Merge branch 'release/0.10.0' into release_note

RELEASE.md

@@ -7,6 +7,11 @@
 * Support rectangle input for CNN.
 * Support stride pooling for seqlastin and seqfirstin.
 * Expose seq_concat_layer/seq_reshape_layer in `trainer_config_helpers`.
+* Add dataset package
+  - CIFAR, MNIST, IMDB, WMT14, CONLL05, movielens, imikolov.
+* Add Priorbox layer for Single Shot Multibox Detection. 
+* Add smooth L1 cost.
+* Add data reader creator and data reader decorator for v2 API.
 * Add the cpu implementation of cmrnorm-projection.
 
 ## Improvements
@@ -19,6 +24,13 @@
 * Reorganize the catalog of doc/ and refine several docs.
 * Add Travis-CI for checking dead links.
 * Add a example for explaining sparse_vector.
+* Add Relu in layer_math.py
+* Simplify data processing flow for quick start.
+* Support CUDNN Deconv.
+* Add data feeder for v2 API.
+* Support predicting the samples from sys.stdin for sentiment demo.
+* Provide multi-proccess interface for image preprocessing. 
+* Add benchmark document for v1 API.
 * Add Relu in layer_math.py.
 * Add packages for automatically downloading public datasets.
 * Rename Argument::sumCost to Argument::sum since Argument does not have to have any relationship with cost.
@@ -49,6 +61,9 @@
 * Fix LogActivation which is not defined.
 * Fix bug when run test_layerHelpers multiple times.
 * Fix protobuf size limit on seq2seq demo.
+* Fix bug for dataprovider converter in GPU mode.
+* Fix bug in GatedRecurrentLayer which only occurs in predicting or `job=test` mode.
+* Fix bug for BatchNorm when testing more than models in test mode.
 * Fix unit test of paramRelu.
 * Fix some warning about CpuSparseMatrix.
 * Fix MultiGradientMachine error if trainer_count > batch_size.

demo/seqToseq/seqToseq_net.py

@@ -69,7 +69,8 @@ def gru_encoder_decoder(data_conf,
                         encoder_size=512,
                         decoder_size=512,
                         beam_size=3,
-                        max_length=250):
+                        max_length=250,
+                        error_clipping=50):
     """
     A wrapper for an attention version of GRU Encoder-Decoder network
     is_generating: whether this config is used for generating
@@ -90,9 +91,19 @@ def gru_encoder_decoder(data_conf,
         input=src_word_id,
         size=word_vector_dim,
         param_attr=ParamAttr(name='_source_language_embedding'))
-    src_forward = simple_gru(input=src_embedding, size=encoder_size)
+    src_forward = simple_gru(
+        input=src_embedding,
+        size=encoder_size,
+        naive=True,
+        gru_layer_attr=ExtraLayerAttribute(
+            error_clipping_threshold=error_clipping))
     src_backward = simple_gru(
-        input=src_embedding, size=encoder_size, reverse=True)
+        input=src_embedding,
+        size=encoder_size,
+        reverse=True,
+        naive=True,
+        gru_layer_attr=ExtraLayerAttribute(
+            error_clipping_threshold=error_clipping))
     encoded_vector = concat_layer(input=[src_forward, src_backward])
 
     with mixed_layer(size=decoder_size) as encoded_proj:
@@ -117,11 +128,13 @@ def gru_encoder_decoder(data_conf,
             decoder_inputs += full_matrix_projection(input=context)
             decoder_inputs += full_matrix_projection(input=current_word)
 
-        gru_step = gru_step_layer(
+        gru_step = gru_step_naive_layer(
             name='gru_decoder',
             input=decoder_inputs,
             output_mem=decoder_mem,
-            size=decoder_size)
+            size=decoder_size,
+            layer_attr=ExtraLayerAttribute(
+                error_clipping_threshold=error_clipping))
 
         with mixed_layer(
                 size=target_dict_dim, bias_attr=True,

doc/getstarted/index_cn.rst

@@ -2,7 +2,8 @@
 ============
 
 ..  toctree::
-  :maxdepth: 2
+  :maxdepth: 1
 
   build_and_install/index_cn.rst
-  basic_usage/index_cn.rst
+
+- `深度学习入门课程 <http://book.paddlepaddle.org/>`_

doc/getstarted/index_en.rst

@@ -2,7 +2,8 @@ GET STARTED
 ============
 
 ..  toctree::
-  :maxdepth: 2
+  :maxdepth: 1
 
   build_and_install/index_en.rst
-  basic_usage/index_en.rst
+
+- `Deep Learning 101 <http://book.paddlepaddle.org/index.en.html>`_

doc/howto/deep_model/rnn/hierarchical_layer_cn.rst

@@ -19,18 +19,18 @@
 
 在 PaddlePaddle中，下面这些Layer能够接受双层序列作为输入，完成相应的计算。
 
-pooling_layer
-==============
+pooling
+========
 
-pooling_layer 的使用示例如下，详细见 :ref:`api_trainer_config_helpers_layers_pooling_layer` 配置API。
+pooling 的使用示例如下，详细见 :ref:`api_v2.layer_pooling` 配置API。
 
