是因为底层的实现方式不同,该方式的性能不如直接在[内置加载算子](https://www.mindspore.cn/api/zh-CN/master/api/python/mindspore/mindspore.dataset.html)中设置`shuffle`参数直接对数据进行混洗。 ### 性能优化方案 ![title](./images/shuffle_performance_scheme.png) shuffle性能优化建议如下: - 直接使用内置加载算子的`shuffle`参数进行数据的混洗。 - 如果使用的是`shuffle`函数,当性能仍无法满足需求,可通过调大`buffer_size`参数的值来优化提升性能。 ### 代码示例 基于以上的shuffle性能优化建议,本次体验分别使用内置加载算子`Cifar10Dataset`类的`shuffle`参数和`Shuffle`函数进行数据的混洗,代码演示如下: 1. 使用内置算子`Cifar10Dataset`类加载CIFAR-10数据集,这里使用的是CIFAR-10二进制格式的数据集,并且设置`shuffle`参数为True来进行数据混洗,最后对数据创建了字典迭代器,并通过迭代器读取了一条数据记录。 ```python cifar10_path = "./dataset/Cifar10Data/cifar-10-batches-bin/" # create Cifar10Dataset for reading data cifar10_dataset = ds.Cifar10Dataset(cifar10_path,shuffle=True) # create a dictionary iterator and read a data record through the iterator print(next(cifar10_dataset.create_dict_iterator())) ``` 输出: {'image': array([[[254, 254, 254], [255, 255, 254], [255, 255, 254], ..., [232, 234, 244], [226, 230, 242], [228, 232, 243]], ..., [ 64, 61, 63], [ 63, 58, 60], [ 61, 56, 58]]], dtype=uint8), 'label': array(9, dtype=uint32)} 2. 使用`shuffle`函数进行数据混洗,参数`buffer_size`设置为3,数据采用`GeneratorDataset`类自定义生成。 ```python def generator_func(): for i in range(5): yield (np.array([i,i+1,i+2,i+3,i+4]),) ds1 = ds.GeneratorDataset(source=generator_func,column_names=["data"]) print("before shuffle:") for data in ds1.create_dict_iterator(): print(data["data"]) ds2 = ds1.shuffle(buffer_size=3) print("after shuffle:") for data in ds2.create_dict_iterator(): print(data["data"]) ``` 输出: before shuffle: [0 1 2 3 4] [1 2 3 4 5] [2 3 4 5 6] [3 4 5 6 7] [4 5 6 7 8] after shuffle: [2 3 4 5 6] [0 1 2 3 4] [4 5 6 7 8] [1 2 3 4 5] [3 4 5 6 7] ## 数据增强性能优化 在图片分类的训练中,尤其是当数据集比较小的时候,用户可以使用数据增强的方式来预处理图片,从而丰富数据集。MindSpore为用户提供了多种数据增强的方式,其中包括: - 使用内置C算子(`c_transforms`模块)进行数据增强。 - 使用内置Python算子(`py_transforms`模块)进行数据增强。 - 用户可根据自己的需求,自定义Python函数进行数据增强。 具体的内容请参考[数据增强](https://www.mindspore.cn/tutorial/zh-CN/master/use/data_preparation/data_processing_and_augmentation.html#id3)。因为底层的实现方式不同,所以性能还是有一定的差异,如下所示: | 模块 | 底层接口 | 说明 | | :----: | :----: | :----: | | c_transforms | C++(基于OpenCV)| 性能高 | | py_transforms | Python(基于PIL) | 该模块提供了多种图像增强功能,并提供了PIL Image和Numpy数组之间的传输方法 | ### 性能优化方案 ![title](./images/data_enhancement_performance_scheme.png) 数据增强性能优化建议如下: - 优先使用`c_transforms`模块进行数据增强,因为性能最高,如果性能仍无法满足需求,可采取[多线程优化方案](#多线程优化方案)、[Compose优化方案](#Compose优化方案)或者[算子融合优化方案](#算子融合优化方案)。 - 如果使用了`py_transforms`模块进行数据增强,当性能仍无法满足需求,可采取[多线程优化方案](#多线程优化方案)、[多进程优化方案](#多进程优化方案)、[Compose优化方案](#Compose优化方案)或者[算子融合优化方案](#算子融合优化方案)。 - `c_transforms`模块是在C++内维护buffer管理,`py_transforms`模块是在Python内维护buffer管理。因为Python和C++切换的性能成本,建议不要混用算子。 - 如果用户使用了自定义Python函数进行数据增强,当性能仍无法满足需求,可采取[多线程优化方案](#多线程优化方案)或者[多进程优化方案](#多进程优化方案),如果还是无法提升性能,就需要对自定义的Python代码进行优化。 ### 代码示例 基于以上的数据增强性能优化建议,本次体验分别使用`c_transforms`模块和自定义Python函数进行了数据增强,演示代码如下所示: 1. 