# Intel® MKL-DNN on PaddlePaddle: Design Doc 我们计划将Intel深度神经网络数学库(**MKL-DNN**\[[1](#references)\])集成到PaddlePaddle,充分展现英特尔平台的优势,有效提升PaddlePaddle在英特尔架构上的性能。 我们短期内的基本目标是: - 完成常用layer的MKL-DNN实现。 - 完成常见深度神经网络VGG,GoogLeNet 和 ResNet的MKL-DNN实现。 ## Contents - [Overview](#overview) - [Actions](#actions) - [CMake](#cmake) - [Layers](#layers) - [Activations](#activations) - [Weights](#weights) - [Unit Tests](#unit-tests) - [Protobuf Messages](#protobuf-messages) - [Python API](#python-api) - [Demos](#demos) - [Benchmarking](#benchmarking) - [Others](#others) - [Design Concerns](#design-concerns) ## Overview 我们会把MKL-DNN作为第三方库集成进PaddlePaddle,整体框架图

Figure 1. PaddlePaddle on IA.
## Actions 我们把集成方案大致分为了如下几个方面。 ### CMake 我们会在`CMakeLists.txt`中会添加`WITH_MKLDNN`的选项,当设置这个值为`ON`的时候会启用编译MKL-DNN功能。同时会自动开启OpenMP用于提高MKL-DNN的性能。 同时,我们会引入`WITH_MKLML`选项,用于选择是否使用MKL-DNN自带的MKLML安装包。这个安装包可以独立于MKL-DNN使用,但是建议在开启MKL-DNN的同时也打开MKLML的开关,这样才能发挥最好的性能。 所以,我们会在`cmake/external`目录新建`mkldnn.cmake`和`mklml.cmake`文件,它们会在编译PaddlePaddle的时候下载对应的软件包,并放到PaddlePaddle的third party目录中。 **备注**:当`WITH_MKLML=ON`的时候,会优先使用这个包作为PaddlePaddle的CBLAS和LAPACK库,所以会稍微改动`cmake/cblas.cmake`中的逻辑。 ### Layers 所有MKL-DNN相关的C++ layers,都会按照PaddlePaddle的目录结构存放在 `paddle/gserver/layers`中,并且文件名都会一以*MKLDNN*开头。 所有MKL-DNN的layers都会继承于一个叫做`MKLDNNLayer`的父类,该父类继承于PaddlePaddle的基类`Layer`。 在`MKLDNNLayer`中会提供一些必要的接口和函数,并且会写好`forward`和`backward`的基本逻辑。部分函数定义为纯虚函数,子类只需要实现这些函数即可。 ### Activations 由于在PaddlePaddle中,激活函数是独立于layer概念的,所以会在`paddle/gserver/activations`目录下添加`MKLDNNActivation.h`和`MKLDNNActivation.cpp`文件用于定义和使用MKL-DNN的接口。 ### Weights 由于有些layer是含有参数的,我们会尽量让MKL-DNN的参数与PaddlePaddle中`parameter`共享一块内存。 同时,由于MKL-DNN在训练时使用的参数layout可能与PaddlePaddle默认的`nchw`不一致,我们会在网络训练的开始和结束时分别转换这个layout,使得最终保存的参数格式与PaddlePaddle一致。 ### Unit Tests 会在`paddle/gserver/test`目录下添加`test_MKLDNN.cpp`和`MKLDNNTester.*`用于MKL-DNN的测试。 测试分为每个layer(或activation)的单元测试和简单网络的整体测试。 每个测试会对比PaddlePaddle中CPU算出的结果与MKL-DNN的结果,小于某个比较小的阈值认为通过。 ### Protobuf Messages 根据具体layer的需求可能会在`proto/ModelConfig.proto`里面添加必要的选项。 ### Python API 目前只考虑**v1 API**。 计划在`python/paddle/trainer/config_parser.py`里面添加`use_mkldnn`这个选择,方便用户选择使用MKL-DNN的layers。 具体实现方式比如: ```python use_mkldnn = bool(int(g_command_config_args.get("use_mkldnn", 0))) if use_mkldnn self.layer_type = mkldnn_* ``` 所有MKL-DNN的layer type会以*mkldnn_*开头,以示区分。 并且可能在`python/paddle/trainer_config_helper`目录下的`activations.py `和`layers.py`里面添加必要的MKL-DNN的接口。 ### Demos 会在`v1_api_demo`目录下添加一个`mkldnn`的文件夹,里面放入一些用于MKL-DNN测试的demo脚本。 ### Benchmarking 会添加`benchmark/paddle/image/run_mkldnn.sh`,用于测试使用MKL-DNN之后的性能。 ### Others 1. 如果在使用MKL-DNN的情况下,会把CPU的Buffer对齐为64。 2. 深入PaddlePaddle,寻找有没有其他可以优化的可能,进一步优化。比如可能会用OpenMP改进SGD的更新性能。 ## Design Concerns 为了更好的符合PaddlePaddle的代码风格\[[2](#references)\],同时又尽可能少的牺牲MKL-DNN的性能\[[3](#references)\]。 我们总结出一些特别需要注意的点: 1. 使用**deviceId_**。为了尽可能少的在父类Layer中添加变量或者函数,我们决定使用已有的`deviceId_`变量来区分layer的属性,定义`-2`为`MKLDNNLayer`特有的设备ID。 2. 重写父类Layer的**init**函数,修改`deviceId_`为`-2`,代表这个layer是用于跑在MKL-DNN的环境下。 3. 创建`MKLDNNMatrix`,同时继承`CpuMatrix`和`mkldnn::memory`。用于管理MKL-DNN会用到的相关memory函数、接口以及会用的到格式信息。 4. 创建`MKLDNNBase`,定义一些除了layer和memory相关的类和函数。包括MKL-DNN会用到`MKLDNNStream`和`CPUEngine`,和未来可能还会用到`FPGAEngine`等。 5. 每个`MKLDNNlayer`都会有`inVal_`,`inGrad_`,`outVal_`和`outGrad_`,分别代表input value, input gradient,output value和output gradient。他们会存放MKL-DNN用到的internal memory。同时还会定义以*ext*开头的`MKLDNNMatrix`(表示external的memory),主要是在格式与PaddlePaddle默认的`nchw`格式不匹配时,用于转换内存的工作。必要的转换函数也会在`MKLDNNLayer`中提前定义好,每个子类只需要调用定义好的reset buffer函数即可。 6. 每个`MKLDNNlayer`的resetbuffer相关的函数(包括reset input、output的Value和grad),他们会根据输入参数reset internal和external的memory,当然这两者也可以相等,即表示不需要转换。只需要把握一个原则,每个`MKLDNNlayer`的子类,只需要使用internal的memory就可以了,所有external的转换工作在父类的reset函数中都提前准备好了。 7. 一般来说,external的memory会尽量与PaddlePaddle中的`value`和`grad`共享内存。同时每个`MKLDNNLayer`中的external output value和gradient(也就是`extOutVal_`和`extOutGrad_`)必须分别与`output_.value`和`output_.grad`共享内存,因为PaddlePaddle的activation会直接使用`output_.value`和`output_.grad`。如果不需要external的buffer用于转换,那么internal的buffer也会与他们共享内存。 8. 如果MKL-DNN layer的后面接有cpu device,那么就会使`output_.value`与`extOutVal_`共享内存,同时数据格式就是`nchw`,这样下一个cpu device就能拿到正确的数据。在有cpu device的时候,external的memory的格式始终是`nchw`或者`nc`。 9. 由于MKL-DNN的输出操作都是覆盖data的,不是在原来的数据上累加,所以当网络出现分支时,在`backward`时会需要merge不同layer的梯度。`MKLDNNlayer`中会实现merge的方法,此时每个小分支的input gradient会先临时保存在一个`MKLDNNMatrix`中,由分支处的layer负责求和,并把结果放到这个layer的`output_.grad`中。所以整体上,每个子类并不会需要关心分支的事情,也是在父类都实现好了。 10. 在原来的`FLAGS`中添加一个`use_mkldnn`的flag,用于选择是否使用MKL-DNN的相关功能。 ## References 1. [Intel Math Kernel Library for Deep Neural Networks (Intel MKL-DNN)](https://github.com/01org/mkl-dnn "Intel MKL-DNN") 2. [原来的方案](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/pull/3096)会引入**nextLayer**的信息。但是在PaddlePaddle中,无论是重构前的layer还是重构后的op,都不会想要知道next layer/op的信息。 3. MKL-DNN的高性能格式与PaddlePaddle原有的`NCHW`不同(PaddlePaddle中的CUDNN部分使用的也是`NCHW`,所以不存在这个问题),所以需要引入一个转换方法,并且只需要在必要的时候转换这种格式,才能更好的发挥MKL-DNN的性能。