 ..	code-block:: bash
 
-        seq_pool = pooling_layer(input=layer,
-                                 pooling_type=AvgPooling(),
+        seq_pool = pooling(input=layer,
+                           pooling_type=pooling.Max(),
                            agg_level=AggregateLevel.EACH_SEQUENCE)
         
-- `pooling_type` 目前支持两种，分别是：MaxPooling()和AvgPooling()。
+- `pooling_type` 目前支持两种，分别是：pooling.Max()和pooling.Avg()。
 
 - `agg_level=AggregateLevel.EACH_TIMESTEP` 时（默认值）：
 
@@ -47,7 +47,7 @@ pooling_layer 的使用示例如下，详细见 :ref:`api_trainer_config_helpers
 last_seq 和 first_seq
 =====================
 
-last_seq 的使用示例如下（ :ref:`api_trainer_config_helpers_layers_first_seq` 类似），详细见 :ref:`api_trainer_config_helpers_layers_last_seq` 配置API。
+last_seq 的使用示例如下（ :ref:`api_v2.layer_first_seq` 类似），详细见 :ref:`api_v2.layer_last_seq` 配置API。
 
 ..	code-block:: bash
 
@@ -65,14 +65,14 @@ last_seq 的使用示例如下（ :ref:`api_trainer_config_helpers_layers_first_
   - 输入：必须是一个双层序列
   - 输出：一个单层序列，其中每个元素是双层序列中每个subseq最后一个（或第一个）元素。
 
-expand_layer
-============
+expand
+======
 
-expand_layer 的使用示例如下，详细见 :ref:`api_trainer_config_helpers_layers_expand_layer` 配置API。
+expand 的使用示例如下，详细见 :ref:`api_v2.layer_expand` 配置API。
 
 ..	code-block:: bash
 
-        expand = expand_layer(input=layer1,
+        ex = expand(input=layer1,
                     expand_as=layer2,
                     expand_level=ExpandLevel.FROM_TIMESTEP)
         

doc/howto/deep_model/rnn/index_cn.rst

@@ -4,7 +4,6 @@ RNN相关模型
 ..  toctree::
   :maxdepth: 1
 
-  rnn_config_cn.rst
   recurrent_group_cn.md
   hierarchical_layer_cn.rst
   hrnn_rnn_api_compare_cn.rst

doc/howto/deep_model/rnn/index_en.rst

 RNN Models
 ==========
-
-..  toctree::
-  :maxdepth: 1
-
-  rnn_config_en.rst

doc/howto/dev/contribute_to_paddle_cn.md

@@ -3,128 +3,217 @@
 我们真诚地感谢您的贡献，欢迎通过 GitHub 的 fork 和 pull request 流程来提交代码。
 
 ## 代码要求
-- 你的代码必须完全遵守 [doxygen](http://www.stack.nl/~dimitri/doxygen/) 的样式。
-- 确保编译器选项 WITH\_STYLE\_CHECK 已打开，并且编译能通过代码样式检查。
+- 代码注释请遵守 [Doxygen](http://www.stack.nl/~dimitri/doxygen/) 的样式。
+- 确保编译器选项 `WITH_STYLE_CHECK` 已打开，并且编译能通过代码样式检查。
 - 所有代码必须具有单元测试。
 - 通过所有单元测试。
 
 以下教程将指导您提交代码。
- 
 ## [Fork](https://help.github.com/articles/fork-a-repo/)
 
-跳转到[PaddlePaddle](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle) GitHub首页，然后单击 `Fork` 按钮。
+跳转到[PaddlePaddle](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle) GitHub首页，然后单击 `Fork` 按钮，生成自己目录下的仓库，比如 <https://github.com/USERNAME/Paddle>。
 
 ## 克隆（Clone）
 
-Paddle 目前使用[git流分支模型](http://nvie.com/posts/a-successful-git-branching-model/)进行开发，测试，发行和维护。
-**develop** 是主分支，其他用户分支是特征分支（feature branches）。
+将远程仓库 clone 到本地：
+
+```bash
+➜  git clone https://github.com/USERNAME/Paddle
+➜  cd Paddle
+```
+
+
+## 创建本地分支
+
+Paddle 目前使用[Git流分支模型](http://nvie.com/posts/a-successful-git-branching-model/)进行开发，测试，发行和维护，具体请参考 [Paddle 分支规范](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/doc/design/releasing_process.md#paddle-分支规范)。
 