使用`c_transforms`模块进行数据增强,数据增强时采用多线程优化方案,开启了4个线程并发完成任务,并且采用了算子融合优化方案,使用`RandomResizedCrop`融合类替代`RandomResize`类和`RandomCrop`类。 ```python import mindspore.dataset.transforms.c_transforms as c_transforms import mindspore.dataset.transforms.vision.c_transforms as C import matplotlib.pyplot as plt cifar10_path = "./dataset/Cifar10Data/cifar-10-batches-bin/" # create Cifar10Dataset for reading data cifar10_dataset = ds.Cifar10Dataset(cifar10_path,num_parallel_workers=4) transforms = C.RandomResizedCrop((800,800)) # apply the transform to the dataset through dataset.map() cifar10_dataset = cifar10_dataset.map(input_columns="image",operations=transforms,num_parallel_workers=4) data = next(cifar10_dataset.create_dict_iterator()) plt.imshow(data["image"]) plt.show() ``` 输出: ![png](./images/cifar10_c_transforms.png) 2. 使用自定义Python函数进行数据增强,数据增强时采用多进程优化方案,开启了4个进程并发完成任务。 ```python def generator_func(): for i in range(5): yield (np.array([i,i+1,i+2,i+3,i+4]),) ds3 = ds.GeneratorDataset(source=generator_func,column_names=["data"]) print("before map:") for data in ds3.create_dict_iterator(): print(data["data"]) func = lambda x:x**2 ds4 = ds3.map(input_columns="data",operations=func,python_multiprocessing=True,num_parallel_workers=4) print("after map:") for data in ds4.create_dict_iterator(): print(data["data"]) ``` 输出: before map: [0 1 2 3 4] [1 2 3 4 5] [2 3 4 5 6] [3 4 5 6 7] [4 5 6 7 8] after map: [ 0 1 4 9 16] [ 1 4 9 16 25] [ 4 9 16 25 36] [ 9 16 25 36 49] [16 25 36 49 64] ## 性能优化方案总结 ### 多线程优化方案 在数据pipeline过程中,相关算子一般都有线程数设置参数,来提升处理并发度,提升性能,例如: - 在数据加载的过程中,内置数据加载类有`num_parallel_workers`参数用来设置线程数。 - 在数据增强的过程中,`map`函数有`num_parallel_workers`参数用来设置线程数。 - 在Batch的过程中,`batch`函数有`num_parallel_workers`参数用来设置线程数。 具体内容请参考[内置加载算子](https://www.mindspore.cn/api/zh-CN/master/api/python/mindspore/mindspore.dataset.html)。 ### 多进程优化方案 数据处理中Python实现的算子均支持多进程的模式,例如: - `GeneratorDataset`这个类默认是多进程模式,它的`num_parallel_workers`参数表示的是开启的进程数,默认为1,具体内容请参考[GeneratorDataset](https://www.mindspore.cn/api/zh-CN/master/api/python/mindspore/mindspore.dataset.html#mindspore.dataset.GeneratorDataset)。 - 如果使用Python自定义函数或者`py_transforms`模块进行数据增强的时候,当`map`函数的参数`python_multiprocessing`设置为True时,此时参数`num_parallel_workers`表示的是进程数,参数`python_multiprocessing`默认为False,此时参数`num_parallel_workers`表示的是线程数,具体的内容请参考[内置加载算子](https://www.mindspore.cn/api/zh-CN/master/api/python/mindspore/mindspore.dataset.html)。 ### Compose优化方案 Map算子可以接收Tensor算子列表,并将按照顺序应用所有的这些算子,与为每个Tensor算子使用的Map算子相比,此类“胖Map算子”可以获得更好的性能,如图所示: ![title](./images/compose.png) ### 算子融合优化方案 提供某些融合算子,这些算子将两个或多个算子的功能聚合到一个算子中。具体内容请参考[数据增强算子](https://www.mindspore.cn/api/zh-CN/master/api/python/mindspore/mindspore.dataset.transforms.vision.html),与它们各自组件的流水线相比,这种融合算子提供了更好的性能。如图所示: ![title](./images/operator_fusion.png)