-一旦你创建了一个fork，你可以使用你最喜欢的 git 客户端克隆你的仓库（repo）或只是直接在命令行输入：
+所有的 feature 和 bug fix 的开发工作都应该在一个新的分支上完成，一般从 `develop` 分支上创建新分支。
 
-```shell
-# 克隆 fork 到本地
-git clone --branch develop https://github.com/USERNAME/Paddle.git
+使用 `git checkout -b` 创建并切换到新分支。
+
+```bash
+➜  git checkout -b my-cool-stuff
 ```
-如果你的仓库不包含 **develop** 分支，你只需自己创建它。
 
-```shell
-git clone https://github.com/USERNAME/Paddle.git Paddle
-cd Paddle
-git checkout -b develop  # 创建 develop 分支
-git remote add upstream https://github.com/PaddlePaddle/Paddle.git  # 添加 upstream 到 baidu/Paddle
-git pull upstream develop  # 更新 upstream
+值得注意的是，在 checkout 之前，需要保持当前分支目录 clean，否则会把 untracked 的文件也带到新分支上，这可以通过 `git status` 查看。
+
+## 使用 `pre-commit` 钩子
+
+Paddle 开发人员使用 [pre-commit](http://pre-commit.com/) 工具来管理 Git 预提交钩子。 它可以帮助我们格式化源代码（C++，Python），在提交（commit）前自动检查一些基本事宜（如每个文件只有一个 EOL，Git 中不要添加大文件等）。
+
+`pre-commit`测试是 Travis-CI 中单元测试的一部分，不满足钩子的 PR 不能被提交到 Paddle，首先安装并在当前目录运行它：
+
+```bash
+➜  pip install pre-commit
+➜  pre-commit install
 ```
 
-然后你可以通过做一个本地开发分支开始开发
+Paddle 使用 `clang-format` 来调整 C/C++ 源代码格式，请确保 `clang-format` 版本在 3.8 以上。
 
-```shell
-git checkout -b MY_COOL_STUFF_BRANCH
+## 开始开发
+
+在本例中，我删除了 README.md 中的一行，并创建了一个新文件。
+
+通过 `git status` 查看当前状态，这会提示当前目录的一些变化，同时也可以通过 `git diff` 查看文件具体被修改的内容。
+
+```bash
+➜  git status
+On branch test
+Changes not staged for commit:
+  (use "git add <file>..." to update what will be committed)
+  (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)
+
+	modified:   README.md
+
+Untracked files:
+  (use "git add <file>..." to include in what will be committed)
+
+	test
+
+no changes added to commit (use "git add" and/or "git commit -a")
 ```
 
-## 使用 `pre-commit` 钩子
+## 构建和测试
+
+编译 PaddlePaddle 的源码以及生成文档需要多种开发工具。为了方便大家，我们的标准开发流程是把这些工具都装进一个Docker image，称为*开发镜像*，通常名字是 `paddle:dev`。然后所有用 `cmake && make` 的地方（比如IDE配置里）都用 `docker run paddle:dev`来代替。
+
+如要build这个开发镜像，在源码目录树的根目录中运行：
+
+```bash
+➜  docker build -t paddle:dev .
+```
 
-Paddle 开发人员使用 [pre-commit](http://pre-commit.com/) 工具来管理git预提交钩子。 它可以帮助我们格式化源代码（cpp，python），在提交前检查一些基本事宜（每个文件只有一个 EOL 
-，git 中不要添加大文件）。 `pre-commit`测试是 Travis-CI 中单元测试的一部分，不满足钩子
-的 PR 不能提交代码到 Paddle。
+随后可以用这个开发镜像开build PaddlePaddle的源码。比如如果要build一个不依赖GPU，但是支持AVX指令集，并且包括unit tests的PaddlePaddle，可以：
 
-你可以通过 `pip install pre-commit` 安装 [pre-commit](http://pre-commit.com/)，
-目前 Paddle 使用 `clang-format` 来调整C/C++源代码格式。请确保 clang-format 版本在3.8以上。
+```bash
+➜  docker run -v $(pwd):/paddle -e "WITH_GPU=OFF" -e "WITH_AVX=ON" -e "WITH_TEST=ON" paddle:dev
+```
+
+这个过程除了编译PaddlePaddle为 `./build/libpaddle.so`，并且输出一个 `./build/paddle.deb`文件之外，还会输出一个 `build/Dockerfile`。我们只需要运行下面命令把编译好的PaddlePaddle打包成一个*生产镜像*（`paddle:prod`）：
+
+```bash
+➜  docker build -t paddle:prod -f build/Dockerfile .
+```
+
+如果要运行所有的单元测试，可以用如下命令：
+
+```bash
+➜  docker run -it -v $(pwd):/paddle paddle:dev bash -c "cd /paddle/build && ctest"
+```
+
+关于构建和测试的更多信息，请参见[这篇文档](https://github.com/PaddlePaddle/Paddle/blob/develop/doc/getstarted/build_and_install/docker_install_cn.rst)。
+
+## 提交（commit）
 
-然后只需在 Paddle clone 目录中运行 `pre-commit install` 。当你
-提交你的代码时，pre-commit 钩子会检查本地代码是否存在
-不适合提交的东西，等等。
+接下来我们取消对 README.md 文件的改变，然后提交新添加的 test 文件。
 
-## 提交（Commit）
+```bash
+➜  git checkout -- README.md
+➜  git status
+On branch test
+Untracked files:
+  (use "git add <file>..." to include in what will be committed)
 
-提交你的代码：
+	test
 
-```shell
-# 显示工作树状态
-git status
-# 添加修改过的文件
-git add xx
-env EDITOR=vim git commit  # 你可以用 vim/nano/emacs 写下你的注释
+nothing added to commit but untracked files present (use "git add" to track)
+➜  git add test
 ```
-提交信息的第一行是标题，其他行可以添加一些细节（如果有必要的话）。
 
-## 保持 Fork 状态最新
+Git 每次提交代码，都需要写提交说明，这可以让其他人知道这次提交做了哪些改变，这可以通过`git commit` 完成。
+
+```bash
+➜  git commit
+CRLF end-lines remover...............................(no files to check)Skipped
+yapf.................................................(no files to check)Skipped
+Check for added large files..............................................Passed
+Check for merge conflicts................................................Passed
+Check for broken symlinks................................................Passed
+Detect Private Key...................................(no files to check)Skipped
+Fix End of Files.....................................(no files to check)Skipped
+clang-formater.......................................(no files to check)Skipped
+[my-cool-stuff c703c041] add test file
+ 1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
+ create mode 100644 233
+```
+
+## 保持本地仓库最新
+
+在准备发起 Pull Request 之前，需要同步原仓库（<https://github.com/PaddlePaddle/Paddle>）最新的代码。
 
-在拉（pull）你的请求（request）之前，你应该从最新的 PaddlePaddle 同步代码。
-为此，你需要首先添加远程（remote）：
+首先通过 `git remote` 查看当前远程仓库的名字。
 
-```shell
-# 观察当前远程仓库配置
-git remote -v
-# 添加上游（upstream）仓库
-git remote add upstream https://github.com/PaddlePaddle/Paddle.git
-# 验证新的 upstream
-git remote -v
+```bash
+➜  git remote
+origin
+➜  git remote -v
+origin	https://github.com/USERNAME/Paddle (fetch)
+origin	https://github.com/USERNAME/Paddle (push)
 ```
 
-用最新的 upstream 更新你的 fork：
+这里 origin 是我们 clone 的远程仓库的名字，也就是自己用户名下的 Paddle，接下来我们创建一个原始 Paddle 仓库的远程主机，命名为 upstream。
 
-```shell
-git pull --rebase upstream develop
+```bash
+➜  git remote add upstream https://github.com/PaddlePaddle/Paddle
+➜  git remote
+origin
+upstream
 ```
-如果本地没有提交，git 将简单地执行快进。但是，如果你一直在做一些改变（绝大多数情况下不应该），你可能要处理冲突。
 
-现在，你的本地主分支与上游修改的一致并是最新的。
+获取 upstream 的最新代码并更新当前分支。
 
-## 推送（Push）到 GitHub
+```bash
+➜  git fetch upstream
+➜  git pull upstream develop
+```
+
+## Push 到远程仓库
+
+将本地的修改推送到 GitHub 上，也就是 https://github.com/USERNAME/Paddle。
 
-```shell
-# 在 GitHub 上 push 你的仓库
-git push -u origin MY_COOL_STUFF_BRANCH  # 创建远程分支 MY_COOL_STUFF_BRANCH 到 origin.
+```bash
+# 推送到远程仓库 origin 的 my-cool-stuff 分支上
+➜  git push origin my-cool-stuff
 ```
 
-## 拉取请求（Pull Request）
+## 建立 Issue 并完成 Pull Request
+
+建立一个 Issue 描述问题，并记录它的编号。
+
+切换到所建分支，然后点击 `New pull request`。
+
+<img width="295" alt="screen shot 2017-04-26 at 9 09 28 pm" src="https://cloud.githubusercontent.com/assets/11692045/25436054/a6d98c66-2ac4-11e7-9cb1-18dd13150230.png">
 
-转到 GitHub上 你 fork 的页面，选择你的开发分支并单击 **pull request 按钮**。
+选择目标分支：
 
-## 使用最新版本更新你的 pull 请求
+<img width="750" alt="screen shot 2017-04-26 at 9 11 52 pm" src="https://cloud.githubusercontent.com/assets/11692045/25436139/f83b1e6c-2ac4-11e7-8c0e-add499023c46.png">
 
-在代码审查（code review）期间，由于 baidu/Paddle 中新的提交导致你的 pull 请求可能会失效。如果没有冲突，GitHub允许自动更新。 你可以点击 pull request 页面中的“更新分支（Update Branch）”按钮。 但是如果存在代码冲突，你需要手动进行更新。你需要在本地仓库执行如下命令：
+在 PR 的描述说明中，填写 `resolve #Issue编号` 可以在这个 PR 被 merge 后，自动关闭对应的 Issue，具体请见 <https://help.github.com/articles/closing-issues-via-commit-messages/>。
 
-```shell
-git checkout MY_COOL_STUFF_BRANCH
-git pull upstream develop
-# 你可能需要根据git提示解决冲突
-# 创建并测试你的代码
-git push origin MY_COOL_STUFF_BRANCH
+接下来等待 review，如果有需要修改的地方，参照上述步骤更新 origin 中的对应分支即可。
+
+## 删除远程分支
+
+在 PR 被 merge 进主仓库后，我们可以在 PR 的页面删除远程仓库的分支。
+
+<img width="775" alt="screen shot 2017-04-26 at 9 18 24 pm" src="https://cloud.githubusercontent.com/assets/11692045/25436457/e4cdd472-2ac5-11e7-9272-badc76c4a23e.png">
+
+也可以使用 `git push origin :分支名` 删除远程分支，如：
+
+```bash
+➜  git push origin :my-cool-stuff
 ```
-现在你的 Pull Request 是最新的了。
 
-## 修改你的 pull request
+## 删除本地分支
 
-当根据审阅者的意见修改 pull 请求时，请使用“git commit”而不是“git commit --amend”来提交更改，以便审阅者可以看到新的请求和旧的请求之间的区别。
+最后，删除本地分支。
 
-可能的命令是
+```bash
+# 切换到 develop 分支
+➜  git checkout develop 
 
-```shell
-git checkout MY_COOL_STUFF_BRANCH
-git pull upstream develop   # 将本地更新到最新的代码库
-# 可能会发生一些冲突
-# 开始开发吧！
-env EDITOR=vim git commit  # 添加修改日志
-git push origin MY_COOL_STUFF_BRANCH
+# 删除 my-cool-stuff 分支
+➜  git branch -D my-cool-stuff
 ```
+
+至此，我们就完成了一次代码贡献的过程。

doc/howto/usage/k8s/k8s_basis_cn.md

@@ -14,7 +14,7 @@
 
 - [*PersistentVolume*](https://kubernetes.io/docs/user-guide/persistent-volumes/): 和[*PersistentVolumeClaim*](https://kubernetes.io/docs/user-guide/persistent-volumes/#persistentvolumeclaims)结合，将外部的存储服务在Kubernetes中描述成为统一的资源形式，便于存储资源管理和Pod引用。
 
-# 部署Kubernetes集群
+## 部署Kubernetes集群
 
 Kubernetes提供了多种集群部署的方案，本文档内不重复介绍。这里给出集中常见的部署方法：
 
@@ -25,7 +25,7 @@ Kubernetes提供了多种集群部署的方案，本文档内不重复介绍。
 
 可以参考[这个表格](https://kubernetes.io/docs/getting-started-guides/#table-of-solutions)选择适合您的场景的合适方案。
 
-# 选择存储方案
+## 选择存储方案
 
 容器不会保留在运行时生成的数据，job或者应用程序在容器中运行时生成的数据会在容器销毁时消失。为了完成分布式机器学习训练任务，需要有一个外部的存储服务来保存训练所需数据和训练输出。
 常见的可选存储服务包括：
@@ -35,9 +35,9 @@ Kubernetes提供了多种集群部署的方案，本文档内不重复介绍。
 - [*Ceph*](http://docs.ceph.com/docs/master/): 分布式文件系统，支持rbd，POSIX API接口(ceph fs)和对象存储API，参考[这里](https://kubernetes.io/docs/user-guide/volumes/#rbd)。
 - [*MooseFS*](https://moosefs.com/documentation.html): 一个分布式的存储系统。需要先挂载到服务器Node上再通过kubernetes hostPath Volume挂载到容器中。
 
-# 配置kubectl
+## 配置kubectl
 
-## 安装kubectl
+### 安装kubectl
 ```
 # OS X
 curl -LO https://storage.googleapis.com/kubernetes-release/release/$(curl -s https://storage.googleapis.com/kubernetes-release/release/stable.txt)/bin/darwin/amd64/kubectl
@@ -49,7 +49,7 @@ curl -LO https://storage.googleapis.com/kubernetes-release/release/$(curl -s htt
 curl -LO https://storage.googleapis.com/kubernetes-release/release/$(curl -s https://storage.googleapis.com/kubernetes-release/release/stable.txt)/bin/windows/amd64/kubectl.exe
 ```
 
-## 配置kubectl访问你的kubernetes集群
+### 配置kubectl访问你的kubernetes集群
 
 编辑`~/.kube/config`这个配置文件，修改`Master-IP`的地址。如果使用SSL认证，则需要配置`certificate-authority`和`users`中的用户证书。如果是使用非SSL方式访问（比如通过8080端口），也可以去掉这些证书的配置。
 ```

doc/index_cn.rst

@@ -5,7 +5,6 @@ PaddlePaddle 文档
   :maxdepth: 1
 
   getstarted/index_cn.rst
-  tutorials/index_cn.md
   howto/index_cn.rst
   api/index_cn.rst
   faq/index_cn.rst

doc/index_en.rst

@@ -5,8 +5,6 @@ PaddlePaddle Documentation
   :maxdepth: 1
 
   getstarted/index_en.rst
-  tutorials/index_en.md
   howto/index_en.rst
   api/index_en.rst
   about/index_en.rst
- 
\ No newline at end of file

doc_theme/templates/layout.html

@@ -114,10 +114,7 @@
           </ul>
         </div>
         <ul class="site-page-links">
-          <li><a>Home</a></li>
-          <li><a>Get Started</a></li>
-          <li class="active"><a>Documentation</a></li>
-          <li><a>About Us</a></li>
+          <li><a href="/">Home</a></li>
         </ul>
       </div>
       <div class="doc-module">
@@ -137,7 +134,7 @@
           {{ toctree }}
         {% endblock %}
     </nav>
-    {% if toc %}
+    {% if False %}
     <nav class="local-toc">{{ toc }}</nav>
     {% endif %}
     <section class="doc-content-wrap">
@@ -168,7 +165,8 @@
             VERSION:'{{ release|e }}',
             COLLAPSE_INDEX:false,
             FILE_SUFFIX:'{{ '' if no_search_suffix else file_suffix }}',
-            HAS_SOURCE:  {{ has_source|lower }}
+            HAS_SOURCE:  {{ has_source|lower }},
+            SOURCELINK_SUFFIX: ".txt",
         };
     </script>
     {%- for scriptfile in script_files %}

paddle/gserver/tests/sequence_layer_group.conf

@@ -48,8 +48,7 @@ lstm = lstmemory_group(
     size=hidden_dim,
     act=TanhActivation(),
     gate_act=SigmoidActivation(),
-    state_act=TanhActivation(),
-    lstm_layer_attr=ExtraLayerAttribute(error_clipping_threshold=50))
+    state_act=TanhActivation())
 
 lstm_last = last_seq(input=lstm)
 

paddle/gserver/tests/sequence_nest_layer_group.conf

@@ -51,8 +51,7 @@ def lstm_group(lstm_group_input):
         size=hidden_dim,
         act=TanhActivation(),
         gate_act=SigmoidActivation(),
-        state_act=TanhActivation(),
-        lstm_layer_attr=ExtraLayerAttribute(error_clipping_threshold=50))
+        state_act=TanhActivation())
     return lstm_output
 
 

paddle/scripts/travis/docs.sh

@@ -60,6 +60,7 @@ function deploy_docs() {
 
 deploy_docs "master" "." 
 deploy_docs "develop" "./develop/"
+deploy_docs "release/0.10.0" "./release/0.10.0/"
 
 # Check is there anything changed.
 set +e

paddle/trainer/tests/CMakeLists.txt

@@ -17,14 +17,17 @@ add_test(NAME test_Trainer
     WORKING_DIRECTORY ${PROJ_ROOT}/paddle/)
 
 ############### test_TrainerOnePass ##########################
-add_unittest_without_exec(test_TrainerOnePass
+if(WITH_PYTHON)
+  # only run test_TrainerOnePass when PYTHON is enabled, because train one pass
+  # is using PyDataProvider2.
+  add_unittest_without_exec(test_TrainerOnePass
       test_TrainerOnePass.cpp)
-add_test(NAME test_TrainerOnePass
+  add_test(NAME test_TrainerOnePass
     COMMAND  ${PROJ_ROOT}/paddle/.set_python_path.sh -d
           ${PROJ_ROOT}/python/:${PROJ_ROOT}/paddle/trainer/tests
           ${PROJ_ROOT}/paddle/.set_port.sh -p port ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/test_TrainerOnePass
       WORKING_DIRECTORY ${PROJ_ROOT}/paddle/)
-
+endif()
 ################ test_CompareTwoNets ######################
 add_unittest_without_exec(test_CompareTwoNets
     test_CompareTwoNets.cpp)

python/CMakeLists.txt

@@ -24,9 +24,12 @@ add_custom_target(paddle_python ALL DEPENDS
     ${OUTPUT_DIR}/.timestamp)
 
 add_subdirectory(paddle/trainer_config_helpers/tests)
-add_subdirectory(paddle/v2/tests)
-add_subdirectory(paddle/v2/reader/tests)
-add_subdirectory(paddle/v2/plot/tests)
+if (WITH_SWIG_PY)
+  # enable v2 API unittest only when paddle swig api is compiled
+  add_subdirectory(paddle/v2/tests)
+  add_subdirectory(paddle/v2/reader/tests)
+  add_subdirectory(paddle/v2/plot/tests)
+endif()
 
 install(DIRECTORY ${CMAKE_CURRENT_BINARY_DIR}/dist/
     DESTINATION opt/paddle/share/wheels

python/paddle/trainer_config_helpers/attrs.py

@@ -208,12 +208,15 @@ class ExtraLayerAttribute(object):
                  drop_rate=None,
                  device=None):
         self.attr = dict()
-        if isinstance(error_clipping_threshold, float):
-            assert error_clipping_threshold > 0
-            self.attr["error_clipping_threshold"] = error_clipping_threshold
-
-        if isinstance(drop_rate, float):
-            assert drop_rate > 0
+        if error_clipping_threshold is not None:
+            error_clipping_threshold = float(error_clipping_threshold)
+            if error_clipping_threshold < 0:
+                raise ValueError("Error clipping must > 0")
+            self.attr['error_clipping_threshold'] = error_clipping_threshold
+        if drop_rate is not None:
+            drop_rate = float(drop_rate)
+            if drop_rate < 0:
+                raise ValueError("Dropout rate must > 0")
             self.attr["drop_rate"] = drop_rate
 
         if isinstance(device, int):

python/paddle/trainer_config_helpers/layers.py

@@ -84,6 +84,7 @@ __all__ = [
     'GeneratedInput',
     'SubsequenceInput',
     'gru_step_layer',
+    'gru_step_naive_layer',
     'recurrent_layer',
     'BaseGeneratedInput',
     'conv_operator',
@@ -3084,6 +3085,78 @@ def gru_step_layer(input,
         activation=act)
 
 
+@wrap_bias_attr_default()
+@wrap_param_attr_default()
+@wrap_act_default(param_names=['gate_act'], act=SigmoidActivation())
+@wrap_act_default(act=TanhActivation())
+@wrap_name_default('gru_step_naive')
+@layer_support(ERROR_CLIPPING, DROPOUT)
+def gru_step_naive_layer(input,
+                         output_mem,
+                         size=None,
+                         name=None,
+                         act=None,
+                         gate_act=None,
+                         bias_attr=None,
+                         param_attr=None,
+                         layer_attr=None):
+    """
+    GRU Step Layer, but using MixedLayer to generate. It support ERROR_CLIPPING
+    and DROPOUT.
+
+    :param input:
+    :param output_mem:
+    :param size:
+    :param name:
+    :param act:
+    :param gate_act:
+    :param bias_attr:
+    :param param_attr:
+    :param layer_attr:
+    :return:
+    """
+    if input.size % 3 != 0:
+        raise ValueError("GruStep input size must be divided by 3")
+    if size is None:
+        size = input.size / 3
+
+    def __gate__(gate_name, offset):
+        with mixed_layer(
+                name=name + "_" + gate_name,
+                size=size,
+                layer_attr=layer_attr,
+                bias_attr=bias_attr,
+                act=gate_act) as gate:
+            gate += identity_projection(input=input, offset=offset)
+            gate += full_matrix_projection(
+                input=output_mem, param_attr=param_attr)
+        return gate
+
+    update_gate = __gate__("update", 0)
+    reset_gate = __gate__("reset", size)
+
+    with mixed_layer(
+            name=name + "_reset_output", bias_attr=False) as reset_output:
+        reset_output += dotmul_operator(a=output_mem, b=reset_gate)
+
+    with mixed_layer(
+            name=name + "_output_candidate",
+            size=size,
+            layer_attr=layer_attr,
+            bias_attr=bias_attr,
+            act=act) as output_candidate:
+        output_candidate += identity_projection(input=input, offset=2 * size)
+        output_candidate += full_matrix_projection(
+            input=reset_output, param_attr=param_attr)
+
+    with mixed_layer(name=name) as output:
+        output += identity_projection(output_mem)
+        output += dotmul_operator(a=output_mem, b=update_gate, scale=-1.0)
+        output += dotmul_operator(a=output_candidate, b=update_gate)
+
+    return output
+
+
 @wrap_name_default()
 @layer_support()
 def get_output_layer(input, arg_name, name=None, layer_attr=None):

python/paddle/trainer_config_helpers/networks.py

@@ -825,7 +825,8 @@ def gru_unit(input,
              gru_param_attr=None,
              act=None,
              gate_act=None,
-             gru_layer_attr=None):
+             gru_layer_attr=None,
+             naive=False):
     """
     Define calculations that a gated recurrent unit performs in a single time
     step. This function itself is not a recurrent layer, so that it can not be
@@ -857,7 +858,12 @@ def gru_unit(input,
 
     out_mem = memory(name=name, size=size)
 
-    gru_out = gru_step_layer(
+    if naive:
+        __step__ = gru_step_naive_layer
+    else:
+        __step__ = gru_step_layer
+
+    gru_out = __step__(
         name=name,
         input=input,
         output_mem=out_mem,
@@ -879,7 +885,8 @@ def gru_group(input,
               gru_param_attr=None,
               act=None,
               gate_act=None,
-              gru_layer_attr=None):
+              gru_layer_attr=None,
+              naive=False):
     """
     gru_group is a recurrent layer group version of Gated Recurrent Unit. It
     does exactly the same calculation as the grumemory layer does. A promising
@@ -928,7 +935,8 @@ def gru_group(input,
             gru_param_attr=gru_param_attr,
             act=act,
             gate_act=gate_act,
-            gru_layer_attr=gru_layer_attr)
+            gru_layer_attr=gru_layer_attr,
+            naive=naive)
 
     return recurrent_group(
         name='%s_recurrent_group' % name,
@@ -949,7 +957,8 @@ def simple_gru(input,
                gru_param_attr=None,
                act=None,
                gate_act=None,
-               gru_layer_attr=None):
+               gru_layer_attr=None,
+               naive=False):
     """
     You maybe see gru_step_layer, grumemory in layers.py, gru_unit, gru_group,
     simple_gru in network.py. The reason why there are so many interfaces is
@@ -1018,7 +1027,8 @@ def simple_gru(input,
         gru_param_attr=gru_param_attr,
         act=act,
         gate_act=gate_act,
-        gru_layer_attr=gru_layer_attr)
+        gru_layer_attr=gru_layer_attr,
+        naive=naive)
 
 
 @wrap_name_default('simple_gru2')

python/paddle/trainer_config_helpers/tests/configs/protostr/projections.protostr

@@ -320,6 +320,7 @@ layers {
     }
   }
   drop_rate: 0.5
+  error_clipping_threshold: 40.0
 }
 parameters {
   name: "___embedding_0__.w0"

python/paddle/v2/layer.py

@@ -356,6 +356,9 @@ def mixed(size=0,
     return MixedLayerV2(size, input, name, act, bias_attr, layer_attr)
 
 
+mixed.__doc__ = conf_helps.mixed_layer.__doc__
+
+
 class RecurrentLayerInput(Layer):
     def __init__(self, recurrent_name, index, parent_layers):
         parents_len = len(parent_layers)
@@ -404,6 +407,8 @@ data.__name__ = 'data'
 AggregateLevel = conf_helps.layers.AggregateLevel
 ExpandLevel = conf_helps.layers.ExpandLevel
 memory = MemoryV2
+memory.__name__ = 'memory'
+memory.__doc__ = conf_helps.memory.__doc__
 
 
 def __layer_name_mapping__(inname):
@@ -512,6 +517,9 @@ def recurrent_group(step, input, name=None):
         return retv
 
 
+recurrent_group.__doc__ = conf_helps.recurrent_group.__doc__
+
+
 @wrap_name_default()
 def beam_search(step,
                 input,
@@ -579,6 +587,8 @@ def beam_search(step,
     return tmp
 
 
+beam_search.__doc__ = conf_helps.beam_search.__doc__
+
 __projection_names__ = filter(lambda x: x.endswith('_projection'),
                               dir(conf_helps))